RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490447.6

YIPF3-208, Transcript of Yip1 domain family member 3, humanhuman

TSL 2

Gene YIPF3, Length 1,321 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF3-208ENST00000490447 KDM5DQ9BY66 1539 aa28.16■■■□□ 2.1
YIPF3-208ENST00000490447 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.15■■■□□ 2.1
YIPF3-208ENST00000490447 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.14■■■□□ 2.1
YIPF3-208ENST00000490447 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.14■■■□□ 2.1
YIPF3-208ENST00000490447 A2ML1A8K2U0 1454 aa28.13■■■□□ 2.09
YIPF3-208ENST00000490447 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
YIPF3-208ENST00000490447 TNRQ92752 1358 aa28.1■■■□□ 2.09
YIPF3-208ENST00000490447 PZPP20742 1482 aa28.1■■■□□ 2.09
YIPF3-208ENST00000490447 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
YIPF3-208ENST00000490447 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
YIPF3-208ENST00000490447 MAP3K1Q13233 1512 aa28.07■■■□□ 2.08
YIPF3-208ENST00000490447 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
YIPF3-208ENST00000490447 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
YIPF3-208ENST00000490447 MIA2Q96PC5 1412 aa28.03■■■□□ 2.08
YIPF3-208ENST00000490447 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.02■■■□□ 2.08
YIPF3-208ENST00000490447 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.02■■■□□ 2.08
YIPF3-208ENST00000490447 DISP3Q9P2K9 1392 aa27.99■■■□□ 2.07
YIPF3-208ENST00000490447 APLP2Q06481 763 aa27.97■■■□□ 2.07
YIPF3-208ENST00000490447 NLRP1Q9C000 1473 aa27.97■■■□□ 2.07
YIPF3-208ENST00000490447 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
YIPF3-208ENST00000490447 UBAP1LF5GYI3 381 aa27.95■■■□□ 2.07
YIPF3-208ENST00000490447 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.07
YIPF3-208ENST00000490447 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
YIPF3-208ENST00000490447 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
YIPF3-208ENST00000490447 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.94■■■□□ 2.06
YIPF3-208ENST00000490447 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
YIPF3-208ENST00000490447 ANKLE2Q86XL3 938 aa27.93■■■□□ 2.06
YIPF3-208ENST00000490447 UGGT1Q9NYU2 1555 aa27.93■■■□□ 2.06
YIPF3-208ENST00000490447 ABCC3O15438 1527 aa27.92■■■□□ 2.06
YIPF3-208ENST00000490447 NEURL4Q96JN8 1562 aa27.9■■■□□ 2.06
YIPF3-208ENST00000490447 DUOX2Q9NRD8 1548 aa27.89■■■□□ 2.06
YIPF3-208ENST00000490447 CPS1P31327 1500 aa27.85■■■□□ 2.05
YIPF3-208ENST00000490447 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa27.85■■■□□ 2.05
YIPF3-208ENST00000490447 KIF15Q9NS87 1388 aa27.85■■■□□ 2.05
YIPF3-208ENST00000490447 ERVK-7P63135 1459 aa27.84■■■□□ 2.05
YIPF3-208ENST00000490447 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.84■■■□□ 2.05
YIPF3-208ENST00000490447 MROH1Q8NDA8 1641 aa27.83■■■□□ 2.05
YIPF3-208ENST00000490447 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
YIPF3-208ENST00000490447 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.82■■■□□ 2.04
YIPF3-208ENST00000490447 ERBINQ96RT1 1412 aa27.81■■■□□ 2.04
YIPF3-208ENST00000490447 DEPDC5O75140 1603 aa27.81■■■□□ 2.04
YIPF3-208ENST00000490447 ABCC5O15440 1437 aa27.8■■■□□ 2.04
YIPF3-208ENST00000490447 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.8■■■□□ 2.04
YIPF3-208ENST00000490447 MED14O60244 1454 aa27.8■■■□□ 2.04
YIPF3-208ENST00000490447 CROCC2H7BZ55 1655 aa27.8■■■□□ 2.04
YIPF3-208ENST00000490447 CEP152O94986 1710 aa27.8■■■□□ 2.04
YIPF3-208ENST00000490447 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
YIPF3-208ENST00000490447 DAPK1P53355 1430 aa27.77■■■□□ 2.04
