RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478087.5

HPS1-211, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 971 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-211ENST00000478087 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.32■□□□□ 0.84
HPS1-211ENST00000478087 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa20.31■□□□□ 0.84
HPS1-211ENST00000478087 FBXO41Q8TF61 875 aa20.31■□□□□ 0.84
HPS1-211ENST00000478087 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa20.3■□□□□ 0.84
HPS1-211ENST00000478087 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS1-211ENST00000478087 KDM5DQ9BY66 1539 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS1-211ENST00000478087 CHIC2Q9UKJ5 165 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS1-211ENST00000478087 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
HPS1-211ENST00000478087 NCOA1Q15788 1441 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS1-211ENST00000478087 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
HPS1-211ENST00000478087 CERKQ8TCT0 537 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS1-211ENST00000478087 DMRT2Q9Y5R5 561 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS1-211ENST00000478087 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
HPS1-211ENST00000478087 DAPK1P53355 1430 aa20.27■□□□□ 0.84
HPS1-211ENST00000478087 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
HPS1-211ENST00000478087 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
HPS1-211ENST00000478087 MROH1Q8NDA8 1641 aa20.27■□□□□ 0.83
HPS1-211ENST00000478087 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
HPS1-211ENST00000478087 CEP152O94986 1710 aa20.26■□□□□ 0.83
HPS1-211ENST00000478087 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
HPS1-211ENST00000478087 PZPP20742 1482 aa20.24■□□□□ 0.83
HPS1-211ENST00000478087 KIF15Q9NS87 1388 aa20.24■□□□□ 0.83
HPS1-211ENST00000478087 DUOX2Q9NRD8 1548 aa20.24■□□□□ 0.83
HPS1-211ENST00000478087 PTPRTO14522 1441 aa20.24■□□□□ 0.83
HPS1-211ENST00000478087 ABCC3O15438 1527 aa20.23■□□□□ 0.83
HPS1-211ENST00000478087 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
HPS1-211ENST00000478087 TNRQ92752 1358 aa20.22■□□□□ 0.83
HPS1-211ENST00000478087 SHANK2Q9UPX8 1470 aa20.22■□□□□ 0.83
HPS1-211ENST00000478087 A2ML1A8K2U0 1454 aa20.2■□□□□ 0.82
HPS1-211ENST00000478087 FAM135AQ9P2D6 1515 aa20.2■□□□□ 0.82
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HPS1-211ENST00000478087 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
HPS1-211ENST00000478087 LTBP4Q8N2S1 1624 aa20.16■□□□□ 0.82
HPS1-211ENST00000478087 ERBINQ96RT1 1412 aa20.15■□□□□ 0.82
HPS1-211ENST00000478087 PLA2R1Q13018 1463 aa20.15■□□□□ 0.82
HPS1-211ENST00000478087 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa20.14■□□□□ 0.81
HPS1-211ENST00000478087 PKD2Q13563 968 aa20.14■□□□□ 0.81
HPS1-211ENST00000478087 DEPDC5O75140 1603 aa20.13■□□□□ 0.81
HPS1-211ENST00000478087 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP20.13■□□□□ 0.81
HPS1-211ENST00000478087 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
HPS1-211ENST00000478087 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
HPS1-211ENST00000478087 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa20.12■□□□□ 0.81
HPS1-211ENST00000478087 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
HPS1-211ENST00000478087 ERVK-7P63135 1459 aa20.11■□□□□ 0.81
HPS1-211ENST00000478087 UGGT1Q9NYU2 1555 aa20.1■□□□□ 0.81
HPS1-211ENST00000478087 NLRP1Q9C000 1473 aa20.1■□□□□ 0.81
