RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490738.5

CAMTA1-213, Transcript of calmodulin binding transcription activator 1, human

TSL 2

Gene CAMTA1, Length 538 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CAMTA1-213	ENST00000490738	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		42.93	■■■■■ 4.46
CAMTA1-213	ENST00000490738	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		42.92	■■■■■ 4.46
CAMTA1-213	ENST00000490738	TSPY4	P0CV99	314 aa		42.92	■■■■■ 4.46
CAMTA1-213	ENST00000490738	TSPY10	P0CW01	314 aa		42.92	■■■■■ 4.46
CAMTA1-213	ENST00000490738	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	42.92	■■■■■ 4.46
CAMTA1-213	ENST00000490738	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	42.92	■■■■■ 4.46
CAMTA1-213	ENST00000490738	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		42.9	■■■■■ 4.46
CAMTA1-213	ENST00000490738	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	42.89	■■■■■ 4.46
CAMTA1-213	ENST00000490738	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	42.89	■■■■■ 4.46
CAMTA1-213	ENST00000490738	PZP	P20742	1482 aa		42.87	■■■■■ 4.45
CAMTA1-213	ENST00000490738	MAP3K1	Q13233	1512 aa		42.87	■■■■■ 4.45
CAMTA1-213	ENST00000490738	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		42.87	■■■■■ 4.45
CAMTA1-213	ENST00000490738	TNR	Q92752	1358 aa		42.85	■■■■■ 4.45
CAMTA1-213	ENST00000490738	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		42.8	■■■■■ 4.44
CAMTA1-213	ENST00000490738	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		42.76	■■■■■ 4.44
CAMTA1-213	ENST00000490738	MIA2	Q96PC5	1412 aa		42.76	■■■■■ 4.44
CAMTA1-213	ENST00000490738	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	42.71	■■■■■ 4.43
CAMTA1-213	ENST00000490738	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		42.67	■■■■■ 4.42
CAMTA1-213	ENST00000490738	NLRP1	Q9C000	1473 aa		42.65	■■■■■ 4.42
CAMTA1-213	ENST00000490738	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	42.65	■■■■■ 4.42
CAMTA1-213	ENST00000490738	ABCC3	O15438	1527 aa		42.65	■■■■■ 4.42
CAMTA1-213	ENST00000490738	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	42.64	■■■■■ 4.42
CAMTA1-213	ENST00000490738	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	42.64	■■■■■ 4.42
CAMTA1-213	ENST00000490738	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		42.63	■■■■■ 4.41
CAMTA1-213	ENST00000490738	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	42.6	■■■■■ 4.41
CAMTA1-213	ENST00000490738	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		42.6	■■■■■ 4.41
CAMTA1-213	ENST00000490738	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	42.6	■■■■■ 4.41
CAMTA1-213	ENST00000490738	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		42.59	■■■■■ 4.41
CAMTA1-213	ENST00000490738	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		42.59	■■■■■ 4.41
CAMTA1-213	ENST00000490738	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		42.57	■■■■■ 4.41
CAMTA1-213	ENST00000490738	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		42.55	■■■■■ 4.4
CAMTA1-213	ENST00000490738	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		42.54	■■■■■ 4.4
CAMTA1-213	ENST00000490738	ABCC5	O15440	1437 aa		42.5	■■■■■ 4.39
CAMTA1-213	ENST00000490738	ERVK-7	P63135	1459 aa		42.49	■■■■■ 4.39
CAMTA1-213	ENST00000490738	ILDR2	Q71H61	639 aa		42.49	■■■■■ 4.39
CAMTA1-213	ENST00000490738	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		42.49	■■■■■ 4.39
CAMTA1-213	ENST00000490738	MED14	O60244	1454 aa		42.48	■■■■■ 4.39
CAMTA1-213	ENST00000490738	DEPDC5	O75140	1603 aa		42.46	■■■■■ 4.39
CAMTA1-213	ENST00000490738	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		42.46	■■■■■ 4.39
CAMTA1-213	ENST00000490738	APLP2	Q06481	763 aa		42.46	■■■■■ 4.39
CAMTA1-213	ENST00000490738	KIF15	Q9NS87	1388 aa		42.46	■■■■■ 4.39
CAMTA1-213	ENST00000490738	CEP152	O94986	1710 aa		42.46	■■■■■ 4.39
CAMTA1-213	ENST00000490738	CPS1	P31327	1500 aa		42.46	■■■■■ 4.39
CAMTA1-213	ENST00000490738	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	42.45	■■■■■ 4.39
CAMTA1-213	ENST00000490738	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		42.44	■■■■■ 4.39
CAMTA1-213	ENST00000490738	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		42.43	■■■■■ 4.38
CAMTA1-213	ENST00000490738	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		42.41	■■■■■ 4.38
CAMTA1-213	ENST00000490738	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		42.39	■■■■■ 4.38
