RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472108.1

USP20-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

TSL 2

Gene USP20, Length 1,811 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-204ENST00000472108 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.56■■□□□ 1.36
USP20-204ENST00000472108 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.56■■□□□ 1.36
USP20-204ENST00000472108 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
USP20-204ENST00000472108 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
USP20-204ENST00000472108 RICTORQ6R327 1708 aa23.53■■□□□ 1.36
USP20-204ENST00000472108 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.52■■□□□ 1.36
USP20-204ENST00000472108 TSPOAP1O95153 1857 aa23.52■■□□□ 1.36
USP20-204ENST00000472108 DEPDC5O75140 1603 aa23.51■■□□□ 1.35
USP20-204ENST00000472108 A2MP01023 1474 aa23.51■■□□□ 1.35
USP20-204ENST00000472108 KIF3BO15066 747 aa23.51■■□□□ 1.35
USP20-204ENST00000472108 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.47■■□□□ 1.35
USP20-204ENST00000472108 KANK1Q14678 1352 aa23.46■■□□□ 1.35
USP20-204ENST00000472108 ABCA6Q8N139 1617 aa23.45■■□□□ 1.34
USP20-204ENST00000472108 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.45■■□□□ 1.34
USP20-204ENST00000472108 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.44■■□□□ 1.34
USP20-204ENST00000472108 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.43■■□□□ 1.34
USP20-204ENST00000472108 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
USP20-204ENST00000472108 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.42■■□□□ 1.34
USP20-204ENST00000472108 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.41■■□□□ 1.34
USP20-204ENST00000472108 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.41■■□□□ 1.34
USP20-204ENST00000472108 ATP10AO60312 1499 aa23.41■■□□□ 1.34
USP20-204ENST00000472108 PLA2R1Q13018 1463 aa23.4■■□□□ 1.34
USP20-204ENST00000472108 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
USP20-204ENST00000472108 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.39■■□□□ 1.33
USP20-204ENST00000472108 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.38■■□□□ 1.33
USP20-204ENST00000472108 TET3O43151 1660 aa23.37■■□□□ 1.33
USP20-204ENST00000472108 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.37■■□□□ 1.33
USP20-204ENST00000472108 E9PCH4 1651 aa23.35■■□□□ 1.33
USP20-204ENST00000472108 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
USP20-204ENST00000472108 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.33■■□□□ 1.33
USP20-204ENST00000472108 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
USP20-204ENST00000472108 GGT6Q6P531 493 aa23.31■■□□□ 1.32
USP20-204ENST00000472108 PTPRTO14522 1441 aa23.31■■□□□ 1.32
USP20-204ENST00000472108 NBPF8Q3BBV2 869 aa23.29■■□□□ 1.32
USP20-204ENST00000472108 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.27■■□□□ 1.32
USP20-204ENST00000472108 TRPM2O94759 1503 aa23.26■■□□□ 1.31
USP20-204ENST00000472108 REREQ9P2R6 1566 aa23.25■■□□□ 1.31
USP20-204ENST00000472108 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.25■■□□□ 1.31
USP20-204ENST00000472108 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.24■■□□□ 1.31
USP20-204ENST00000472108 CEP152O94986 1710 aa23.24■■□□□ 1.31
USP20-204ENST00000472108 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.23■■□□□ 1.31
USP20-204ENST00000472108 ABCC3O15438 1527 aa23.22■■□□□ 1.31
USP20-204ENST00000472108 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.22■■□□□ 1.31
USP20-204ENST00000472108 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
USP20-204ENST00000472108 AGLP35573 1532 aa23.2■■□□□ 1.3
USP20-204ENST00000472108 RGL3Q3MIN7 710 aa23.19■■□□□ 1.3
USP20-204ENST00000472108 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.18■■□□□ 1.3
USP20-204ENST00000472108 NPATQ14207 1427 aa23.18■■□□□ 1.3
USP20-204ENST00000472108 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.18■■□□□ 1.3
