RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490566.1

TNS1-217, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 2

Gene TNS1, Length 1,652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-217ENST00000490566 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TNS1-217ENST00000490566 PLCD3Q8N3E9 789 aa14.91□□□□□ -0.02
TNS1-217ENST00000490566 ARAP3Q8WWN8 1544 aa14.91□□□□□ -0.02
TNS1-217ENST00000490566 ABCC1P33527 1531 aa14.9□□□□□ -0.02
TNS1-217ENST00000490566 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa14.9□□□□□ -0.02
TNS1-217ENST00000490566 ABCA9Q8IUA7 1624 aa14.89□□□□□ -0.03
TNS1-217ENST00000490566 UNC13BO14795 1591 aa14.89□□□□□ -0.03
TNS1-217ENST00000490566 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa14.89□□□□□ -0.03
TNS1-217ENST00000490566 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
TNS1-217ENST00000490566 MIER1Q8N108 512 aa14.88□□□□□ -0.03
TNS1-217ENST00000490566 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa14.88□□□□□ -0.03
TNS1-217ENST00000490566 WDR7Q9Y4E6 1490 aa14.87□□□□□ -0.03
TNS1-217ENST00000490566 PLCH2O75038 1416 aa14.87□□□□□ -0.03
TNS1-217ENST00000490566 KIF15Q9NS87 1388 aa14.86□□□□□ -0.03
TNS1-217ENST00000490566 TEX14Q8IWB6 1497 aa14.86□□□□□ -0.03
TNS1-217ENST00000490566 SLC24A1O60721 1099 aa14.86□□□□□ -0.03
TNS1-217ENST00000490566 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP14.85□□□□□ -0.03
TNS1-217ENST00000490566 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa14.85□□□□□ -0.03
TNS1-217ENST00000490566 TSPY4P0CV99 314 aa14.84□□□□□ -0.03
TNS1-217ENST00000490566 TSPY10P0CW01 314 aa14.84□□□□□ -0.03
TNS1-217ENST00000490566 RSPH4AQ5TD94 716 aa14.84□□□□□ -0.03
TNS1-217ENST00000490566 SPOCK2Q92563 424 aa14.82□□□□□ -0.04
TNS1-217ENST00000490566 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
TNS1-217ENST00000490566 IQGAP3Q86VI3 1631 aa14.82□□□□□ -0.04
TNS1-217ENST00000490566 DUOX2Q9NRD8 1548 aa14.8□□□□□ -0.04
TNS1-217ENST00000490566 KCNH8Q96L42 1107 aa14.8□□□□□ -0.04
TNS1-217ENST00000490566 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
TNS1-217ENST00000490566 FAM135AQ9P2D6 1515 aa14.79□□□□□ -0.04
TNS1-217ENST00000490566 MAGI2Q86UL8 1455 aa14.78□□□□□ -0.04
TNS1-217ENST00000490566 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
TNS1-217ENST00000490566 PKD2Q13563 968 aa14.78□□□□□ -0.04
TNS1-217ENST00000490566 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa14.78□□□□□ -0.04
TNS1-217ENST00000490566 ASXL2Q76L83 1435 aa14.77□□□□□ -0.04
TNS1-217ENST00000490566 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa14.76□□□□□ -0.05
TNS1-217ENST00000490566 NUP155O75694 1391 aa14.76□□□□□ -0.05
TNS1-217ENST00000490566 CFAP74Q9C0B2 1584 aa14.76□□□□□ -0.05
TNS1-217ENST00000490566 AKT1S1Q96B36 256 aa14.75□□□□□ -0.05
TNS1-217ENST00000490566 ERBINQ96RT1 1412 aa14.75□□□□□ -0.05
TNS1-217ENST00000490566 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa14.75□□□□□ -0.05
TNS1-217ENST00000490566 L3MBTL2Q969R5 705 aa14.74□□□□□ -0.05
TNS1-217ENST00000490566 DEPDC5O75140 1603 aa14.73□□□□□ -0.05
TNS1-217ENST00000490566 FANCAO15360 1455 aa14.73□□□□□ -0.05
TNS1-217ENST00000490566 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa14.72□□□□□ -0.05
TNS1-217ENST00000490566 ATP7AQ04656 1500 aa14.71□□□□□ -0.05
TNS1-217ENST00000490566 PLEKHG5O94827 1062 aa14.71□□□□□ -0.06
TNS1-217ENST00000490566 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TNS1-217ENST00000490566 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TNS1-217ENST00000490566 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TNS1-217ENST00000490566 ADGRL1O94910 1474 aa14.69□□□□□ -0.06
TNS1-217ENST00000490566 CLEC11AQ9Y240 323 aa14.68□□□□□ -0.06
