RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477440.6

ARHGEF3-208, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 3

Gene ARHGEF3, Length 587 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-208ENST00000477440 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa38.99■■■■□ 3.83
ARHGEF3-208ENST00000477440 PREX1Q8TCU6 1659 aa38.99■■■■□ 3.83
ARHGEF3-208ENST00000477440 NCOA1Q15788 1441 aa38.97■■■■□ 3.83
ARHGEF3-208ENST00000477440 PPP6R1Q9UPN7 881 aa38.97■■■■□ 3.83
ARHGEF3-208ENST00000477440 PTPRKQ15262 1439 aa38.97■■■■□ 3.83
ARHGEF3-208ENST00000477440 ZMYM3Q14202 1370 aa38.96■■■■□ 3.83
ARHGEF3-208ENST00000477440 MROH1Q8NDA8 1641 aa38.96■■■■□ 3.83
ARHGEF3-208ENST00000477440 KDM5DQ9BY66 1539 aa38.96■■■■□ 3.83
ARHGEF3-208ENST00000477440 ERBINQ96RT1 1412 aa38.96■■■■□ 3.83
ARHGEF3-208ENST00000477440 FAM135AQ9P2D6 1515 aa38.95■■■■□ 3.83
ARHGEF3-208ENST00000477440 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP38.94■■■■□ 3.82
ARHGEF3-208ENST00000477440 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP38.93■■■■□ 3.82
ARHGEF3-208ENST00000477440 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP38.92■■■■□ 3.82
ARHGEF3-208ENST00000477440 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP38.87■■■■□ 3.81
ARHGEF3-208ENST00000477440 DEPDC5O75140 1603 aa38.86■■■■□ 3.81
ARHGEF3-208ENST00000477440 CEP152O94986 1710 aa38.86■■■■□ 3.81
ARHGEF3-208ENST00000477440 ABCC3O15438 1527 aa38.84■■■■□ 3.81
ARHGEF3-208ENST00000477440 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP38.84■■■■□ 3.81
ARHGEF3-208ENST00000477440 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa38.84■■■■□ 3.81
ARHGEF3-208ENST00000477440 NPATQ14207 1427 aa38.83■■■■□ 3.81
ARHGEF3-208ENST00000477440 ITGAEP38570 1179 aa38.81■■■■□ 3.8
ARHGEF3-208ENST00000477440 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa38.8■■■■□ 3.8
ARHGEF3-208ENST00000477440 HSPA2P54652 639 aa38.77■■■■□ 3.8
ARHGEF3-208ENST00000477440 ROCK1Q13464 1354 aa38.77■■■■□ 3.8
ARHGEF3-208ENST00000477440 PZPP20742 1482 aa38.76■■■■□ 3.8
ARHGEF3-208ENST00000477440 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa38.75■■■■□ 3.79
ARHGEF3-208ENST00000477440 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa38.75■■■■□ 3.79
ARHGEF3-208ENST00000477440 MYO3AQ8NEV4 1616 aa38.74■■■■□ 3.79
ARHGEF3-208ENST00000477440 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP38.68■■■■□ 3.784e-7■■□□□ 12.8
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ARHGEF3-208ENST00000477440 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP38.67■■■■□ 3.78
ARHGEF3-208ENST00000477440 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP38.66■■■■□ 3.78
ARHGEF3-208ENST00000477440 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP38.63■■■■□ 3.78
ARHGEF3-208ENST00000477440 KANK1Q14678 1352 aa38.62■■■■□ 3.77
ARHGEF3-208ENST00000477440 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP38.61■■■■□ 3.77
ARHGEF3-208ENST00000477440 UNC13BO14795 1591 aa38.61■■■■□ 3.77
ARHGEF3-208ENST00000477440 TNRQ92752 1358 aa38.59■■■■□ 3.77
ARHGEF3-208ENST00000477440 LMTK2Q8IWU2 1503 aa38.58■■■■□ 3.77
ARHGEF3-208ENST00000477440 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa38.57■■■■□ 3.77
ARHGEF3-208ENST00000477440 ERVK-7P63135 1459 aa38.55■■■■□ 3.76
ARHGEF3-208ENST00000477440 STRCQ7RTU9 1775 aa38.55■■■■□ 3.76
ARHGEF3-208ENST00000477440 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa38.54■■■■□ 3.76
ARHGEF3-208ENST00000477440 GCC2Q8IWJ2 1684 aa38.53■■■■□ 3.76
ARHGEF3-208ENST00000477440 A2ML1A8K2U0 1454 aa38.51■■■■□ 3.76
ARHGEF3-208ENST00000477440 EFCAB6Q5THR3 1501 aa38.51■■■■□ 3.76
ARHGEF3-208ENST00000477440 TET3O43151 1660 aa38.46■■■■□ 3.75
ARHGEF3-208ENST00000477440 NAIPQ13075 1403 aa38.46■■■■□ 3.75