USP20-204ENST00000472108 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.17■■□□□ 1.3
USP20-204ENST00000472108 CLTCL1P53675 1640 aa23.17■■□□□ 1.3
USP20-204ENST00000472108 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.16■■□□□ 1.3
USP20-204ENST00000472108 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
USP20-204ENST00000472108 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.16■■□□□ 1.3
USP20-204ENST00000472108 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
USP20-204ENST00000472108 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
USP20-204ENST00000472108 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.14■■□□□ 1.3
USP20-204ENST00000472108 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.14■■□□□ 1.3
USP20-204ENST00000472108 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
USP20-204ENST00000472108 NEURL4Q96JN8 1562 aa23.11■■□□□ 1.29
USP20-204ENST00000472108 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.11■■□□□ 1.29
USP20-204ENST00000472108 RALGAPBQ86X10 1494 aa23.11■■□□□ 1.29
USP20-204ENST00000472108 PRAG1Q86YV5 1406 aa23.1■■□□□ 1.29
USP20-204ENST00000472108 STAC3Q96MF2 364 aa23.1■■□□□ 1.29
USP20-204ENST00000472108 NOS1P29475 1434 aa23.08■■□□□ 1.29
USP20-204ENST00000472108 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.08■■□□□ 1.28
USP20-204ENST00000472108 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.07■■□□□ 1.28
USP20-204ENST00000472108 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
USP20-204ENST00000472108 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
USP20-204ENST00000472108 KIF1BO60333 1816 aa23.04■■□□□ 1.28
USP20-204ENST00000472108 CARD11Q9BXL7 1154 aa23.02■■□□□ 1.28
USP20-204ENST00000472108 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa23.01■■□□□ 1.27
USP20-204ENST00000472108 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
USP20-204ENST00000472108 USP47Q96K76 1375 aa23■■□□□ 1.27
USP20-204ENST00000472108 MLECQ14165 292 aa22.99■■□□□ 1.27
USP20-204ENST00000472108 SYNMO15061 1565 aa22.98■■□□□ 1.27
USP20-204ENST00000472108 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.98■■□□□ 1.27
USP20-204ENST00000472108 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
USP20-204ENST00000472108 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.98■■□□□ 1.27
USP20-204ENST00000472108 PIK3C2BO00750 1634 aa22.97■■□□□ 1.27
USP20-204ENST00000472108 ADGRB3O60242 1522 aa22.97■■□□□ 1.27
USP20-204ENST00000472108 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
USP20-204ENST00000472108 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
USP20-204ENST00000472108 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.96■■□□□ 1.27
USP20-204ENST00000472108 MIER1Q8N108 512 aa22.96■■□□□ 1.27
USP20-204ENST00000472108 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.95■■□□□ 1.26
USP20-204ENST00000472108 MADDQ8WXG6 1647 aa22.95■■□□□ 1.26
USP20-204ENST00000472108 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
USP20-204ENST00000472108 MROH2AA6NES4 1674 aa22.94■■□□□ 1.26
USP20-204ENST00000472108 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.94■■□□□ 1.26
USP20-204ENST00000472108 MYOM2P54296 1465 aa22.94■■□□□ 1.26
USP20-204ENST00000472108 IDI1Q13907 227 aa22.94■■□□□ 1.26
USP20-204ENST00000472108 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
USP20-204ENST00000472108 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
USP20-204ENST00000472108 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.92■■□□□ 1.26
USP20-204ENST00000472108 ERVK-7P63135 1459 aa22.92■■□□□ 1.26
USP20-204ENST00000472108 LAMC1P11047 1609 aa22.91■■□□□ 1.26
USP20-204ENST00000472108 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
USP20-204ENST00000472108 IFT172Q9UG01 1749 aa22.9■■□□□ 1.26
USP20-204ENST00000472108 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
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