CAMTA1-213	ENST00000490738	DAPK1	P53355	1430 aa		42.38	■■■■■ 4.38
CAMTA1-213	ENST00000490738	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	42.38	■■■■■ 4.37
CAMTA1-213	ENST00000490738	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		42.37	■■■■■ 4.37
CAMTA1-213	ENST00000490738	IQGAP1	P46940	1657 aa		42.34	■■■■■ 4.37
CAMTA1-213	ENST00000490738	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		42.33	■■■■■ 4.37
CAMTA1-213	ENST00000490738	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		42.3	■■■■■ 4.36
CAMTA1-213	ENST00000490738	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	42.3	■■■■■ 4.36
CAMTA1-213	ENST00000490738	TOM1	O60784	492 aa		42.26	■■■■■ 4.36
CAMTA1-213	ENST00000490738	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	42.26	■■■■■ 4.36
CAMTA1-213	ENST00000490738	PIP4K2B	P78356	416 aa		42.24	■■■■■ 4.35
CAMTA1-213	ENST00000490738	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		42.23	■■■■■ 4.35
CAMTA1-213	ENST00000490738	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	42.22	■■■■■ 4.35
CAMTA1-213	ENST00000490738	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		42.2	■■■■■ 4.35
CAMTA1-213	ENST00000490738	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		42.19	■■■■■ 4.35
CAMTA1-213	ENST00000490738	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		42.19	■■■■■ 4.34
CAMTA1-213	ENST00000490738	SOCS7	O14512	581 aa		42.18	■■■■■ 4.34
CAMTA1-213	ENST00000490738	HSPA1L	P34931	641 aa		42.18	■■■■■ 4.34
CAMTA1-213	ENST00000490738	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	42.17	■■■■■ 4.34
CAMTA1-213	ENST00000490738	SLIT1	O75093	1534 aa		42.17	■■■■■ 4.34
CAMTA1-213	ENST00000490738	LTK	P29376	864 aa		42.17	■■■■■ 4.34
CAMTA1-213	ENST00000490738	KANK1	Q14678	1352 aa		42.16	■■■■■ 4.34
CAMTA1-213	ENST00000490738	ALK	Q9UM73	1620 aa		42.16	■■■■■ 4.34
CAMTA1-213	ENST00000490738	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		42.14	■■■■■ 4.34
CAMTA1-213	ENST00000490738	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		42.13	■■■■■ 4.33
CAMTA1-213	ENST00000490738	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		42.12	■■■■■ 4.33
CAMTA1-213	ENST00000490738	PIK3C2B	O00750	1634 aa		42.1	■■■■■ 4.33
CAMTA1-213	ENST00000490738	SYNM	O15061	1565 aa		42.06	■■■■■ 4.32
CAMTA1-213	ENST00000490738	ADGRL2	O95490	1459 aa		42.06	■■■■■ 4.32
CAMTA1-213	ENST00000490738	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		42.02	■■■■■ 4.32
CAMTA1-213	ENST00000490738	IDI1	Q13907	227 aa		42.02	■■■■■ 4.32
CAMTA1-213	ENST00000490738	EID1	Q9Y6B2	187 aa		42.02	■■■■■ 4.32
CAMTA1-213	ENST00000490738	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	42	■■■■■ 4.31
CAMTA1-213	ENST00000490738	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		41.98	■■■■■ 4.31
CAMTA1-213	ENST00000490738	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		41.98	■■■■■ 4.31
CAMTA1-213	ENST00000490738	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	41.96	■■■■■ 4.31
CAMTA1-213	ENST00000490738	NOS1	P29475	1434 aa		41.96	■■■■■ 4.31
CAMTA1-213	ENST00000490738	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	41.92	■■■■■ 4.3
CAMTA1-213	ENST00000490738	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		41.91	■■■■■ 4.3
CAMTA1-213	ENST00000490738	ADGRB3	O60242	1522 aa		41.84	■■■■■ 4.29
CAMTA1-213	ENST00000490738	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	41.83	■■■■■ 4.29
CAMTA1-213	ENST00000490738	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		41.83	■■■■■ 4.29
CAMTA1-213	ENST00000490738	TET3	O43151	1660 aa		41.82	■■■■■ 4.29
CAMTA1-213	ENST00000490738	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	41.8	■■■■■ 4.28
CAMTA1-213	ENST00000490738	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	41.79	■■■■■ 4.28
CAMTA1-213	ENST00000490738	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		41.77	■■■■■ 4.28
CAMTA1-213	ENST00000490738	KCNA6	P17658	529 aa		41.73	■■■■■ 4.27
CAMTA1-213	ENST00000490738	TMEM94	Q12767	1356 aa		41.7	■■■■■ 4.27
CAMTA1-213	ENST00000490738	UNC13B	O14795	1591 aa		41.69	■■■■■ 4.26
CAMTA1-213	ENST00000490738	ZFYVE9	O95405	1425 aa		41.66	■■■■■ 4.26
CAMTA1-213	ENST00000490738	ROCK1	Q13464	1354 aa		41.65	■■■■■ 4.26
CAMTA1-213	ENST00000490738	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		41.64	■■■■■ 4.26
CAMTA1-213	ENST00000490738	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	41.62	■■■■■ 4.25

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