RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477486.1

RBMS1-211, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene RBMS1, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1-211ENST00000477486 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP34.36■■■■□ 3.09
RBMS1-211ENST00000477486 MYO3AQ8NEV4 1616 aa34.35■■■■□ 3.09
RBMS1-211ENST00000477486 KDM5DQ9BY66 1539 aa34.34■■■■□ 3.09
RBMS1-211ENST00000477486 MAST1Q9Y2H9 1570 aa34.32■■■■□ 3.08
RBMS1-211ENST00000477486 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP34.32■■■■□ 3.08
RBMS1-211ENST00000477486 TNRQ92752 1358 aa34.29■■■■□ 3.08
RBMS1-211ENST00000477486 PKD2Q13563 968 aa34.29■■■■□ 3.08
RBMS1-211ENST00000477486 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP34.28■■■■□ 3.08
RBMS1-211ENST00000477486 FAM135AQ9P2D6 1515 aa34.27■■■■□ 3.08
RBMS1-211ENST00000477486 A2ML1A8K2U0 1454 aa34.25■■■■□ 3.07
RBMS1-211ENST00000477486 PZPP20742 1482 aa34.25■■■■□ 3.07
RBMS1-211ENST00000477486 PTPN23Q9H3S7 1636 aa34.24■■■■□ 3.07
RBMS1-211ENST00000477486 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa34.24■■■■□ 3.07
RBMS1-211ENST00000477486 PLA2R1Q13018 1463 aa34.22■■■■□ 3.07
RBMS1-211ENST00000477486 ABCC5O15440 1437 aa34.2■■■■□ 3.06
RBMS1-211ENST00000477486 FGD6Q6ZV73 1430 aa34.19■■■■□ 3.06
RBMS1-211ENST00000477486 DUOX2Q9NRD8 1548 aa34.18■■■■□ 3.06
RBMS1-211ENST00000477486 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP34.17■■■■□ 3.06
RBMS1-211ENST00000477486 KIF15Q9NS87 1388 aa34.17■■■■□ 3.06
RBMS1-211ENST00000477486 CHIC2Q9UKJ5 165 aa34.17■■■■□ 3.06
RBMS1-211ENST00000477486 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP34.16■■■■□ 3.06
RBMS1-211ENST00000477486 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP34.16■■■■□ 3.06
RBMS1-211ENST00000477486 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP34.15■■■■□ 3.06
RBMS1-211ENST00000477486 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP34.14■■■■□ 3.06
RBMS1-211ENST00000477486 DAPK1P53355 1430 aa34.13■■■■□ 3.05
RBMS1-211ENST00000477486 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP34.13■■■■□ 3.05
RBMS1-211ENST00000477486 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP34.13■■■■□ 3.05
RBMS1-211ENST00000477486 ABCC3O15438 1527 aa34.12■■■■□ 3.05
RBMS1-211ENST00000477486 SHANK2Q9UPX8 1470 aa34.12■■■■□ 3.05
RBMS1-211ENST00000477486 LTBP4Q8N2S1 1624 aa34.12■■■■□ 3.05
RBMS1-211ENST00000477486 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP34.11■■■■□ 3.05
RBMS1-211ENST00000477486 CROCC2H7BZ55 1655 aa34.1■■■■□ 3.05
RBMS1-211ENST00000477486 ANKLE2Q86XL3 938 aa34.1■■■■□ 3.05
RBMS1-211ENST00000477486 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP34.09■■■■□ 3.05
RBMS1-211ENST00000477486 NLRP1Q9C000 1473 aa34.08■■■■□ 3.05
RBMS1-211ENST00000477486 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP34.08■■■■□ 3.05
RBMS1-211ENST00000477486 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa34.07■■■■□ 3.04
RBMS1-211ENST00000477486 ERBINQ96RT1 1412 aa34.05■■■■□ 3.04
RBMS1-211ENST00000477486 UGGT1Q9NYU2 1555 aa34.04■■■■□ 3.04
RBMS1-211ENST00000477486 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
RBMS1-211ENST00000477486 CEP152O94986 1710 aa34.03■■■■□ 3.04
RBMS1-211ENST00000477486 MROH1Q8NDA8 1641 aa34.03■■■■□ 3.04
RBMS1-211ENST00000477486 KANK1Q14678 1352 aa34.01■■■■□ 3.04
RBMS1-211ENST00000477486 ERVK-7P63135 1459 aa33.98■■■■□ 3.03
RBMS1-211ENST00000477486 IQSEC2Q5JU85 1478 aa33.98■■■■□ 3.03
RBMS1-211ENST00000477486 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP33.97■■■■□ 3.03
RBMS1-211ENST00000477486 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa33.97■■■■□ 3.03
