RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488157.5

NISCH-210, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 590 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-210ENST00000488157 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP18.55■□□□□ 0.56
NISCH-210ENST00000488157 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
NISCH-210ENST00000488157 ZMYM3Q14202 1370 aa18.55■□□□□ 0.56
NISCH-210ENST00000488157 MROH1Q8NDA8 1641 aa18.54■□□□□ 0.56
NISCH-210ENST00000488157 CNTLNQ9NXG0 1405 aa18.54■□□□□ 0.56
NISCH-210ENST00000488157 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
NISCH-210ENST00000488157 MROH2AA6NES4 1674 aa18.53■□□□□ 0.56
NISCH-210ENST00000488157 ERBINQ96RT1 1412 aa18.52■□□□□ 0.56
NISCH-210ENST00000488157 PPP6R1Q9UPN7 881 aa18.51■□□□□ 0.55
NISCH-210ENST00000488157 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa18.5■□□□□ 0.55
NISCH-210ENST00000488157 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP18.49■□□□□ 0.554e-6■□□□□ 8.4
NISCH-210ENST00000488157 LMTK3Q96Q04 1460 aa18.49■□□□□ 0.55
NISCH-210ENST00000488157 KDM5DQ9BY66 1539 aa18.49■□□□□ 0.55
NISCH-210ENST00000488157 CEP152O94986 1710 aa18.48■□□□□ 0.55
NISCH-210ENST00000488157 ROCK1Q13464 1354 aa18.47■□□□□ 0.55
NISCH-210ENST00000488157 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
NISCH-210ENST00000488157 ABCC3O15438 1527 aa18.47■□□□□ 0.55
NISCH-210ENST00000488157 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa18.47■□□□□ 0.55
NISCH-210ENST00000488157 DEPDC5O75140 1603 aa18.46■□□□□ 0.55
NISCH-210ENST00000488157 HSPA2P54652 639 aa18.46■□□□□ 0.55
NISCH-210ENST00000488157 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
NISCH-210ENST00000488157 PREX1Q8TCU6 1659 aa18.44■□□□□ 0.54
NISCH-210ENST00000488157 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
NISCH-210ENST00000488157 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
NISCH-210ENST00000488157 FAM135AQ9P2D6 1515 aa18.42■□□□□ 0.54
NISCH-210ENST00000488157 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
NISCH-210ENST00000488157 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa18.41■□□□□ 0.54
NISCH-210ENST00000488157 NPATQ14207 1427 aa18.4■□□□□ 0.54
NISCH-210ENST00000488157 PZPP20742 1482 aa18.4■□□□□ 0.54
NISCH-210ENST00000488157 VWDEQ8N2E2 1590 aa18.4■□□□□ 0.54
NISCH-210ENST00000488157 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa18.39■□□□□ 0.53
NISCH-210ENST00000488157 KANK1Q14678 1352 aa18.37■□□□□ 0.53
NISCH-210ENST00000488157 NAIPQ13075 1403 aa18.37■□□□□ 0.53
NISCH-210ENST00000488157 UNC13BO14795 1591 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-210ENST00000488157 MYO3AQ8NEV4 1616 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-210ENST00000488157 TNRQ92752 1358 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-210ENST00000488157 LMTK2Q8IWU2 1503 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-210ENST00000488157 GCC2Q8IWJ2 1684 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-210ENST00000488157 ERVK-7P63135 1459 aa18.33■□□□□ 0.52
NISCH-210ENST00000488157 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa18.32■□□□□ 0.52
NISCH-210ENST00000488157 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa18.32■□□□□ 0.52
NISCH-210ENST00000488157 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
NISCH-210ENST00000488157 HFM1A2PYH4 1435 aa18.31■□□□□ 0.52
NISCH-210ENST00000488157 NUP155O75694 1391 aa18.3■□□□□ 0.52
NISCH-210ENST00000488157 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
NISCH-210ENST00000488157 EFCAB6Q5THR3 1501 aa18.29■□□□□ 0.52
NISCH-210ENST00000488157 STRCQ7RTU9 1775 aa18.29■□□□□ 0.52
