RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482660.1

EML4-208, Transcript of echinoderm microtubule associated protein like 4, human

TSL 4

Gene EML4, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EML4-208	ENST00000482660	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	28.11	■■■□□ 2.09
EML4-208	ENST00000482660	TSPY4	P0CV99	314 aa		28.11	■■■□□ 2.09
EML4-208	ENST00000482660	TSPY10	P0CW01	314 aa		28.11	■■■□□ 2.09
EML4-208	ENST00000482660	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	28.1	■■■□□ 2.09
EML4-208	ENST00000482660	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		28.09	■■■□□ 2.09
EML4-208	ENST00000482660	PKD2	Q13563	968 aa		28.09	■■■□□ 2.09
EML4-208	ENST00000482660	PZP	P20742	1482 aa		28.08	■■■□□ 2.09
EML4-208	ENST00000482660	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		28.08	■■■□□ 2.09
EML4-208	ENST00000482660	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		28.08	■■■□□ 2.09
EML4-208	ENST00000482660	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	28.07	■■■□□ 2.08
EML4-208	ENST00000482660	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		28.06	■■■□□ 2.08
EML4-208	ENST00000482660	TNR	Q92752	1358 aa		28.05	■■■□□ 2.08
EML4-208	ENST00000482660	MIA2	Q96PC5	1412 aa		28.05	■■■□□ 2.08
EML4-208	ENST00000482660	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		28.05	■■■□□ 2.08
EML4-208	ENST00000482660	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	28.04	■■■□□ 2.08
EML4-208	ENST00000482660	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	28.02	■■■□□ 2.08
EML4-208	ENST00000482660	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	28.01	■■■□□ 2.07
EML4-208	ENST00000482660	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	27.98	■■■□□ 2.07
EML4-208	ENST00000482660	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	27.95	■■■□□ 2.06
EML4-208	ENST00000482660	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06
EML4-208	ENST00000482660	ABCC3	O15438	1527 aa		27.94	■■■□□ 2.06
EML4-208	ENST00000482660	NLRP1	Q9C000	1473 aa		27.94	■■■□□ 2.06
EML4-208	ENST00000482660	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		27.92	■■■□□ 2.06
EML4-208	ENST00000482660	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		27.92	■■■□□ 2.06
EML4-208	ENST00000482660	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		27.89	■■■□□ 2.06
EML4-208	ENST00000482660	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		27.88	■■■□□ 2.05
EML4-208	ENST00000482660	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		27.88	■■■□□ 2.05
EML4-208	ENST00000482660	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		27.87	■■■□□ 2.05
EML4-208	ENST00000482660	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		27.87	■■■□□ 2.05
EML4-208	ENST00000482660	APLP2	Q06481	763 aa		27.87	■■■□□ 2.05
EML4-208	ENST00000482660	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		27.87	■■■□□ 2.05
EML4-208	ENST00000482660	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	27.86	■■■□□ 2.05
EML4-208	ENST00000482660	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
EML4-208	ENST00000482660	ABCC5	O15440	1437 aa		27.85	■■■□□ 2.05
EML4-208	ENST00000482660	CEP152	O94986	1710 aa		27.84	■■■□□ 2.05
EML4-208	ENST00000482660	ERVK-7	P63135	1459 aa		27.83	■■■□□ 2.05
EML4-208	ENST00000482660	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		27.83	■■■□□ 2.05
EML4-208	ENST00000482660	KIF15	Q9NS87	1388 aa		27.83	■■■□□ 2.05
EML4-208	ENST00000482660	DEPDC5	O75140	1603 aa		27.81	■■■□□ 2.04
EML4-208	ENST00000482660	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		27.8	■■■□□ 2.04
EML4-208	ENST00000482660	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		27.8	■■■□□ 2.04
EML4-208	ENST00000482660	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		27.8	■■■□□ 2.04
EML4-208	ENST00000482660	MED14	O60244	1454 aa		27.8	■■■□□ 2.04
EML4-208	ENST00000482660	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
EML4-208	ENST00000482660	DAPK1	P53355	1430 aa		27.79	■■■□□ 2.04
EML4-208	ENST00000482660	CPS1	P31327	1500 aa		27.78	■■■□□ 2.04
EML4-208	ENST00000482660	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		27.78	■■■□□ 2.04
EML4-208	ENST00000482660	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
