RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 DUOX2Q9NRD8 1548 aa20.53■□□□□ 0.88
PRAME-211ENST00000476336 STRCQ7RTU9 1775 aa20.52■□□□□ 0.88
PRAME-211ENST00000476336 CERKQ8TCT0 537 aa20.51■□□□□ 0.87
PRAME-211ENST00000476336 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa20.5■□□□□ 0.87
PRAME-211ENST00000476336 ZMYM3Q14202 1370 aa20.49■□□□□ 0.87
PRAME-211ENST00000476336 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PRAME-211ENST00000476336 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PRAME-211ENST00000476336 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
PRAME-211ENST00000476336 NPATQ14207 1427 aa20.48■□□□□ 0.87
PRAME-211ENST00000476336 KIF15Q9NS87 1388 aa20.47■□□□□ 0.87
PRAME-211ENST00000476336 ERBINQ96RT1 1412 aa20.47■□□□□ 0.87
PRAME-211ENST00000476336 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PRAME-211ENST00000476336 KDM5DQ9BY66 1539 aa20.46■□□□□ 0.87
PRAME-211ENST00000476336 ADGRL2O95490 1459 aa20.44■□□□□ 0.86
PRAME-211ENST00000476336 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa20.44■□□□□ 0.86
PRAME-211ENST00000476336 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
PRAME-211ENST00000476336 NCOA1Q15788 1441 aa20.44■□□□□ 0.86
PRAME-211ENST00000476336 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa20.42■□□□□ 0.86
PRAME-211ENST00000476336 PTPRTO14522 1441 aa20.42■□□□□ 0.86
PRAME-211ENST00000476336 CHIC2Q9UKJ5 165 aa20.39■□□□□ 0.85
PRAME-211ENST00000476336 PTPRKQ15262 1439 aa20.37■□□□□ 0.85
PRAME-211ENST00000476336 PZPP20742 1482 aa20.37■□□□□ 0.85
PRAME-211ENST00000476336 ROCK1Q13464 1354 aa20.36■□□□□ 0.85
PRAME-211ENST00000476336 KANK1Q14678 1352 aa20.36■□□□□ 0.85
PRAME-211ENST00000476336 DEPDC5O75140 1603 aa20.36■□□□□ 0.85
PRAME-211ENST00000476336 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
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PRAME-211ENST00000476336 ABCC3O15438 1527 aa20.33■□□□□ 0.85
PRAME-211ENST00000476336 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa20.32■□□□□ 0.84
PRAME-211ENST00000476336 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa20.31■□□□□ 0.84
PRAME-211ENST00000476336 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PRAME-211ENST00000476336 MYO3AQ8NEV4 1616 aa20.3■□□□□ 0.84
PRAME-211ENST00000476336 CEP152O94986 1710 aa20.29■□□□□ 0.84
PRAME-211ENST00000476336 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa20.28■□□□□ 0.84
PRAME-211ENST00000476336 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
PRAME-211ENST00000476336 TNRQ92752 1358 aa20.27■□□□□ 0.84
PRAME-211ENST00000476336 LTBP4Q8N2S1 1624 aa20.27■□□□□ 0.83
PRAME-211ENST00000476336 PKD2Q13563 968 aa20.26■□□□□ 0.83
PRAME-211ENST00000476336 LMTK2Q8IWU2 1503 aa20.26■□□□□ 0.83
PRAME-211ENST00000476336 VWDEQ8N2E2 1590 aa20.25■□□□□ 0.83
PRAME-211ENST00000476336 NLRP1Q9C000 1473 aa20.25■□□□□ 0.83
PRAME-211ENST00000476336 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.25■□□□□ 0.835e-17■■□□□ 11.4
PRAME-211ENST00000476336 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa20.25■□□□□ 0.83
PRAME-211ENST00000476336 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa20.25■□□□□ 0.83
PRAME-211ENST00000476336 A2ML1A8K2U0 1454 aa20.24■□□□□ 0.83