HPS1-211ENST00000478087 NEURL4Q96JN8 1562 aa20.09■□□□□ 0.81
HPS1-211ENST00000478087 ADGRL2O95490 1459 aa20.09■□□□□ 0.81
HPS1-211ENST00000478087 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
HPS1-211ENST00000478087 UBR1Q8IWV7 1749 aa20.05■□□□□ 0.8
HPS1-211ENST00000478087 ITGAEP38570 1179 aa20.05■□□□□ 0.8
HPS1-211ENST00000478087 ANKLE2Q86XL3 938 aa20.05■□□□□ 0.8
HPS1-211ENST00000478087 VWDEQ8N2E2 1590 aa20.04■□□□□ 0.8
HPS1-211ENST00000478087 KANK1Q14678 1352 aa20.04■□□□□ 0.8
HPS1-211ENST00000478087 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa20.03■□□□□ 0.8
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HPS1-211ENST00000478087 LMTK2Q8IWU2 1503 aa19.99■□□□□ 0.79
HPS1-211ENST00000478087 IQGAP1P46940 1657 aa19.97■□□□□ 0.79
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HPS1-211ENST00000478087 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
HPS1-211ENST00000478087 LTKP29376 864 aa19.97■□□□□ 0.79
HPS1-211ENST00000478087 IDI1Q13907 227 aa19.97■□□□□ 0.79
HPS1-211ENST00000478087 MED14O60244 1454 aa19.97■□□□□ 0.79
HPS1-211ENST00000478087 EFCAB6Q5THR3 1501 aa19.96■□□□□ 0.79
HPS1-211ENST00000478087 STRCP1A6NGW2 1772 aa19.95■□□□□ 0.78
HPS1-211ENST00000478087 MYO5BQ9ULV0 1848 aa19.93■□□□□ 0.78
HPS1-211ENST00000478087 TXNDC2Q86VQ3 553 aa19.93■□□□□ 0.78
HPS1-211ENST00000478087 ROCK1Q13464 1354 aa19.93■□□□□ 0.78
HPS1-211ENST00000478087 IQSEC2Q5JU85 1478 aa19.92■□□□□ 0.78
HPS1-211ENST00000478087 NOS1P29475 1434 aa19.92■□□□□ 0.78
HPS1-211ENST00000478087 UNC13BO14795 1591 aa19.91■□□□□ 0.78
HPS1-211ENST00000478087 TET3O43151 1660 aa19.91■□□□□ 0.78
HPS1-211ENST00000478087 STAG3Q9UJ98 1225 aa19.91■□□□□ 0.78
HPS1-211ENST00000478087 ARHGAP23Q9P227 1491 aa19.91■□□□□ 0.78
HPS1-211ENST00000478087 UBAP1LF5GYI3 381 aa19.9■□□□□ 0.78
HPS1-211ENST00000478087 SLIT1O75093 1534 aa19.9■□□□□ 0.78
HPS1-211ENST00000478087 GCC2Q8IWJ2 1684 aa19.9■□□□□ 0.78
HPS1-211ENST00000478087 E9PCH4 1651 aa19.89■□□□□ 0.77
HPS1-211ENST00000478087 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
HPS1-211ENST00000478087 TMEM2Q9UHN6 1383 aa19.87■□□□□ 0.77
HPS1-211ENST00000478087 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
HPS1-211ENST00000478087 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
HPS1-211ENST00000478087 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
HPS1-211ENST00000478087 IQGAP3Q86VI3 1631 aa19.85■□□□□ 0.77
HPS1-211ENST00000478087 EID1Q9Y6B2 187 aa19.85■□□□□ 0.77
HPS1-211ENST00000478087 CPS1P31327 1500 aa19.85■□□□□ 0.77
HPS1-211ENST00000478087 NUP155O75694 1391 aa19.84■□□□□ 0.77
HPS1-211ENST00000478087 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
HPS1-211ENST00000478087 SLC52A1Q9NWF4 448 aa19.83■□□□□ 0.77
HPS1-211ENST00000478087 ADGRB3O60242 1522 aa19.82■□□□□ 0.76
HPS1-211ENST00000478087 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
HPS1-211ENST00000478087 PIP4K2BP78356 416 aa19.8■□□□□ 0.76
HPS1-211ENST00000478087 SLC26A8Q96RN1 970 aa19.8■□□□□ 0.76
HPS1-211ENST00000478087 LRRC7Q96NW7 1537 aa19.8■□□□□ 0.76
HPS1-211ENST00000478087 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa19.8■□□□□ 0.76
HPS1-211ENST00000478087 ALKQ9UM73 1620 aa19.78■□□□□ 0.76
HPS1-211ENST00000478087 CHGAP10645 457 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
HPS1-211ENST00000478087 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
HPS1-211ENST00000478087 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
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