TNS1-217ENST00000490566 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa14.67□□□□□ -0.06
TNS1-217ENST00000490566 E9PCH4 1651 aa14.67□□□□□ -0.06
TNS1-217ENST00000490566 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TNS1-217ENST00000490566 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa14.66□□□□□ -0.06
TNS1-217ENST00000490566 TET3O43151 1660 aa14.65□□□□□ -0.06
TNS1-217ENST00000490566 NBPF8Q3BBV2 869 aa14.65□□□□□ -0.06
TNS1-217ENST00000490566 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TNS1-217ENST00000490566 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa14.65□□□□□ -0.06
TNS1-217ENST00000490566 KDM5CP41229 1560 aa14.65□□□□□ -0.06
TNS1-217ENST00000490566 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TNS1-217ENST00000490566 RALGAPBQ86X10 1494 aa14.64□□□□□ -0.07
TNS1-217ENST00000490566 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa14.64□□□□□ -0.07
TNS1-217ENST00000490566 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa14.64□□□□□ -0.07
TNS1-217ENST00000490566 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa14.64□□□□□ -0.07
TNS1-217ENST00000490566 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TNS1-217ENST00000490566 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TNS1-217ENST00000490566 VWDEQ8N2E2 1590 aa14.63□□□□□ -0.07
TNS1-217ENST00000490566 CEP152O94986 1710 aa14.63□□□□□ -0.07
TNS1-217ENST00000490566 ATP10AO60312 1499 aa14.63□□□□□ -0.07
TNS1-217ENST00000490566 MROH1Q8NDA8 1641 aa14.63□□□□□ -0.07
TNS1-217ENST00000490566 SCAPERQ9BY12 1400 aa14.62□□□□□ -0.07
TNS1-217ENST00000490566 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TNS1-217ENST00000490566 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa14.62□□□□□ -0.07
TNS1-217ENST00000490566 PLA2R1Q13018 1463 aa14.62□□□□□ -0.07
TNS1-217ENST00000490566 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TNS1-217ENST00000490566 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa14.62□□□□□ -0.07
TNS1-217ENST00000490566 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
TNS1-217ENST00000490566 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.071e-8■■■■■ 49.3
TNS1-217ENST00000490566 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa14.61□□□□□ -0.07
TNS1-217ENST00000490566 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TNS1-217ENST00000490566 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TNS1-217ENST00000490566 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TNS1-217ENST00000490566 BCORL1Q5H9F3 1711 aa14.6□□□□□ -0.07
TNS1-217ENST00000490566 HECW2Q9P2P5 1572 aa14.6□□□□□ -0.07
TNS1-217ENST00000490566 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa14.59□□□□□ -0.07
TNS1-217ENST00000490566 CCDC144AA2RUR9 1427 aa14.59□□□□□ -0.07
TNS1-217ENST00000490566 LAMC1P11047 1609 aa14.58□□□□□ -0.07
TNS1-217ENST00000490566 AFAP1Q8N556 730 aa14.58□□□□□ -0.07
TNS1-217ENST00000490566 CD109Q6YHK3 1445 aa14.58□□□□□ -0.08
TNS1-217ENST00000490566 TRPM2O94759 1503 aa14.58□□□□□ -0.08
TNS1-217ENST00000490566 PRR29P0C7W0 189 aa14.58□□□□□ -0.08
TNS1-217ENST00000490566 POGZQ7Z3K3 1410 aa14.57□□□□□ -0.08
TNS1-217ENST00000490566 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
TNS1-217ENST00000490566 GLI2P10070 1586 aa14.57□□□□□ -0.08
TNS1-217ENST00000490566 RICTORQ6R327 1708 aa14.57□□□□□ -0.08
TNS1-217ENST00000490566 WASHC2AQ641Q2 1341 aa14.56□□□□□ -0.08
TNS1-217ENST00000490566 ABCA6Q8N139 1617 aa14.56□□□□□ -0.08
TNS1-217ENST00000490566 CLTCL1P53675 1640 aa14.55□□□□□ -0.08
TNS1-217ENST00000490566 NEO1Q92859 1461 aa14.55□□□□□ -0.08
TNS1-217ENST00000490566 A2MP01023 1474 aa14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms