RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478603.5

C9orf3-216, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf3, Length 802 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-216ENST00000478603 PTPRTO14522 1441 aa35.9■■■■□ 3.34
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C9orf3-216ENST00000478603 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa35.82■■■■□ 3.32
C9orf3-216ENST00000478603 FAM135AQ9P2D6 1515 aa35.81■■■■□ 3.32
C9orf3-216ENST00000478603 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP35.8■■■■□ 3.32
C9orf3-216ENST00000478603 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa35.8■■■■□ 3.32
C9orf3-216ENST00000478603 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.79■■■■□ 3.32
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C9orf3-216ENST00000478603 A2ML1A8K2U0 1454 aa35.73■■■■□ 3.31
C9orf3-216ENST00000478603 PLA2R1Q13018 1463 aa35.73■■■■□ 3.31
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C9orf3-216ENST00000478603 CROCC2H7BZ55 1655 aa35.73■■■■□ 3.31
C9orf3-216ENST00000478603 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP35.72■■■■□ 3.31
C9orf3-216ENST00000478603 ABCC5O15440 1437 aa35.7■■■■□ 3.31
C9orf3-216ENST00000478603 LTBP4Q8N2S1 1624 aa35.69■■■■□ 3.3
C9orf3-216ENST00000478603 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.69■■■■□ 3.3
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C9orf3-216ENST00000478603 ABCC3O15438 1527 aa35.67■■■■□ 3.3
C9orf3-216ENST00000478603 PKD2Q13563 968 aa35.66■■■■□ 3.3
C9orf3-216ENST00000478603 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.66■■■■□ 3.3
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C9orf3-216ENST00000478603 CEP152O94986 1710 aa35.63■■■■□ 3.29
C9orf3-216ENST00000478603 KIF15Q9NS87 1388 aa35.63■■■■□ 3.29
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C9orf3-216ENST00000478603 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP35.57■■■■□ 3.29
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C9orf3-216ENST00000478603 ERBINQ96RT1 1412 aa35.54■■■■□ 3.28
C9orf3-216ENST00000478603 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa35.53■■■■□ 3.28
C9orf3-216ENST00000478603 UGGT1Q9NYU2 1555 aa35.51■■■■□ 3.28
C9orf3-216ENST00000478603 NEURL4Q96JN8 1562 aa35.51■■■■□ 3.27
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C9orf3-216ENST00000478603 ERVK-7P63135 1459 aa35.5■■■■□ 3.27
C9orf3-216ENST00000478603 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP35.5■■■■□ 3.27
C9orf3-216ENST00000478603 IQSEC2Q5JU85 1478 aa35.47■■■■□ 3.27
C9orf3-216ENST00000478603 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP35.46■■■■□ 3.27
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C9orf3-216ENST00000478603 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa35.37■■■■□ 3.25
C9orf3-216ENST00000478603 ADGRL2O95490 1459 aa35.35■■■■□ 3.25
C9orf3-216ENST00000478603 KANK1Q14678 1352 aa35.35■■■■□ 3.25
C9orf3-216ENST00000478603 UBR1Q8IWV7 1749 aa35.34■■■■□ 3.25
C9orf3-216ENST00000478603 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP35.32■■■■□ 3.25
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C9orf3-216ENST00000478603 TXNDC2Q86VQ3 553 aa35.13■■■■□ 3.21
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C9orf3-216ENST00000478603 EID1Q9Y6B2 187 aa35.05■■■■□ 3.2
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C9orf3-216ENST00000478603 LRRC7Q96NW7 1537 aa35■■■■□ 3.19
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C9orf3-216ENST00000478603 HSPA1LP34931 641 aa34.88■■■■□ 3.17
C9orf3-216ENST00000478603 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP34.86■■■■□ 3.17
C9orf3-216ENST00000478603 NUP155O75694 1391 aa34.86■■■■□ 3.17
C9orf3-216ENST00000478603 SLC26A8Q96RN1 970 aa34.85■■■■□ 3.17
C9orf3-216ENST00000478603 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa34.84■■■■□ 3.17
C9orf3-216ENST00000478603 ILDR2Q71H61 639 aa34.83■■■■□ 3.17
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