RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476817.1

CTBP2-208, Transcript of C-terminal binding protein 2, human

TSL 3

Gene CTBP2, Length 705 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTBP2-208	ENST00000476817	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	32.54	■■■□□ 2.8
CTBP2-208	ENST00000476817	FBXO41	Q8TF61	875 aa		32.53	■■■□□ 2.8
CTBP2-208	ENST00000476817	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	32.51	■■■□□ 2.79
CTBP2-208	ENST00000476817	NCOA1	Q15788	1441 aa		32.51	■■■□□ 2.79
CTBP2-208	ENST00000476817	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		32.5	■■■□□ 2.79
CTBP2-208	ENST00000476817	DAPK1	P53355	1430 aa		32.5	■■■□□ 2.79
CTBP2-208	ENST00000476817	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		32.48	■■■□□ 2.79
CTBP2-208	ENST00000476817	PTPRT	O14522	1441 aa		32.48	■■■□□ 2.79
CTBP2-208	ENST00000476817	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		32.47	■■■□□ 2.79
CTBP2-208	ENST00000476817	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		32.47	■■■□□ 2.79
CTBP2-208	ENST00000476817	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	32.47	■■■□□ 2.79
CTBP2-208	ENST00000476817	PZP	P20742	1482 aa		32.47	■■■□□ 2.79
CTBP2-208	ENST00000476817	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		32.46	■■■□□ 2.79
CTBP2-208	ENST00000476817	KIF15	Q9NS87	1388 aa		32.45	■■■□□ 2.79
CTBP2-208	ENST00000476817	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	32.45	■■■□□ 2.79
CTBP2-208	ENST00000476817	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	32.45	■■■□□ 2.78
CTBP2-208	ENST00000476817	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	32.44	■■■□□ 2.78
CTBP2-208	ENST00000476817	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		32.44	■■■□□ 2.78
CTBP2-208	ENST00000476817	CERK	Q8TCT0	537 aa		32.44	■■■□□ 2.78
CTBP2-208	ENST00000476817	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	32.43	■■■□□ 2.78
CTBP2-208	ENST00000476817	TNR	Q92752	1358 aa		32.43	■■■□□ 2.78
CTBP2-208	ENST00000476817	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		32.4	■■■□□ 2.78
CTBP2-208	ENST00000476817	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		32.4	■■■□□ 2.78
CTBP2-208	ENST00000476817	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		32.4	■■■□□ 2.78
CTBP2-208	ENST00000476817	ABCC3	O15438	1527 aa		32.4	■■■□□ 2.78
CTBP2-208	ENST00000476817	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		32.38	■■■□□ 2.77
CTBP2-208	ENST00000476817	PLA2R1	Q13018	1463 aa		32.37	■■■□□ 2.77
CTBP2-208	ENST00000476817	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		32.37	■■■□□ 2.77
CTBP2-208	ENST00000476817	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
CTBP2-208	ENST00000476817	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		32.35	■■■□□ 2.77
CTBP2-208	ENST00000476817	PKD2	Q13563	968 aa		32.35	■■■□□ 2.77
CTBP2-208	ENST00000476817	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	32.33	■■■□□ 2.77
CTBP2-208	ENST00000476817	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	32.27	■■■□□ 2.76
CTBP2-208	ENST00000476817	NLRP1	Q9C000	1473 aa		32.27	■■■□□ 2.76
CTBP2-208	ENST00000476817	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	32.26	■■■□□ 2.76
CTBP2-208	ENST00000476817	ADGRL2	O95490	1459 aa		32.25	■■■□□ 2.75
CTBP2-208	ENST00000476817	CEP152	O94986	1710 aa		32.25	■■■□□ 2.75
CTBP2-208	ENST00000476817	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		32.24	■■■□□ 2.75
CTBP2-208	ENST00000476817	ERVK-7	P63135	1459 aa		32.23	■■■□□ 2.75
CTBP2-208	ENST00000476817	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	32.22	■■■□□ 2.75
CTBP2-208	ENST00000476817	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		32.22	■■■□□ 2.75
CTBP2-208	ENST00000476817	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	32.21	■■■□□ 2.75
CTBP2-208	ENST00000476817	DEPDC5	O75140	1603 aa		32.2	■■■□□ 2.75
CTBP2-208	ENST00000476817	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		32.19	■■■□□ 2.74
CTBP2-208	ENST00000476817	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		32.19	■■■□□ 2.74
CTBP2-208	ENST00000476817	KANK1	Q14678	1352 aa		32.19	■■■□□ 2.74
CTBP2-208	ENST00000476817	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	32.19	■■■□□ 2.74	9e-7	■■■■□ 23.2
CTBP2-208	ENST00000476817	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	32.16	■■■□□ 2.74
