RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482458.1

STK40-208, Transcript of serine/threonine kinase 40, humanhuman

TSL 3

Gene STK40, Length 900 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STK40-208ENST00000482458 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa40.45■■■■■ 4.07
STK40-208ENST00000482458 SOCS7O14512 581 aa40.45■■■■■ 4.07
STK40-208ENST00000482458 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP40.44■■■■■ 4.06
STK40-208ENST00000482458 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP40.42■■■■■ 4.06
STK40-208ENST00000482458 TNRQ92752 1358 aa40.42■■■■■ 4.06
STK40-208ENST00000482458 RSPH4AQ5TD94 716 aa40.41■■■■■ 4.06
STK40-208ENST00000482458 KDM5DQ9BY66 1539 aa40.39■■■■■ 4.06
STK40-208ENST00000482458 PZPP20742 1482 aa40.38■■■■■ 4.05
STK40-208ENST00000482458 FAM135AQ9P2D6 1515 aa40.37■■■■■ 4.05
STK40-208ENST00000482458 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa40.36■■■■■ 4.05
STK40-208ENST00000482458 ARHGEF5Q12774 1597 aa40.28■■■■■ 4.04
STK40-208ENST00000482458 TSPY4P0CV99 314 aa40.28■■■■■ 4.04
STK40-208ENST00000482458 TSPY10P0CW01 314 aa40.28■■■■■ 4.04
STK40-208ENST00000482458 NEURL4Q96JN8 1562 aa40.27■■■■■ 4.04
STK40-208ENST00000482458 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP40.26■■■■■ 4.04
STK40-208ENST00000482458 MIA2Q96PC5 1412 aa40.24■■■■■ 4.03
STK40-208ENST00000482458 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP40.23■■■■■ 4.03
STK40-208ENST00000482458 ANKLE2Q86XL3 938 aa40.21■■■■■ 4.03
STK40-208ENST00000482458 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP40.21■■■■■ 4.03
STK40-208ENST00000482458 NLRP1Q9C000 1473 aa40.2■■■■■ 4.03
STK40-208ENST00000482458 SHANK2Q9UPX8 1470 aa40.19■■■■■ 4.03
STK40-208ENST00000482458 CPS1P31327 1500 aa40.19■■■■■ 4.02
STK40-208ENST00000482458 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa40.16■■■■■ 4.02
STK40-208ENST00000482458 UGGT1Q9NYU2 1555 aa40.15■■■■■ 4.02
STK40-208ENST00000482458 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP40.15■■■■■ 4.02
STK40-208ENST00000482458 VPS8Q8N3P4 1428 aa40.13■■■■■ 4.01
STK40-208ENST00000482458 PIP4K2BP78356 416 aa40.12■■■■■ 4.01
STK40-208ENST00000482458 TOM1O60784 492 aa40.11■■■■■ 4.01
STK40-208ENST00000482458 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP40.1■■■■■ 4.01
STK40-208ENST00000482458 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP40.1■■■■■ 4.01
STK40-208ENST00000482458 MAST1Q9Y2H9 1570 aa40.09■■■■■ 4.01
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STK40-208ENST00000482458 MED14O60244 1454 aa40.07■■■■■ 4.01
STK40-208ENST00000482458 VWDEQ8N2E2 1590 aa40.07■■■■■ 4.01
STK40-208ENST00000482458 HSPA1LP34931 641 aa40.07■■■■■ 4.01
STK40-208ENST00000482458 DEPDC5O75140 1603 aa40.06■■■■■ 4
STK40-208ENST00000482458 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP40.02■■■■■ 4
STK40-208ENST00000482458 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP40.02■■■■■ 4
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STK40-208ENST00000482458 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.99■■■■□ 3.99
STK40-208ENST00000482458 ERVK-7P63135 1459 aa39.99■■■■□ 3.99
STK40-208ENST00000482458 MYOM3Q5VTT5 1437 aa39.98■■■■□ 3.99
STK40-208ENST00000482458 MAP3K1Q13233 1512 aa39.96■■■■□ 3.99
STK40-208ENST00000482458 IQGAP1P46940 1657 aa39.96■■■■□ 3.99
STK40-208ENST00000482458 MROH1Q8NDA8 1641 aa39.95■■■■□ 3.99
STK40-208ENST00000482458 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP39.89■■■■□ 3.98
STK40-208ENST00000482458 DUOX2Q9NRD8 1548 aa39.89■■■■□ 3.98
STK40-208ENST00000482458 CEP152O94986 1710 aa39.87■■■■□ 3.97
STK40-208ENST00000482458 ALKQ9UM73 1620 aa39.86■■■■□ 3.97
STK40-208ENST00000482458 LRRC7Q96NW7 1537 aa39.82■■■■□ 3.97
STK40-208ENST00000482458 KIF15Q9NS87 1388 aa39.82■■■■□ 3.96
STK40-208ENST00000482458 STRCP1A6NGW2 1772 aa39.81■■■■□ 3.96
STK40-208ENST00000482458 UBR1Q8IWV7 1749 aa39.8■■■■□ 3.96
STK40-208ENST00000482458 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP39.78■■■■□ 3.96
STK40-208ENST00000482458 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP39.77■■■■□ 3.96
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STK40-208ENST00000482458 SYNMO15061 1565 aa39.76■■■■□ 3.95
STK40-208ENST00000482458 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP39.75■■■■□ 3.95
STK40-208ENST00000482458 ABCC5O15440 1437 aa39.75■■■■□ 3.95
STK40-208ENST00000482458 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa39.75■■■■□ 3.95
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STK40-208ENST00000482458 LTKP29376 864 aa39.72■■■■□ 3.95
STK40-208ENST00000482458 TXNDC2Q86VQ3 553 aa39.72■■■■□ 3.95
STK40-208ENST00000482458 ARHGAP23Q9P227 1491 aa39.71■■■■□ 3.95
STK40-208ENST00000482458 SLIT1O75093 1534 aa39.7■■■■□ 3.95
STK40-208ENST00000482458 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP39.7■■■■□ 3.95
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STK40-208ENST00000482458 PTPN23Q9H3S7 1636 aa39.68■■■■□ 3.94
STK40-208ENST00000482458 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP39.66■■■■□ 3.94
STK40-208ENST00000482458 EID1Q9Y6B2 187 aa39.65■■■■□ 3.94
STK40-208ENST00000482458 DAPK1P53355 1430 aa39.65■■■■□ 3.94
STK40-208ENST00000482458 APLP2Q06481 763 aa39.64■■■■□ 3.94
STK40-208ENST00000482458 KANK1Q14678 1352 aa39.62■■■■□ 3.93
STK40-208ENST00000482458 PIK3C2BO00750 1634 aa39.58■■■■□ 3.93
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STK40-208ENST00000482458 TMEM2Q9UHN6 1383 aa39.58■■■■□ 3.93
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STK40-208ENST00000482458 CHIC2Q9UKJ5 165 aa39.54■■■■□ 3.92
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STK40-208ENST00000482458 NOS1P29475 1434 aa39.39■■■■□ 3.9
STK40-208ENST00000482458 KCNA6P17658 529 aa39.38■■■■□ 3.89
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STK40-208ENST00000482458 ADGRB3O60242 1522 aa39.34■■■■□ 3.89
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STK40-208ENST00000482458 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP39.32■■■■□ 3.89
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STK40-208ENST00000482458 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP39.29■■■■□ 3.88
STK40-208ENST00000482458 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP39.28■■■■□ 3.88
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STK40-208ENST00000482458 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa39.23■■■■□ 3.87
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