RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 TMC1Q8TDI8 760 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-204ENST00000483092 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
CCSAP-204ENST00000483092 NUDCQ9Y266 331 aa21.52■■□□□ 1.04
CCSAP-204ENST00000483092 PDE4AP27815 886 aa21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-204ENST00000483092 SKAP1Q86WV1 359 aa21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-204ENST00000483092 EXOC6Q8TAG9 804 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-204ENST00000483092 ITSN2Q9NZM3 1697 aa21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-204ENST00000483092 NBPF1Q3BBV0 1214 aa21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-204ENST00000483092 GSE1Q14687 1217 aa21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-204ENST00000483092 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-204ENST00000483092 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-204ENST00000483092 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-204ENST00000483092 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-204ENST00000483092 USP35Q9P2H5 1018 aa21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-204ENST00000483092 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-204ENST00000483092 ABCA8O94911 1581 aa21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-204ENST00000483092 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa21.39■■□□□ 1.01
CCSAP-204ENST00000483092 ADGRL2O95490 1459 aa21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-204ENST00000483092 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-204ENST00000483092 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-204ENST00000483092 NFKBIBQ15653 356 aa21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-204ENST00000483092 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-204ENST00000483092 PLIN1O60240 522 aa21.35■■□□□ 1.01
CCSAP-204ENST00000483092 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.35■■□□□ 1.01
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC144AA2RUR9 1427 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-204ENST00000483092 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.33■■□□□ 1.01
CCSAP-204ENST00000483092 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
CCSAP-204ENST00000483092 AFAP1Q8N556 730 aa21.33■■□□□ 1
CCSAP-204ENST00000483092 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.32■■□□□ 1
CCSAP-204ENST00000483092 DDRGK1Q96HY6 314 aa21.31■■□□□ 1
CCSAP-204ENST00000483092 SYCP2Q9BX26 1530 aa21.31■■□□□ 1
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.31■■□□□ 1
CCSAP-204ENST00000483092 MBD5Q9P267 1494 aa21.31■■□□□ 1
CCSAP-204ENST00000483092 BACH2Q9BYV9 841 aa21.3■■□□□ 1
CCSAP-204ENST00000483092 RCAN3Q9UKA8 241 aa21.3■■□□□ 1
CCSAP-204ENST00000483092 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.3■■□□□ 1
CCSAP-204ENST00000483092 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa21.29■■□□□ 1
CCSAP-204ENST00000483092 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.28■■□□□ 1
CCSAP-204ENST00000483092 RRP1P56182 461 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
CCSAP-204ENST00000483092 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-204ENST00000483092 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-204ENST00000483092 RGS3P49796 1198 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-204ENST00000483092 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-204ENST00000483092 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-204ENST00000483092 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-204ENST00000483092 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-204ENST00000483092 FAM135AQ9P2D6 1515 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-204ENST00000483092 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-204ENST00000483092 CHD1O14646 1710 aa21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-204ENST00000483092 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-204ENST00000483092 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-204ENST00000483092 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-204ENST00000483092 RALGAPBQ86X10 1494 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-204ENST00000483092 KDM5CP41229 1560 aa21.2■□□□□ 0.98
CCSAP-204ENST00000483092 PANK3Q9H999 370 aa21.2■□□□□ 0.98
CCSAP-204ENST00000483092 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-204ENST00000483092 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-204ENST00000483092 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.18■□□□□ 0.988e-7■■■□□ 14.9
CCSAP-204ENST00000483092 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-204ENST00000483092 VSIG10Q8N0Z9 540 aa21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-204ENST00000483092 PKNOX2Q96KN3 472 aa21.17■□□□□ 0.98
CCSAP-204ENST00000483092 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
CCSAP-204ENST00000483092 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
CCSAP-204ENST00000483092 CDCA7LQ96GN5 454 aa21.17■□□□□ 0.98
CCSAP-204ENST00000483092 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-204ENST00000483092 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-204ENST00000483092 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-204ENST00000483092 KIF3BO15066 747 aa21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-204ENST00000483092 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-204ENST00000483092 CRBNQ96SW2 442 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-204ENST00000483092 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-204ENST00000483092 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-204ENST00000483092 DISP3Q9P2K9 1392 aa21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-204ENST00000483092 PLA2R1Q13018 1463 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-204ENST00000483092 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-204ENST00000483092 RALBP1Q15311 655 aa21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-204ENST00000483092 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-204ENST00000483092 PRAG1Q86YV5 1406 aa21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-204ENST00000483092 MS4A1P11836 297 aa21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-204ENST00000483092 TMF1P82094 1093 aa21.11■□□□□ 0.97
CCSAP-204ENST00000483092 PREX2Q70Z35 1606 aa21.11■□□□□ 0.97
CCSAP-204ENST00000483092 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-204ENST00000483092 A2MP01023 1474 aa21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-204ENST00000483092 NLRP13Q86W25 1043 aa21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-204ENST00000483092 TESK2Q96S53 571 aa21.08■□□□□ 0.96
CCSAP-204ENST00000483092 ABCC2Q92887 1545 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-204ENST00000483092 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-204ENST00000483092 RNF123Q5XPI4 1314 aa21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-204ENST00000483092 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-204ENST00000483092 PLCH2O75038 1416 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-204ENST00000483092 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-204ENST00000483092 KDM5DQ9BY66 1539 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-204ENST00000483092 KNSTRNQ9Y448 316 aa21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-204ENST00000483092 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-204ENST00000483092 POGKQ9P215 609 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-204ENST00000483092 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-204ENST00000483092 SCAPERQ9BY12 1400 aa21.02■□□□□ 0.95
CCSAP-204ENST00000483092 FAM43AQ8N2R8 423 aa21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-204ENST00000483092 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-204ENST00000483092 GGT6Q6P531 493 aa21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.9 ms