CTBP2-208	ENST00000476817	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		32.15	■■■□□ 2.74
CTBP2-208	ENST00000476817	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		32.12	■■■□□ 2.73
CTBP2-208	ENST00000476817	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
CTBP2-208	ENST00000476817	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		32.11	■■■□□ 2.73
CTBP2-208	ENST00000476817	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		32.1	■■■□□ 2.73
CTBP2-208	ENST00000476817	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		32.1	■■■□□ 2.73
CTBP2-208	ENST00000476817	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	32.07	■■■□□ 2.72
CTBP2-208	ENST00000476817	ROCK1	Q13464	1354 aa		32.04	■■■□□ 2.72
CTBP2-208	ENST00000476817	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		32.03	■■■□□ 2.72
CTBP2-208	ENST00000476817	MED14	O60244	1454 aa		32.03	■■■□□ 2.72
CTBP2-208	ENST00000476817	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	32	■■■□□ 2.71
CTBP2-208	ENST00000476817	ITGAE	P38570	1179 aa		32	■■■□□ 2.71
CTBP2-208	ENST00000476817	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		31.99	■■■□□ 2.71
CTBP2-208	ENST00000476817	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		31.97	■■■□□ 2.71
CTBP2-208	ENST00000476817	NOS1	P29475	1434 aa		31.95	■■■□□ 2.71
CTBP2-208	ENST00000476817	IDI1	Q13907	227 aa		31.95	■■■□□ 2.71
CTBP2-208	ENST00000476817	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		31.92	■■■□□ 2.7
CTBP2-208	ENST00000476817	LTK	P29376	864 aa		31.92	■■■□□ 2.7
CTBP2-208	ENST00000476817	PIK3C2B	O00750	1634 aa		31.91	■■■□□ 2.7
CTBP2-208	ENST00000476817	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		31.91	■■■□□ 2.7
CTBP2-208	ENST00000476817	SLIT1	O75093	1534 aa		31.9	■■■□□ 2.7
CTBP2-208	ENST00000476817	SYNM	O15061	1565 aa		31.9	■■■□□ 2.7
CTBP2-208	ENST00000476817	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		31.9	■■■□□ 2.7
CTBP2-208	ENST00000476817	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	31.9	■■■□□ 2.7
CTBP2-208	ENST00000476817	IQGAP1	P46940	1657 aa		31.89	■■■□□ 2.7
CTBP2-208	ENST00000476817	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	31.89	■■■□□ 2.7
CTBP2-208	ENST00000476817	UNC13B	O14795	1591 aa		31.89	■■■□□ 2.7
CTBP2-208	ENST00000476817	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	31.88	■■■□□ 2.69
CTBP2-208	ENST00000476817	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		31.87	■■■□□ 2.69
CTBP2-208	ENST00000476817	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		31.87	■■■□□ 2.69
CTBP2-208	ENST00000476817	CPS1	P31327	1500 aa		31.86	■■■□□ 2.69
CTBP2-208	ENST00000476817	EID1	Q9Y6B2	187 aa		31.85	■■■□□ 2.69
CTBP2-208	ENST00000476817	TET3	O43151	1660 aa		31.85	■■■□□ 2.69
CTBP2-208	ENST00000476817	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		31.84	■■■□□ 2.69
CTBP2-208	ENST00000476817	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	31.81	■■■□□ 2.68
CTBP2-208	ENST00000476817	NUP155	O75694	1391 aa		31.81	■■■□□ 2.68
CTBP2-208	ENST00000476817	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		31.77	■■■□□ 2.68
CTBP2-208	ENST00000476817	ADGRB3	O60242	1522 aa		31.76	■■■□□ 2.68
CTBP2-208	ENST00000476817	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		31.76	■■■□□ 2.67
CTBP2-208	ENST00000476817		E9PCH4	1651 aa		31.72	■■■□□ 2.67
CTBP2-208	ENST00000476817	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		31.71	■■■□□ 2.67
CTBP2-208	ENST00000476817	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		31.67	■■■□□ 2.66
CTBP2-208	ENST00000476817	TOM1	O60784	492 aa		31.67	■■■□□ 2.66
CTBP2-208	ENST00000476817	NAIP	Q13075	1403 aa		31.66	■■■□□ 2.66
CTBP2-208	ENST00000476817	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		31.63	■■■□□ 2.65
CTBP2-208	ENST00000476817	ZFYVE9	O95405	1425 aa		31.63	■■■□□ 2.65
CTBP2-208	ENST00000476817	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		31.63	■■■□□ 2.65
CTBP2-208	ENST00000476817	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	31.62	■■■□□ 2.65
CTBP2-208	ENST00000476817	PIP4K2B	P78356	416 aa		31.61	■■■□□ 2.65
CTBP2-208	ENST00000476817	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		31.6	■■■□□ 2.65
CTBP2-208	ENST00000476817	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	31.59	■■■□□ 2.65
CTBP2-208	ENST00000476817	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	31.58	■■■□□ 2.65

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