RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481079.1

PTPRD-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRD, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-210ENST00000481079 KDM5DQ9BY66 1539 aa37.32■■■■□ 3.57
PTPRD-210ENST00000481079 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP37.32■■■■□ 3.56
PTPRD-210ENST00000481079 STRCQ7RTU9 1775 aa37.32■■■■□ 3.56
PTPRD-210ENST00000481079 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP37.31■■■■□ 3.56
PTPRD-210ENST00000481079 DUOX2Q9NRD8 1548 aa37.27■■■■□ 3.56
PTPRD-210ENST00000481079 MYO3AQ8NEV4 1616 aa37.25■■■■□ 3.55
PTPRD-210ENST00000481079 MROH1Q8NDA8 1641 aa37.24■■■■□ 3.55
PTPRD-210ENST00000481079 KIF15Q9NS87 1388 aa37.22■■■■□ 3.55
PTPRD-210ENST00000481079 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa37.22■■■■□ 3.55
PTPRD-210ENST00000481079 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP37.21■■■■□ 3.55
PTPRD-210ENST00000481079 PZPP20742 1482 aa37.2■■■■□ 3.55
PTPRD-210ENST00000481079 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP37.19■■■■□ 3.54
PTPRD-210ENST00000481079 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP37.17■■■■□ 3.54
PTPRD-210ENST00000481079 ABCC3O15438 1527 aa37.16■■■■□ 3.54
PTPRD-210ENST00000481079 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa37.16■■■■□ 3.54
PTPRD-210ENST00000481079 NCOA1Q15788 1441 aa37.16■■■■□ 3.54
PTPRD-210ENST00000481079 ERBINQ96RT1 1412 aa37.16■■■■□ 3.54
PTPRD-210ENST00000481079 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP37.15■■■■□ 3.54
PTPRD-210ENST00000481079 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP37.14■■■■□ 3.54
PTPRD-210ENST00000481079 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa37.13■■■■□ 3.53
PTPRD-210ENST00000481079 CHIC2Q9UKJ5 165 aa37.11■■■■□ 3.53
PTPRD-210ENST00000481079 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa37.09■■■■□ 3.53
PTPRD-210ENST00000481079 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP37.09■■■■□ 3.53
PTPRD-210ENST00000481079 DMRT2Q9Y5R5 561 aa37.09■■■■□ 3.53
PTPRD-210ENST00000481079 ADGRL2O95490 1459 aa37.08■■■■□ 3.53
PTPRD-210ENST00000481079 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP37.08■■■■□ 3.53
PTPRD-210ENST00000481079 TNRQ92752 1358 aa37.07■■■■□ 3.53
PTPRD-210ENST00000481079 PTPRTO14522 1441 aa37.07■■■■□ 3.52
PTPRD-210ENST00000481079 CEP152O94986 1710 aa37.07■■■■□ 3.52
PTPRD-210ENST00000481079 A2ML1A8K2U0 1454 aa37.07■■■■□ 3.52
PTPRD-210ENST00000481079 DEPDC5O75140 1603 aa37.06■■■■□ 3.52
PTPRD-210ENST00000481079 PLA2R1Q13018 1463 aa37.02■■■■□ 3.52
PTPRD-210ENST00000481079 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa37■■■■□ 3.51
PTPRD-210ENST00000481079 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP36.99■■■■□ 3.51
PTPRD-210ENST00000481079 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa36.95■■■■□ 3.51
PTPRD-210ENST00000481079 ERVK-7P63135 1459 aa36.94■■■■□ 3.5
PTPRD-210ENST00000481079 NLRP1Q9C000 1473 aa36.94■■■■□ 3.5
PTPRD-210ENST00000481079 FBXO41Q8TF61 875 aa36.93■■■■□ 3.5
PTPRD-210ENST00000481079 VWDEQ8N2E2 1590 aa36.92■■■■□ 3.5
PTPRD-210ENST00000481079 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa36.92■■■■□ 3.5
PTPRD-210ENST00000481079 PKD2Q13563 968 aa36.89■■■■□ 3.5
PTPRD-210ENST00000481079 CERKQ8TCT0 537 aa36.89■■■■□ 3.5
PTPRD-210ENST00000481079 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP36.89■■■■□ 3.5
PTPRD-210ENST00000481079 LMTK2Q8IWU2 1503 aa36.87■■■■□ 3.49
PTPRD-210ENST00000481079 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP36.86■■■■□ 3.49
PTPRD-210ENST00000481079 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa36.85■■■■□ 3.49
