RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482785.1

SHQ1-208, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 3

Gene SHQ1, Length 502 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-208ENST00000482785 CLEC11AQ9Y240 323 aa7.07□□□□□ -1.28
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SHQ1-208ENST00000482785 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
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SHQ1-208ENST00000482785 SHANK2Q9UPX8 1470 aa7.05□□□□□ -1.28
SHQ1-208ENST00000482785 NHSL1Q5SYE7 1610 aa7.05□□□□□ -1.28
SHQ1-208ENST00000482785 CCDC88BA6NC98 1476 aa7.04□□□□□ -1.28
SHQ1-208ENST00000482785 RGS12O14924 1447 aa7.04□□□□□ -1.28
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SHQ1-208ENST00000482785 TMEM132AQ24JP5 1023 aa6.95□□□□□ -1.3
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SHQ1-208ENST00000482785 FAM212AQ96EL1 285 aa6.86□□□□□ -1.31
SHQ1-208ENST00000482785 MAGI2Q86UL8 1455 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1-208ENST00000482785 C9orf84Q5VXU9 1444 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1-208ENST00000482785 P3H3Q8IVL6 736 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1-208ENST00000482785 SYNMO15061 1565 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1-208ENST00000482785 NWD1Q149M9 1564 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1-208ENST00000482785 STK25O00506 426 aa6.84□□□□□ -1.31
SHQ1-208ENST00000482785 VGFO15240 615 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SHQ1-208ENST00000482785 NPATQ14207 1427 aa6.84□□□□□ -1.32
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