EML4-208	ENST00000482660	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
EML4-208	ENST00000482660	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		27.76	■■■□□ 2.03
EML4-208	ENST00000482660	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		27.75	■■■□□ 2.03
EML4-208	ENST00000482660	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		27.74	■■■□□ 2.03
EML4-208	ENST00000482660	IQGAP1	P46940	1657 aa		27.73	■■■□□ 2.03
EML4-208	ENST00000482660	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		27.71	■■■□□ 2.03
EML4-208	ENST00000482660	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		27.68	■■■□□ 2.02
EML4-208	ENST00000482660	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	27.65	■■■□□ 2.02	9e-24	■□□□□ 9.5
EML4-208	ENST00000482660	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		27.65	■■■□□ 2.02
EML4-208	ENST00000482660	KANK1	Q14678	1352 aa		27.64	■■■□□ 2.02
EML4-208	ENST00000482660	ILDR2	Q71H61	639 aa		27.64	■■■□□ 2.02
EML4-208	ENST00000482660	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
EML4-208	ENST00000482660	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		27.62	■■■□□ 2.01
EML4-208	ENST00000482660	SLIT1	O75093	1534 aa		27.62	■■■□□ 2.01
EML4-208	ENST00000482660	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		27.62	■■■□□ 2.01
EML4-208	ENST00000482660	TOM1	O60784	492 aa		27.61	■■■□□ 2.01
EML4-208	ENST00000482660	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		27.6	■■■□□ 2.01
EML4-208	ENST00000482660	ADGRL2	O95490	1459 aa		27.6	■■■□□ 2.01
EML4-208	ENST00000482660	PIK3C2B	O00750	1634 aa		27.58	■■■□□ 2.01
EML4-208	ENST00000482660	LTK	P29376	864 aa		27.56	■■■□□ 2
EML4-208	ENST00000482660	PIP4K2B	P78356	416 aa		27.56	■■■□□ 2
EML4-208	ENST00000482660	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
EML4-208	ENST00000482660	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		27.55	■■■□□ 2
EML4-208	ENST00000482660	SYNM	O15061	1565 aa		27.55	■■■□□ 2
EML4-208	ENST00000482660	ALK	Q9UM73	1620 aa		27.55	■■■□□ 2
EML4-208	ENST00000482660	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		27.54	■■■□□ 2
EML4-208	ENST00000482660	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
EML4-208	ENST00000482660	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
EML4-208	ENST00000482660	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		27.52	■■■□□ 2
EML4-208	ENST00000482660	HSPA1L	P34931	641 aa		27.52	■■■□□ 2
EML4-208	ENST00000482660	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		27.51	■■□□□ 1.99
EML4-208	ENST00000482660	EID1	Q9Y6B2	187 aa		27.5	■■□□□ 1.99
EML4-208	ENST00000482660	NOS1	P29475	1434 aa		27.5	■■□□□ 1.99
EML4-208	ENST00000482660	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		27.49	■■□□□ 1.99
EML4-208	ENST00000482660	IDI1	Q13907	227 aa		27.48	■■□□□ 1.99
EML4-208	ENST00000482660	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		27.48	■■□□□ 1.99
EML4-208	ENST00000482660	SOCS7	O14512	581 aa		27.47	■■□□□ 1.99
EML4-208	ENST00000482660	ADGRB3	O60242	1522 aa		27.42	■■□□□ 1.98
EML4-208	ENST00000482660	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	27.42	■■□□□ 1.98
EML4-208	ENST00000482660	TET3	O43151	1660 aa		27.4	■■□□□ 1.98
EML4-208	ENST00000482660	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	27.39	■■□□□ 1.98
EML4-208	ENST00000482660	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		27.39	■■□□□ 1.98
EML4-208	ENST00000482660	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	27.39	■■□□□ 1.97
EML4-208	ENST00000482660	UNC13B	O14795	1591 aa		27.37	■■□□□ 1.97
EML4-208	ENST00000482660	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		27.34	■■□□□ 1.97
EML4-208	ENST00000482660	ROCK1	Q13464	1354 aa		27.34	■■□□□ 1.97
EML4-208	ENST00000482660	KCNA6	P17658	529 aa		27.3	■■□□□ 1.96
EML4-208	ENST00000482660	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		27.3	■■□□□ 1.96
EML4-208	ENST00000482660	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		27.3	■■□□□ 1.96
EML4-208	ENST00000482660	ZFYVE9	O95405	1425 aa		27.28	■■□□□ 1.96
EML4-208	ENST00000482660	TMEM94	Q12767	1356 aa		27.27	■■□□□ 1.96
EML4-208	ENST00000482660		E9PCH4	1651 aa		27.27	■■□□□ 1.96

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