RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479554.5

ATG4B-218, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 4

Gene ATG4B, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-218ENST00000479554 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.51■■□□□ 1.19
ATG4B-218ENST00000479554 PTPRTO14522 1441 aa22.5■■□□□ 1.19
ATG4B-218ENST00000479554 CERKQ8TCT0 537 aa22.5■■□□□ 1.19
ATG4B-218ENST00000479554 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
ATG4B-218ENST00000479554 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.45■■□□□ 1.18
ATG4B-218ENST00000479554 PZPP20742 1482 aa22.45■■□□□ 1.18
ATG4B-218ENST00000479554 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
ATG4B-218ENST00000479554 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.45■■□□□ 1.18
ATG4B-218ENST00000479554 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
ATG4B-218ENST00000479554 PLA2R1Q13018 1463 aa22.43■■□□□ 1.18
ATG4B-218ENST00000479554 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.42■■□□□ 1.18
ATG4B-218ENST00000479554 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.41■■□□□ 1.18
ATG4B-218ENST00000479554 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.41■■□□□ 1.18
ATG4B-218ENST00000479554 TNRQ92752 1358 aa22.4■■□□□ 1.18
ATG4B-218ENST00000479554 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
ATG4B-218ENST00000479554 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.4■■□□□ 1.18
ATG4B-218ENST00000479554 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.4■■□□□ 1.18
ATG4B-218ENST00000479554 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
ATG4B-218ENST00000479554 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.38■■□□□ 1.17
ATG4B-218ENST00000479554 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
ATG4B-218ENST00000479554 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
ATG4B-218ENST00000479554 ABCC5O15440 1437 aa22.38■■□□□ 1.17
ATG4B-218ENST00000479554 ABCC3O15438 1527 aa22.37■■□□□ 1.17
ATG4B-218ENST00000479554 PKD2Q13563 968 aa22.36■■□□□ 1.17
ATG4B-218ENST00000479554 KIF15Q9NS87 1388 aa22.36■■□□□ 1.17
ATG4B-218ENST00000479554 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.35■■□□□ 1.17
ATG4B-218ENST00000479554 DAPK1P53355 1430 aa22.35■■□□□ 1.17
ATG4B-218ENST00000479554 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.35■■□□□ 1.17
ATG4B-218ENST00000479554 ERBINQ96RT1 1412 aa22.32■■□□□ 1.16
ATG4B-218ENST00000479554 NLRP1Q9C000 1473 aa22.32■■□□□ 1.16
ATG4B-218ENST00000479554 CEP152O94986 1710 aa22.31■■□□□ 1.16
ATG4B-218ENST00000479554 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.3■■□□□ 1.16
ATG4B-218ENST00000479554 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.29■■□□□ 1.16
ATG4B-218ENST00000479554 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
ATG4B-218ENST00000479554 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
ATG4B-218ENST00000479554 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.28■■□□□ 1.16
ATG4B-218ENST00000479554 ERVK-7P63135 1459 aa22.28■■□□□ 1.16
ATG4B-218ENST00000479554 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.28■■□□□ 1.16
ATG4B-218ENST00000479554 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
ATG4B-218ENST00000479554 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.25■■□□□ 1.15
ATG4B-218ENST00000479554 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.25■■□□□ 1.15
ATG4B-218ENST00000479554 DEPDC5O75140 1603 aa22.24■■□□□ 1.15
ATG4B-218ENST00000479554 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.24■■□□□ 1.15
ATG4B-218ENST00000479554 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.154e-7■□□□□ 8.1
ATG4B-218ENST00000479554 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
ATG4B-218ENST00000479554 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
ATG4B-218ENST00000479554 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.2■■□□□ 1.14
