RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486517.5

C1orf61-217, Transcript of chromosome 1 open reading frame 61, humanhuman

TSL 3

Gene C1orf61, Length 726 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61-217ENST00000486517 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.07■■□□□ 1.6
C1orf61-217ENST00000486517 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.06■■□□□ 1.6
C1orf61-217ENST00000486517 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
C1orf61-217ENST00000486517 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.04■■□□□ 1.6
C1orf61-217ENST00000486517 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.03■■□□□ 1.6
C1orf61-217ENST00000486517 ALKQ9UM73 1620 aa25.01■■□□□ 1.59
C1orf61-217ENST00000486517 VWDEQ8N2E2 1590 aa24.99■■□□□ 1.59
C1orf61-217ENST00000486517 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.99■■□□□ 1.59
C1orf61-217ENST00000486517 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.98■■□□□ 1.59
C1orf61-217ENST00000486517 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.98■■□□□ 1.59
C1orf61-217ENST00000486517 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
C1orf61-217ENST00000486517 NCOA2Q15596 1464 aa24.95■■□□□ 1.58
C1orf61-217ENST00000486517 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
C1orf61-217ENST00000486517 APLP2Q06481 763 aa24.93■■□□□ 1.58
C1orf61-217ENST00000486517 TNRQ92752 1358 aa24.93■■□□□ 1.58
C1orf61-217ENST00000486517 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
C1orf61-217ENST00000486517 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.9■■□□□ 1.58
C1orf61-217ENST00000486517 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.9■■□□□ 1.586e-7■■■■■ 77.7
C1orf61-217ENST00000486517 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
C1orf61-217ENST00000486517 DEPDC5O75140 1603 aa24.89■■□□□ 1.57
C1orf61-217ENST00000486517 STRCP1A6NGW2 1772 aa24.88■■□□□ 1.57
C1orf61-217ENST00000486517 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
C1orf61-217ENST00000486517 PZPP20742 1482 aa24.87■■□□□ 1.57
C1orf61-217ENST00000486517 IQGAP1P46940 1657 aa24.87■■□□□ 1.57
C1orf61-217ENST00000486517 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
C1orf61-217ENST00000486517 MED14O60244 1454 aa24.86■■□□□ 1.57
C1orf61-217ENST00000486517 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
C1orf61-217ENST00000486517 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.84■■□□□ 1.57
C1orf61-217ENST00000486517 UGGT1Q9NYU2 1555 aa24.84■■□□□ 1.57
C1orf61-217ENST00000486517 LRRC7Q96NW7 1537 aa24.82■■□□□ 1.56
C1orf61-217ENST00000486517 SYNMO15061 1565 aa24.82■■□□□ 1.56
C1orf61-217ENST00000486517 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.82■■□□□ 1.56
C1orf61-217ENST00000486517 MIA2Q96PC5 1412 aa24.82■■□□□ 1.56
C1orf61-217ENST00000486517 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.81■■□□□ 1.56
C1orf61-217ENST00000486517 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
C1orf61-217ENST00000486517 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
C1orf61-217ENST00000486517 NLRP1Q9C000 1473 aa24.81■■□□□ 1.56
C1orf61-217ENST00000486517 MBD5Q9P267 1494 aa24.8■■□□□ 1.56
C1orf61-217ENST00000486517 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.79■■□□□ 1.56
C1orf61-217ENST00000486517 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.78■■□□□ 1.56
C1orf61-217ENST00000486517 KIF3BO15066 747 aa24.78■■□□□ 1.56
C1orf61-217ENST00000486517 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
C1orf61-217ENST00000486517 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.75■■□□□ 1.55
C1orf61-217ENST00000486517 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
C1orf61-217ENST00000486517 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.7■■□□□ 1.54
C1orf61-217ENST00000486517 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
C1orf61-217ENST00000486517 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.67■■□□□ 1.54
C1orf61-217ENST00000486517 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.64■■□□□ 1.54