YIPF3-208ENST00000490447 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.77■■■□□ 2.04
YIPF3-208ENST00000490447 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.04
YIPF3-208ENST00000490447 TOM1O60784 492 aa27.76■■■□□ 2.03
YIPF3-208ENST00000490447 ILDR2Q71H61 639 aa27.76■■■□□ 2.03
YIPF3-208ENST00000490447 VWDEQ8N2E2 1590 aa27.75■■■□□ 2.03
YIPF3-208ENST00000490447 IQGAP1P46940 1657 aa27.75■■■□□ 2.03
YIPF3-208ENST00000490447 PIP4K2BP78356 416 aa27.73■■■□□ 2.03
YIPF3-208ENST00000490447 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP27.73■■■□□ 2.031e-6■■□□□ 12.8
YIPF3-208ENST00000490447 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa27.72■■■□□ 2.03
YIPF3-208ENST00000490447 KANK1Q14678 1352 aa27.72■■■□□ 2.03
YIPF3-208ENST00000490447 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.7■■■□□ 2.02
YIPF3-208ENST00000490447 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.69■■■□□ 2.02
YIPF3-208ENST00000490447 UBR1Q8IWV7 1749 aa27.68■■■□□ 2.02
YIPF3-208ENST00000490447 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
YIPF3-208ENST00000490447 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
YIPF3-208ENST00000490447 SOCS7O14512 581 aa27.65■■■□□ 2.02
YIPF3-208ENST00000490447 HSPA1LP34931 641 aa27.63■■■□□ 2.01
YIPF3-208ENST00000490447 STAG3Q9UJ98 1225 aa27.63■■■□□ 2.01
YIPF3-208ENST00000490447 EID1Q9Y6B2 187 aa27.63■■■□□ 2.01
YIPF3-208ENST00000490447 TXNDC2Q86VQ3 553 aa27.62■■■□□ 2.01
YIPF3-208ENST00000490447 SLIT1O75093 1534 aa27.61■■■□□ 2.01
YIPF3-208ENST00000490447 ARHGAP23Q9P227 1491 aa27.6■■■□□ 2.01
YIPF3-208ENST00000490447 SYNMO15061 1565 aa27.59■■■□□ 2.01
YIPF3-208ENST00000490447 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
YIPF3-208ENST00000490447 LMTK2Q8IWU2 1503 aa27.58■■■□□ 2.01
YIPF3-208ENST00000490447 LRRC7Q96NW7 1537 aa27.58■■■□□ 2.01
YIPF3-208ENST00000490447 LTKP29376 864 aa27.58■■■□□ 2.01
YIPF3-208ENST00000490447 PIK3C2BO00750 1634 aa27.56■■■□□ 2
YIPF3-208ENST00000490447 ADGRL2O95490 1459 aa27.54■■■□□ 2
YIPF3-208ENST00000490447 STRCP1A6NGW2 1772 aa27.54■■■□□ 2
YIPF3-208ENST00000490447 TMEM2Q9UHN6 1383 aa27.54■■■□□ 2
YIPF3-208ENST00000490447 EFCAB6Q5THR3 1501 aa27.51■■■□□ 2
YIPF3-208ENST00000490447 IDI1Q13907 227 aa27.5■■□□□ 1.99
YIPF3-208ENST00000490447 ALKQ9UM73 1620 aa27.49■■□□□ 1.99
YIPF3-208ENST00000490447 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
YIPF3-208ENST00000490447 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa27.47■■□□□ 1.99
YIPF3-208ENST00000490447 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
YIPF3-208ENST00000490447 NOS1P29475 1434 aa27.46■■□□□ 1.99
YIPF3-208ENST00000490447 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
YIPF3-208ENST00000490447 SLC52A1Q9NWF4 448 aa27.44■■□□□ 1.98
YIPF3-208ENST00000490447 ADGRB3O60242 1522 aa27.43■■□□□ 1.98
YIPF3-208ENST00000490447 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
YIPF3-208ENST00000490447 BCANQ96GW7 911 aa27.39■■□□□ 1.97
YIPF3-208ENST00000490447 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.97
YIPF3-208ENST00000490447 SLC26A8Q96RN1 970 aa27.37■■□□□ 1.97
YIPF3-208ENST00000490447 KCNA6P17658 529 aa27.35■■□□□ 1.97
YIPF3-208ENST00000490447 TET3O43151 1660 aa27.34■■□□□ 1.97
YIPF3-208ENST00000490447 TMEM94Q12767 1356 aa27.33■■□□□ 1.97
YIPF3-208ENST00000490447 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
YIPF3-208ENST00000490447 HDGFP51858 240 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
YIPF3-208ENST00000490447 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
YIPF3-208ENST00000490447 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 209.4 ms