ATG4B-218ENST00000479554 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.141e-13■□□□□ 11.2
ATG4B-218ENST00000479554 KANK1Q14678 1352 aa22.2■■□□□ 1.14
ATG4B-218ENST00000479554 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.2■■□□□ 1.14
ATG4B-218ENST00000479554 ADGRL2O95490 1459 aa22.2■■□□□ 1.14
ATG4B-218ENST00000479554 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
ATG4B-218ENST00000479554 MED14O60244 1454 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4B-218ENST00000479554 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
ATG4B-218ENST00000479554 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.14■■□□□ 1.14
ATG4B-218ENST00000479554 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.14■■□□□ 1.13
ATG4B-218ENST00000479554 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22.14■■□□□ 1.13
ATG4B-218ENST00000479554 IQGAP1P46940 1657 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG4B-218ENST00000479554 CPS1P31327 1500 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG4B-218ENST00000479554 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.1■■□□□ 1.13
ATG4B-218ENST00000479554 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.09■■□□□ 1.13
ATG4B-218ENST00000479554 PIK3C2BO00750 1634 aa22.07■■□□□ 1.12
ATG4B-218ENST00000479554 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.07■■□□□ 1.12
ATG4B-218ENST00000479554 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
ATG4B-218ENST00000479554 SLIT1O75093 1534 aa22.06■■□□□ 1.12
ATG4B-218ENST00000479554 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.05■■□□□ 1.12
ATG4B-218ENST00000479554 SYNMO15061 1565 aa22.04■■□□□ 1.12
ATG4B-218ENST00000479554 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
ATG4B-218ENST00000479554 NOS1P29475 1434 aa22.01■■□□□ 1.11
ATG4B-218ENST00000479554 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.01■■□□□ 1.11
ATG4B-218ENST00000479554 ROCK1Q13464 1354 aa22■■□□□ 1.11
ATG4B-218ENST00000479554 UNC13BO14795 1591 aa22■■□□□ 1.11
ATG4B-218ENST00000479554 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
ATG4B-218ENST00000479554 TET3O43151 1660 aa21.99■■□□□ 1.11
ATG4B-218ENST00000479554 TXNDC2Q86VQ3 553 aa21.99■■□□□ 1.11
ATG4B-218ENST00000479554 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
ATG4B-218ENST00000479554 EID1Q9Y6B2 187 aa21.99■■□□□ 1.11
ATG4B-218ENST00000479554 LTKP29376 864 aa21.98■■□□□ 1.11
ATG4B-218ENST00000479554 TMEM2Q9UHN6 1383 aa21.98■■□□□ 1.11
ATG4B-218ENST00000479554 ADGRB3O60242 1522 aa21.97■■□□□ 1.11
ATG4B-218ENST00000479554 IDI1Q13907 227 aa21.97■■□□□ 1.11
ATG4B-218ENST00000479554 STRCP1A6NGW2 1772 aa21.97■■□□□ 1.11
ATG4B-218ENST00000479554 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.96■■□□□ 1.11
ATG4B-218ENST00000479554 ITGAEP38570 1179 aa21.95■■□□□ 1.1
ATG4B-218ENST00000479554 TOM1O60784 492 aa21.94■■□□□ 1.1
ATG4B-218ENST00000479554 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
ATG4B-218ENST00000479554 SLC52A1Q9NWF4 448 aa21.93■■□□□ 1.1
ATG4B-218ENST00000479554 LRRC7Q96NW7 1537 aa21.92■■□□□ 1.1
ATG4B-218ENST00000479554 DISP3Q9P2K9 1392 aa21.92■■□□□ 1.1
ATG4B-218ENST00000479554 IQGAP3Q86VI3 1631 aa21.91■■□□□ 1.1
ATG4B-218ENST00000479554 PIP4K2BP78356 416 aa21.9■■□□□ 1.1
ATG4B-218ENST00000479554 E9PCH4 1651 aa21.88■■□□□ 1.09
ATG4B-218ENST00000479554 ALKQ9UM73 1620 aa21.86■■□□□ 1.09
ATG4B-218ENST00000479554 NUP155O75694 1391 aa21.85■■□□□ 1.09
ATG4B-218ENST00000479554 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
ATG4B-218ENST00000479554 MYO5BQ9ULV0 1848 aa21.84■■□□□ 1.09
ATG4B-218ENST00000479554 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa21.84■■□□□ 1.09
ATG4B-218ENST00000479554 HSPA1LP34931 641 aa21.82■■□□□ 1.08
ATG4B-218ENST00000479554 ZFYVE9O95405 1425 aa21.81■■□□□ 1.08
ATG4B-218ENST00000479554 SLC26A8Q96RN1 970 aa21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms