RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478603.5

C9orf3-216, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf3, Length 802 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-216ENST00000478603 PTPRTO14522 1441 aa35.9■■■■□ 3.34
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C9orf3-216ENST00000478603 FAM135AQ9P2D6 1515 aa35.81■■■■□ 3.32
C9orf3-216ENST00000478603 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP35.8■■■■□ 3.32
C9orf3-216ENST00000478603 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa35.8■■■■□ 3.32
C9orf3-216ENST00000478603 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.79■■■■□ 3.32
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C9orf3-216ENST00000478603 LTBP4Q8N2S1 1624 aa35.69■■■■□ 3.3
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C9orf3-216ENST00000478603 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.66■■■■□ 3.3
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C9orf3-216ENST00000478603 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa35.53■■■■□ 3.28
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C9orf3-216ENST00000478603 NEURL4Q96JN8 1562 aa35.51■■■■□ 3.27
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C9orf3-216ENST00000478603 ERVK-7P63135 1459 aa35.5■■■■□ 3.27
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C9orf3-216ENST00000478603 TXNDC2Q86VQ3 553 aa35.13■■■■□ 3.21
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C9orf3-216ENST00000478603 HSPA1LP34931 641 aa34.88■■■■□ 3.17
C9orf3-216ENST00000478603 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP34.86■■■■□ 3.17
C9orf3-216ENST00000478603 NUP155O75694 1391 aa34.86■■■■□ 3.17
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C9orf3-216ENST00000478603 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa34.84■■■■□ 3.17
C9orf3-216ENST00000478603 ILDR2Q71H61 639 aa34.83■■■■□ 3.17
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