NISCH-210ENST00000488157 IQGAP3Q86VI3 1631 aa18.28■□□□□ 0.52
NISCH-210ENST00000488157 TET3O43151 1660 aa18.28■□□□□ 0.52
NISCH-210ENST00000488157 A2ML1A8K2U0 1454 aa18.27■□□□□ 0.52
NISCH-210ENST00000488157 E9PCH4 1651 aa18.25■□□□□ 0.51
NISCH-210ENST00000488157 SYNMO15061 1565 aa18.25■□□□□ 0.51
NISCH-210ENST00000488157 NLRP1Q9C000 1473 aa18.24■□□□□ 0.51
NISCH-210ENST00000488157 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa18.23■□□□□ 0.51
NISCH-210ENST00000488157 TRIM52Q96A61 297 aa18.23■□□□□ 0.51
NISCH-210ENST00000488157 NOS1P29475 1434 aa18.23■□□□□ 0.51
NISCH-210ENST00000488157 UGGT1Q9NYU2 1555 aa18.21■□□□□ 0.51
NISCH-210ENST00000488157 IDI1Q13907 227 aa18.21■□□□□ 0.51
NISCH-210ENST00000488157 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
NISCH-210ENST00000488157 PIK3C2BO00750 1634 aa18.2■□□□□ 0.5
NISCH-210ENST00000488157 UBR1Q8IWV7 1749 aa18.19■□□□□ 0.5
NISCH-210ENST00000488157 SETD5Q9C0A6 1442 aa18.18■□□□□ 0.5
NISCH-210ENST00000488157 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
NISCH-210ENST00000488157 PLA2R1Q13018 1463 aa18.16■□□□□ 0.5
NISCH-210ENST00000488157 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa18.14■□□□□ 0.49
NISCH-210ENST00000488157 PKD2Q13563 968 aa18.13■□□□□ 0.49
NISCH-210ENST00000488157 FOXD1Q16676 465 aa18.13■□□□□ 0.49
NISCH-210ENST00000488157 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
NISCH-210ENST00000488157 MYO5BQ9ULV0 1848 aa18.13■□□□□ 0.49
NISCH-210ENST00000488157 SLC52A1Q9NWF4 448 aa18.12■□□□□ 0.49
NISCH-210ENST00000488157 STAG3Q9UJ98 1225 aa18.12■□□□□ 0.49
NISCH-210ENST00000488157 NEURL4Q96JN8 1562 aa18.12■□□□□ 0.49
NISCH-210ENST00000488157 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
NISCH-210ENST00000488157 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa18.12■□□□□ 0.49
NISCH-210ENST00000488157 DMRT2Q9Y5R5 561 aa18.11■□□□□ 0.49
NISCH-210ENST00000488157 PTPRTO14522 1441 aa18.11■□□□□ 0.49
NISCH-210ENST00000488157 LTKP29376 864 aa18.1■□□□□ 0.49
NISCH-210ENST00000488157 ANKLE2Q86XL3 938 aa18.1■□□□□ 0.49
NISCH-210ENST00000488157 ADGRB3O60242 1522 aa18.09■□□□□ 0.49
NISCH-210ENST00000488157 CHGAP10645 457 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
NISCH-210ENST00000488157 MPHOSPH9Q99550 1183 aa18.09■□□□□ 0.49
NISCH-210ENST00000488157 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa18.09■□□□□ 0.49
NISCH-210ENST00000488157 ARHGAP23Q9P227 1491 aa18.08■□□□□ 0.49
NISCH-210ENST00000488157 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
NISCH-210ENST00000488157 TXNDC2Q86VQ3 553 aa18.07■□□□□ 0.48
NISCH-210ENST00000488157 SLIT1O75093 1534 aa18.07■□□□□ 0.48
NISCH-210ENST00000488157 TMEM2Q9UHN6 1383 aa18.06■□□□□ 0.48
NISCH-210ENST00000488157 CLTCL1P53675 1640 aa18.05■□□□□ 0.48
NISCH-210ENST00000488157 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
NISCH-210ENST00000488157 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
NISCH-210ENST00000488157 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
NISCH-210ENST00000488157 TRPM2O94759 1503 aa18.03■□□□□ 0.48
NISCH-210ENST00000488157 MED14O60244 1454 aa18.03■□□□□ 0.48
NISCH-210ENST00000488157 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
NISCH-210ENST00000488157 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
NISCH-210ENST00000488157 IQGAP1P46940 1657 aa18.02■□□□□ 0.47
NISCH-210ENST00000488157 EID1Q9Y6B2 187 aa18.01■□□□□ 0.47
NISCH-210ENST00000488157 ZFYVE9O95405 1425 aa18■□□□□ 0.47
NISCH-210ENST00000488157 RIMS2Q9UQ26 1411 aa17.99■□□□□ 0.47
NISCH-210ENST00000488157 LTBP4Q8N2S1 1624 aa17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.3 ms