PTPRD-210ENST00000481079 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP36.85■■■■□ 3.49
PTPRD-210ENST00000481079 UGGT1Q9NYU2 1555 aa36.85■■■■□ 3.49
PTPRD-210ENST00000481079 KANK1Q14678 1352 aa36.84■■■■□ 3.49
PTPRD-210ENST00000481079 LTBP4Q8N2S1 1624 aa36.82■■■■□ 3.49
PTPRD-210ENST00000481079 ROCK1Q13464 1354 aa36.81■■■■□ 3.48
PTPRD-210ENST00000481079 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP36.79■■■■□ 3.48
PTPRD-210ENST00000481079 NEURL4Q96JN8 1562 aa36.79■■■■□ 3.48
PTPRD-210ENST00000481079 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP36.77■■■■□ 3.48
PTPRD-210ENST00000481079 EFCAB6Q5THR3 1501 aa36.74■■■■□ 3.47
PTPRD-210ENST00000481079 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP36.73■■■■□ 3.47
PTPRD-210ENST00000481079 UBR1Q8IWV7 1749 aa36.72■■■■□ 3.47
PTPRD-210ENST00000481079 UNC13BO14795 1591 aa36.7■■■■□ 3.47
PTPRD-210ENST00000481079 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP36.68■■■■□ 3.46
PTPRD-210ENST00000481079 ITGAEP38570 1179 aa36.68■■■■□ 3.46
PTPRD-210ENST00000481079 ANKLE2Q86XL3 938 aa36.67■■■■□ 3.46
PTPRD-210ENST00000481079 MED14O60244 1454 aa36.66■■■■□ 3.46
PTPRD-210ENST00000481079 SYNMO15061 1565 aa36.65■■■■□ 3.46
PTPRD-210ENST00000481079 NOS1P29475 1434 aa36.64■■■■□ 3.46
PTPRD-210ENST00000481079 PIK3C2BO00750 1634 aa36.63■■■■□ 3.45
PTPRD-210ENST00000481079 TET3O43151 1660 aa36.62■■■■□ 3.45
PTPRD-210ENST00000481079 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
PTPRD-210ENST00000481079 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP36.59■■■■□ 3.45
PTPRD-210ENST00000481079 IQSEC2Q5JU85 1478 aa36.58■■■■□ 3.45
PTPRD-210ENST00000481079 ARHGAP23Q9P227 1491 aa36.58■■■■□ 3.45
PTPRD-210ENST00000481079 SLIT1O75093 1534 aa36.58■■■■□ 3.45
PTPRD-210ENST00000481079 GCC2Q8IWJ2 1684 aa36.57■■■■□ 3.44
PTPRD-210ENST00000481079 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP36.55■■■■□ 3.44
PTPRD-210ENST00000481079 IQGAP1P46940 1657 aa36.55■■■■□ 3.44
PTPRD-210ENST00000481079 IDI1Q13907 227 aa36.55■■■■□ 3.44
PTPRD-210ENST00000481079 IQGAP3Q86VI3 1631 aa36.55■■■■□ 3.44
PTPRD-210ENST00000481079 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP36.5■■■■□ 3.43
PTPRD-210ENST00000481079 E9PCH4 1651 aa36.48■■■■□ 3.43
PTPRD-210ENST00000481079 LTKP29376 864 aa36.48■■■■□ 3.43
PTPRD-210ENST00000481079 TMEM2Q9UHN6 1383 aa36.46■■■■□ 3.43
PTPRD-210ENST00000481079 ADGRB3O60242 1522 aa36.45■■■■□ 3.43
PTPRD-210ENST00000481079 NUP155O75694 1391 aa36.45■■■■□ 3.43
PTPRD-210ENST00000481079 SLC52A1Q9NWF4 448 aa36.45■■■■□ 3.43
PTPRD-210ENST00000481079 TXNDC2Q86VQ3 553 aa36.42■■■■□ 3.42
PTPRD-210ENST00000481079 NAIPQ13075 1403 aa36.42■■■■□ 3.42
PTPRD-210ENST00000481079 CPS1P31327 1500 aa36.41■■■■□ 3.42
PTPRD-210ENST00000481079 STAG3Q9UJ98 1225 aa36.4■■■■□ 3.42
PTPRD-210ENST00000481079 STRCP1A6NGW2 1772 aa36.36■■■■□ 3.41
PTPRD-210ENST00000481079 EID1Q9Y6B2 187 aa36.35■■■■□ 3.41
PTPRD-210ENST00000481079 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa36.33■■■■□ 3.41
PTPRD-210ENST00000481079 MYO5BQ9ULV0 1848 aa36.32■■■■□ 3.41
PTPRD-210ENST00000481079 HFM1A2PYH4 1435 aa36.32■■■■□ 3.4
PTPRD-210ENST00000481079 ZFYVE9O95405 1425 aa36.26■■■■□ 3.4
PTPRD-210ENST00000481079 UBAP1LF5GYI3 381 aa36.23■■■■□ 3.39
PTPRD-210ENST00000481079 LRRC7Q96NW7 1537 aa36.21■■■■□ 3.39
PTPRD-210ENST00000481079 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa36.2■■■■□ 3.39
PTPRD-210ENST00000481079 RIMS2Q9UQ26 1411 aa36.18■■■■□ 3.38
PTPRD-210ENST00000481079 ALKQ9UM73 1620 aa36.13■■■■□ 3.37
PTPRD-210ENST00000481079 CHGAP10645 457 aaKnown RBP36.12■■■■□ 3.37
PTPRD-210ENST00000481079 SLC26A8Q96RN1 970 aa36.12■■■■□ 3.37
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