PRAME-211ENST00000476336 PLA2R1Q13018 1463 aa20.24■□□□□ 0.83
PRAME-211ENST00000476336 ITGAEP38570 1179 aa20.23■□□□□ 0.83
PRAME-211ENST00000476336 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PRAME-211ENST00000476336 IQSEC2Q5JU85 1478 aa20.23■□□□□ 0.83
PRAME-211ENST00000476336 ERVK-7P63135 1459 aa20.21■□□□□ 0.83
PRAME-211ENST00000476336 UNC13BO14795 1591 aa20.21■□□□□ 0.83
PRAME-211ENST00000476336 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
PRAME-211ENST00000476336 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PRAME-211ENST00000476336 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PRAME-211ENST00000476336 EFCAB6Q5THR3 1501 aa20.17■□□□□ 0.82
PRAME-211ENST00000476336 TET3O43151 1660 aa20.16■□□□□ 0.82
PRAME-211ENST00000476336 UGGT1Q9NYU2 1555 aa20.16■□□□□ 0.82
PRAME-211ENST00000476336 GCC2Q8IWJ2 1684 aa20.15■□□□□ 0.82
PRAME-211ENST00000476336 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PRAME-211ENST00000476336 IQGAP3Q86VI3 1631 aa20.13■□□□□ 0.81
PRAME-211ENST00000476336 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PRAME-211ENST00000476336 HFM1A2PYH4 1435 aa20.1■□□□□ 0.81
PRAME-211ENST00000476336 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
PRAME-211ENST00000476336 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PRAME-211ENST00000476336 NAIPQ13075 1403 aa20.1■□□□□ 0.81
PRAME-211ENST00000476336 NUP155O75694 1391 aa20.09■□□□□ 0.81
PRAME-211ENST00000476336 ANKLE2Q86XL3 938 aa20.09■□□□□ 0.81
PRAME-211ENST00000476336 SLC52A1Q9NWF4 448 aa20.09■□□□□ 0.81
PRAME-211ENST00000476336 NOS1P29475 1434 aa20.09■□□□□ 0.81
PRAME-211ENST00000476336 UBR1Q8IWV7 1749 aa20.07■□□□□ 0.8
PRAME-211ENST00000476336 UBAP1LF5GYI3 381 aa20.04■□□□□ 0.8
PRAME-211ENST00000476336 STAG3Q9UJ98 1225 aa20.04■□□□□ 0.8
PRAME-211ENST00000476336 DISP3Q9P2K9 1392 aa20.04■□□□□ 0.8
PRAME-211ENST00000476336 NEURL4Q96JN8 1562 aa20.04■□□□□ 0.8
PRAME-211ENST00000476336 E9PCH4 1651 aa20.03■□□□□ 0.8
PRAME-211ENST00000476336 SYNMO15061 1565 aa20.03■□□□□ 0.8
PRAME-211ENST00000476336 PIK3C2BO00750 1634 aa20.02■□□□□ 0.8
PRAME-211ENST00000476336 MED14O60244 1454 aa20.02■□□□□ 0.8
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PRAME-211ENST00000476336 CPS1P31327 1500 aa19.99■□□□□ 0.79
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PRAME-211ENST00000476336 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
PRAME-211ENST00000476336 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
PRAME-211ENST00000476336 IQGAP1P46940 1657 aa19.96■□□□□ 0.79
PRAME-211ENST00000476336 TRIM52Q96A61 297 aa19.95■□□□□ 0.78
PRAME-211ENST00000476336 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa19.94■□□□□ 0.78
PRAME-211ENST00000476336 ILDR2Q71H61 639 aa19.94■□□□□ 0.78
PRAME-211ENST00000476336 TXNDC2Q86VQ3 553 aa19.94■□□□□ 0.78
PRAME-211ENST00000476336 TOM1O60784 492 aa19.93■□□□□ 0.78
PRAME-211ENST00000476336 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa19.91■□□□□ 0.78
PRAME-211ENST00000476336 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
PRAME-211ENST00000476336 SETD5Q9C0A6 1442 aa19.89■□□□□ 0.77
PRAME-211ENST00000476336 LTKP29376 864 aa19.88■□□□□ 0.77
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