RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481211.1

NISCH-208, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 557 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-208ENST00000481211 DEPDC5O75140 1603 aa19.4■□□□□ 0.7
NISCH-208ENST00000481211 FAM135AQ9P2D6 1515 aa19.39■□□□□ 0.69
NISCH-208ENST00000481211 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
NISCH-208ENST00000481211 KDM5DQ9BY66 1539 aa19.36■□□□□ 0.69
NISCH-208ENST00000481211 KIF3BO15066 747 aa19.36■□□□□ 0.69
NISCH-208ENST00000481211 PPP6R1Q9UPN7 881 aa19.36■□□□□ 0.69
NISCH-208ENST00000481211 KANK1Q14678 1352 aa19.34■□□□□ 0.69
NISCH-208ENST00000481211 MROH1Q8NDA8 1641 aa19.32■□□□□ 0.68
NISCH-208ENST00000481211 VWDEQ8N2E2 1590 aa19.32■□□□□ 0.68
NISCH-208ENST00000481211 IQGAP3Q86VI3 1631 aa19.31■□□□□ 0.68
NISCH-208ENST00000481211 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
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NISCH-208ENST00000481211 NUP155O75694 1391 aa19.3■□□□□ 0.68
NISCH-208ENST00000481211 LMTK2Q8IWU2 1503 aa19.29■□□□□ 0.68
NISCH-208ENST00000481211 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
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NISCH-208ENST00000481211 GGT6Q6P531 493 aa19.26■□□□□ 0.67
NISCH-208ENST00000481211 CNTLNQ9NXG0 1405 aa19.25■□□□□ 0.67
NISCH-208ENST00000481211 PZPP20742 1482 aa19.24■□□□□ 0.67
NISCH-208ENST00000481211 ABCC3O15438 1527 aa19.24■□□□□ 0.67
NISCH-208ENST00000481211 TET3O43151 1660 aa19.24■□□□□ 0.67
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NISCH-208ENST00000481211 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa19.22■□□□□ 0.67
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NISCH-208ENST00000481211 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
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NISCH-208ENST00000481211 MLECQ14165 292 aa19.17■□□□□ 0.66
NISCH-208ENST00000481211 ADAMTSL3P82987 1691 aa19.17■□□□□ 0.66
NISCH-208ENST00000481211 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa19.16■□□□□ 0.66
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NISCH-208ENST00000481211 MADDQ8WXG6 1647 aa19.11■□□□□ 0.65
NISCH-208ENST00000481211 ZMYM3Q14202 1370 aa19.1■□□□□ 0.65
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NISCH-208ENST00000481211 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa19.06■□□□□ 0.64
NISCH-208ENST00000481211 TRPM2O94759 1503 aa19.06■□□□□ 0.64
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NISCH-208ENST00000481211 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa19.06■□□□□ 0.64
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NISCH-208ENST00000481211 C3P01024 1663 aa19.04■□□□□ 0.64
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NISCH-208ENST00000481211 SLC52A1Q9NWF4 448 aa19■□□□□ 0.63
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NISCH-208ENST00000481211 NLRP1Q9C000 1473 aa18.96■□□□□ 0.63
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NISCH-208ENST00000481211 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
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NISCH-208ENST00000481211 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa18.93■□□□□ 0.62
NISCH-208ENST00000481211 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
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NISCH-208ENST00000481211 KIF1BO60333 1816 aa18.9■□□□□ 0.62
NISCH-208ENST00000481211 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
NISCH-208ENST00000481211 IDI1Q13907 227 aa18.88■□□□□ 0.61
NISCH-208ENST00000481211 ADGRB3O60242 1522 aa18.88■□□□□ 0.61
NISCH-208ENST00000481211 UGGT1Q9NYU2 1555 aa18.88■□□□□ 0.61
NISCH-208ENST00000481211 MYO3AQ8NEV4 1616 aa18.88■□□□□ 0.61
NISCH-208ENST00000481211 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa18.87■□□□□ 0.61
NISCH-208ENST00000481211 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
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NISCH-208ENST00000481211 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
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NISCH-208ENST00000481211 SIN3AQ96ST3 1273 aa18.86■□□□□ 0.61
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NISCH-208ENST00000481211 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa18.85■□□□□ 0.61
NISCH-208ENST00000481211 NEUROD1Q13562 356 aa18.84■□□□□ 0.61
NISCH-208ENST00000481211 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
NISCH-208ENST00000481211 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa18.83■□□□□ 0.61
NISCH-208ENST00000481211 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa18.83■□□□□ 0.61
NISCH-208ENST00000481211 STAG3Q9UJ98 1225 aa18.82■□□□□ 0.6
NISCH-208ENST00000481211 UBR1Q8IWV7 1749 aa18.81■□□□□ 0.6
NISCH-208ENST00000481211 PLPPR3Q6T4P5 718 aa18.8■□□□□ 0.6
NISCH-208ENST00000481211 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
NISCH-208ENST00000481211 CHGAP10645 457 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
NISCH-208ENST00000481211 HDGFP51858 240 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
NISCH-208ENST00000481211 MYOM2P54296 1465 aa18.77■□□□□ 0.59
NISCH-208ENST00000481211 SLIT1O75093 1534 aa18.76■□□□□ 0.59
NISCH-208ENST00000481211 ZFYVE9O95405 1425 aa18.75■□□□□ 0.59
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