RBMS1-211ENST00000477486 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP33.93■■■■□ 3.02
RBMS1-211ENST00000477486 UBAP1LF5GYI3 381 aa33.92■■■■□ 3.02
RBMS1-211ENST00000477486 NEURL4Q96JN8 1562 aa33.89■■■■□ 3.02
RBMS1-211ENST00000477486 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP33.88■■■■□ 3.01
RBMS1-211ENST00000477486 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa33.87■■■■□ 3.01
RBMS1-211ENST00000477486 STAG3Q9UJ98 1225 aa33.87■■■■□ 3.01
RBMS1-211ENST00000477486 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP33.85■■■■□ 3.01
RBMS1-211ENST00000477486 DEPDC5O75140 1603 aa33.84■■■■□ 3.01
RBMS1-211ENST00000477486 ADGRL2O95490 1459 aa33.82■■■■□ 3
RBMS1-211ENST00000477486 MED14O60244 1454 aa33.81■■■■□ 3
RBMS1-211ENST00000477486 TXNDC2Q86VQ3 553 aa33.79■■■■□ 3
RBMS1-211ENST00000477486 EID1Q9Y6B2 187 aa33.78■■■■□ 3
RBMS1-211ENST00000477486 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa33.78■■■■□ 3
RBMS1-211ENST00000477486 UBR1Q8IWV7 1749 aa33.77■■■■□ 3
RBMS1-211ENST00000477486 CPS1P31327 1500 aa33.77■■■■□ 3
RBMS1-211ENST00000477486 IQGAP1P46940 1657 aa33.76■■■□□ 2.99
RBMS1-211ENST00000477486 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP33.76■■■□□ 2.99
RBMS1-211ENST00000477486 ITGAEP38570 1179 aa33.75■■■□□ 2.99
RBMS1-211ENST00000477486 LMTK2Q8IWU2 1503 aa33.73■■■□□ 2.99
RBMS1-211ENST00000477486 TOM1O60784 492 aa33.72■■■□□ 2.99
RBMS1-211ENST00000477486 LTKP29376 864 aa33.72■■■□□ 2.99
RBMS1-211ENST00000477486 IDI1Q13907 227 aa33.72■■■□□ 2.99
RBMS1-211ENST00000477486 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP33.71■■■□□ 2.99
RBMS1-211ENST00000477486 VWDEQ8N2E2 1590 aa33.7■■■□□ 2.99
RBMS1-211ENST00000477486 PIP4K2BP78356 416 aa33.7■■■□□ 2.99
RBMS1-211ENST00000477486 DISP3Q9P2K9 1392 aa33.68■■■□□ 2.98
RBMS1-211ENST00000477486 PIK3C2BO00750 1634 aa33.68■■■□□ 2.98
RBMS1-211ENST00000477486 SLIT1O75093 1534 aa33.64■■■□□ 2.98
RBMS1-211ENST00000477486 TMEM2Q9UHN6 1383 aa33.64■■■□□ 2.98
RBMS1-211ENST00000477486 EFCAB6Q5THR3 1501 aa33.63■■■□□ 2.97
RBMS1-211ENST00000477486 ARHGAP23Q9P227 1491 aa33.63■■■□□ 2.97
RBMS1-211ENST00000477486 SLC52A1Q9NWF4 448 aa33.63■■■□□ 2.97
RBMS1-211ENST00000477486 NOS1P29475 1434 aa33.6■■■□□ 2.97
RBMS1-211ENST00000477486 ROCK1Q13464 1354 aa33.6■■■□□ 2.97
RBMS1-211ENST00000477486 BCANQ96GW7 911 aa33.58■■■□□ 2.97
RBMS1-211ENST00000477486 SYNMO15061 1565 aa33.58■■■□□ 2.97
RBMS1-211ENST00000477486 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP33.56■■■□□ 2.96
RBMS1-211ENST00000477486 STRCP1A6NGW2 1772 aa33.52■■■□□ 2.96
RBMS1-211ENST00000477486 TET3O43151 1660 aa33.52■■■□□ 2.96
RBMS1-211ENST00000477486 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP33.52■■■□□ 2.96
RBMS1-211ENST00000477486 CHGAP10645 457 aaKnown RBP33.51■■■□□ 2.95
RBMS1-211ENST00000477486 LRRC7Q96NW7 1537 aa33.51■■■□□ 2.95
RBMS1-211ENST00000477486 HSPA1LP34931 641 aa33.5■■■□□ 2.95
RBMS1-211ENST00000477486 SLC26A8Q96RN1 970 aa33.49■■■□□ 2.95
RBMS1-211ENST00000477486 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP33.49■■■□□ 2.95
RBMS1-211ENST00000477486 NUP155O75694 1391 aa33.48■■■□□ 2.95
RBMS1-211ENST00000477486 UNC13BO14795 1591 aa33.48■■■□□ 2.95
RBMS1-211ENST00000477486 HDGFP51858 240 aaKnown RBP33.48■■■□□ 2.95
RBMS1-211ENST00000477486 ADGRB3O60242 1522 aa33.48■■■□□ 2.95
RBMS1-211ENST00000477486 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP33.46■■■□□ 2.95
RBMS1-211ENST00000477486 GCC2Q8IWJ2 1684 aa33.45■■■□□ 2.95
RBMS1-211ENST00000477486 KCNA6P17658 529 aa33.39■■■□□ 2.94
RBMS1-211ENST00000477486 ILDR2Q71H61 639 aa33.39■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.9 ms