ARHGEF3-208ENST00000477440 IQGAP3Q86VI3 1631 aa38.45■■■■□ 3.75
ARHGEF3-208ENST00000477440 NLRP1Q9C000 1473 aa38.44■■■■□ 3.74
ARHGEF3-208ENST00000477440 HFM1A2PYH4 1435 aa38.38■■■■□ 3.74
ARHGEF3-208ENST00000477440 PLA2R1Q13018 1463 aa38.36■■■■□ 3.73
ARHGEF3-208ENST00000477440 UGGT1Q9NYU2 1555 aa38.36■■■■□ 3.73
ARHGEF3-208ENST00000477440 E9PCH4 1651 aa38.33■■■■□ 3.73
ARHGEF3-208ENST00000477440 NUP155O75694 1391 aa38.33■■■■□ 3.73
ARHGEF3-208ENST00000477440 SYNMO15061 1565 aa38.33■■■■□ 3.73
ARHGEF3-208ENST00000477440 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP38.32■■■■□ 3.72
ARHGEF3-208ENST00000477440 UBR1Q8IWV7 1749 aa38.3■■■■□ 3.72
ARHGEF3-208ENST00000477440 NOS1P29475 1434 aa38.29■■■■□ 3.72
ARHGEF3-208ENST00000477440 PIK3C2BO00750 1634 aa38.27■■■■□ 3.72
ARHGEF3-208ENST00000477440 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP38.27■■■■□ 3.72
ARHGEF3-208ENST00000477440 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa38.24■■■■□ 3.71
ARHGEF3-208ENST00000477440 PTPRTO14522 1441 aa38.23■■■■□ 3.71
ARHGEF3-208ENST00000477440 DMRT2Q9Y5R5 561 aa38.22■■■■□ 3.71
ARHGEF3-208ENST00000477440 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP38.2■■■■□ 3.71
ARHGEF3-208ENST00000477440 PKD2Q13563 968 aa38.18■■■■□ 3.7
ARHGEF3-208ENST00000477440 NEURL4Q96JN8 1562 aa38.18■■■■□ 3.7
ARHGEF3-208ENST00000477440 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP38.16■■■■□ 3.7
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ARHGEF3-208ENST00000477440 ADGRB3O60242 1522 aa38.11■■■■□ 3.69
ARHGEF3-208ENST00000477440 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa38.1■■■■□ 3.69
ARHGEF3-208ENST00000477440 MYO5BQ9ULV0 1848 aa38.08■■■■□ 3.69
ARHGEF3-208ENST00000477440 TRIM52Q96A61 297 aa38.08■■■■□ 3.69
ARHGEF3-208ENST00000477440 SLIT1O75093 1534 aa38.07■■■■□ 3.69
ARHGEF3-208ENST00000477440 SLC52A1Q9NWF4 448 aa38.07■■■■□ 3.68
ARHGEF3-208ENST00000477440 ANKLE2Q86XL3 938 aa38.06■■■■□ 3.68
ARHGEF3-208ENST00000477440 ARHGAP23Q9P227 1491 aa38.06■■■■□ 3.68
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ARHGEF3-208ENST00000477440 MED14O60244 1454 aa38.02■■■■□ 3.68
ARHGEF3-208ENST00000477440 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa38.01■■■■□ 3.67
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ARHGEF3-208ENST00000477440 SETD5Q9C0A6 1442 aa38■■■■□ 3.67
ARHGEF3-208ENST00000477440 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP37.98■■■■□ 3.67
ARHGEF3-208ENST00000477440 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP37.98■■■■□ 3.67
ARHGEF3-208ENST00000477440 TMEM2Q9UHN6 1383 aa37.98■■■■□ 3.67
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ARHGEF3-208ENST00000477440 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP37.93■■■■□ 3.66
ARHGEF3-208ENST00000477440 TRPM2O94759 1503 aa37.92■■■■□ 3.66
ARHGEF3-208ENST00000477440 CLTCL1P53675 1640 aa37.9■■■■□ 3.66
ARHGEF3-208ENST00000477440 TXNDC2Q86VQ3 553 aa37.9■■■■□ 3.66
ARHGEF3-208ENST00000477440 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa37.9■■■■□ 3.66
ARHGEF3-208ENST00000477440 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP37.88■■■■□ 3.66
ARHGEF3-208ENST00000477440 EID1Q9Y6B2 187 aa37.86■■■■□ 3.65
ARHGEF3-208ENST00000477440 CHGAP10645 457 aaKnown RBP37.85■■■■□ 3.65
ARHGEF3-208ENST00000477440 CERKQ8TCT0 537 aa37.84■■■■□ 3.65
ARHGEF3-208ENST00000477440 ZFYVE9O95405 1425 aa37.84■■■■□ 3.65
ARHGEF3-208ENST00000477440 RIMS2Q9UQ26 1411 aa37.8■■■■□ 3.64
ARHGEF3-208ENST00000477440 KIF1BO60333 1816 aa37.8■■■■□ 3.64
ARHGEF3-208ENST00000477440 MPHOSPH9Q99550 1183 aa37.79■■■■□ 3.64
ARHGEF3-208ENST00000477440 FOXD1Q16676 465 aa37.78■■■■□ 3.64
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