C1orf61-217ENST00000486517 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.63■■□□□ 1.53
C1orf61-217ENST00000486517 POTEAQ6S8J7 498 aa24.63■■□□□ 1.53
C1orf61-217ENST00000486517 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.61■■□□□ 1.53
C1orf61-217ENST00000486517 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
C1orf61-217ENST00000486517 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
C1orf61-217ENST00000486517 TSPY4P0CV99 314 aa24.58■■□□□ 1.53
C1orf61-217ENST00000486517 TSPY10P0CW01 314 aa24.58■■□□□ 1.53
C1orf61-217ENST00000486517 ERVK-7P63135 1459 aa24.58■■□□□ 1.52
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C1orf61-217ENST00000486517 ABCC3O15438 1527 aa24.57■■□□□ 1.52
C1orf61-217ENST00000486517 FAM135BQ49AJ0 1406 aa24.55■■□□□ 1.52
C1orf61-217ENST00000486517 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.53■■□□□ 1.52
C1orf61-217ENST00000486517 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.53■■□□□ 1.52
C1orf61-217ENST00000486517 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa24.52■■□□□ 1.52
C1orf61-217ENST00000486517 CEP152O94986 1710 aa24.52■■□□□ 1.52
C1orf61-217ENST00000486517 ABCC5O15440 1437 aa24.51■■□□□ 1.51
C1orf61-217ENST00000486517 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.5■■□□□ 1.51
C1orf61-217ENST00000486517 SLIT1O75093 1534 aa24.5■■□□□ 1.51
C1orf61-217ENST00000486517 LTKP29376 864 aa24.49■■□□□ 1.51
C1orf61-217ENST00000486517 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.48■■□□□ 1.51
C1orf61-217ENST00000486517 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
C1orf61-217ENST00000486517 MROH1Q8NDA8 1641 aa24.46■■□□□ 1.51
C1orf61-217ENST00000486517 DAPK1P53355 1430 aa24.45■■□□□ 1.51
C1orf61-217ENST00000486517 TMEM94Q12767 1356 aa24.42■■□□□ 1.5
C1orf61-217ENST00000486517 EID1Q9Y6B2 187 aa24.41■■□□□ 1.5
C1orf61-217ENST00000486517 PHLPP1O60346 1717 aa24.4■■□□□ 1.5
C1orf61-217ENST00000486517 PIK3C2BO00750 1634 aa24.39■■□□□ 1.49
C1orf61-217ENST00000486517 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
C1orf61-217ENST00000486517 ADGRL2O95490 1459 aa24.37■■□□□ 1.49
C1orf61-217ENST00000486517 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
C1orf61-217ENST00000486517 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.34■■□□□ 1.49
C1orf61-217ENST00000486517 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.34■■□□□ 1.49
C1orf61-217ENST00000486517 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.34■■□□□ 1.49
C1orf61-217ENST00000486517 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.34■■□□□ 1.49
C1orf61-217ENST00000486517 KCNA6P17658 529 aa24.33■■□□□ 1.49
C1orf61-217ENST00000486517 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
C1orf61-217ENST00000486517 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
C1orf61-217ENST00000486517 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
C1orf61-217ENST00000486517 KIF15Q9NS87 1388 aa24.32■■□□□ 1.48
C1orf61-217ENST00000486517 JCADQ9P266 1359 aa24.32■■□□□ 1.48
C1orf61-217ENST00000486517 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
C1orf61-217ENST00000486517 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.31■■□□□ 1.48
C1orf61-217ENST00000486517 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP24.31■■□□□ 1.48
C1orf61-217ENST00000486517 ERBINQ96RT1 1412 aa24.31■■□□□ 1.48
C1orf61-217ENST00000486517 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
C1orf61-217ENST00000486517 ROCK1Q13464 1354 aa24.3■■□□□ 1.48
C1orf61-217ENST00000486517 TET3O43151 1660 aa24.29■■□□□ 1.48
C1orf61-217ENST00000486517 NWD1Q149M9 1564 aa24.29■■□□□ 1.48
C1orf61-217ENST00000486517 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
C1orf61-217ENST00000486517 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.28■■□□□ 1.48
C1orf61-217ENST00000486517 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.27■■□□□ 1.48
C1orf61-217ENST00000486517 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.27■■□□□ 1.48
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