RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470356.3

HMG20B-209, Transcript of high mobility group 20B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HMG20B, Length 806 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20B-209ENST00000470356 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa49.22■■■■■ 5.47
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HMG20B-209ENST00000470356 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP49.15■■■■■ 5.46
HMG20B-209ENST00000470356 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa49.15■■■■■ 5.46
HMG20B-209ENST00000470356 PZPP20742 1482 aa49.07■■■■■ 5.45
HMG20B-209ENST00000470356 PLA2R1Q13018 1463 aa49.07■■■■■ 5.45
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HMG20B-209ENST00000470356 LTBP4Q8N2S1 1624 aa48.94■■■■■ 5.43
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HMG20B-209ENST00000470356 SHANK2Q9UPX8 1470 aa48.93■■■■■ 5.42
HMG20B-209ENST00000470356 FGD6Q6ZV73 1430 aa48.92■■■■■ 5.42
HMG20B-209ENST00000470356 CROCC2H7BZ55 1655 aa48.91■■■■■ 5.42
HMG20B-209ENST00000470356 ABCC3O15438 1527 aa48.89■■■■■ 5.42
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HMG20B-209ENST00000470356 KIF15Q9NS87 1388 aa48.85■■■■■ 5.41
HMG20B-209ENST00000470356 DAPK1P53355 1430 aa48.83■■■■■ 5.41
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HMG20B-209ENST00000470356 IQSEC2Q5JU85 1478 aa48.75■■■■■ 5.4
HMG20B-209ENST00000470356 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP48.74■■■■■ 5.39
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HMG20B-209ENST00000470356 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa48.72■■■■■ 5.39
HMG20B-209ENST00000470356 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP48.7■■■■■ 5.39
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HMG20B-209ENST00000470356 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP48.68■■■■■ 5.38
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HMG20B-209ENST00000470356 ERVK-7P63135 1459 aa48.67■■■■■ 5.38
HMG20B-209ENST00000470356 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa48.66■■■■■ 5.38
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HMG20B-209ENST00000470356 ANKLE2Q86XL3 938 aa48.64■■■■■ 5.38
HMG20B-209ENST00000470356 NEURL4Q96JN8 1562 aa48.64■■■■■ 5.38
HMG20B-209ENST00000470356 DEPDC5O75140 1603 aa48.59■■■■■ 5.37
HMG20B-209ENST00000470356 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa48.58■■■■■ 5.37
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HMG20B-209ENST00000470356 MED14O60244 1454 aa48.49■■■■■ 5.35
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HMG20B-209ENST00000470356 LMTK2Q8IWU2 1503 aa48.4■■■■■ 5.34
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HMG20B-209ENST00000470356 NOS1P29475 1434 aa48.16■■■■■ 5.3
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HMG20B-209ENST00000470356 EID1Q9Y6B2 187 aa48.14■■■■■ 5.3
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HMG20B-209ENST00000470356 STRCP1A6NGW2 1772 aa48.09■■■■■ 5.29
HMG20B-209ENST00000470356 TOM1O60784 492 aa48.09■■■■■ 5.29
HMG20B-209ENST00000470356 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP48.09■■■■■ 5.29
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HMG20B-209ENST00000470356 DISP3Q9P2K9 1392 aa48.01■■■■■ 5.28
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HMG20B-209ENST00000470356 HSPA1LP34931 641 aa47.83■■■■■ 5.25
HMG20B-209ENST00000470356 E9PCH4 1651 aa47.82■■■■■ 5.25
HMG20B-209ENST00000470356 NUP155O75694 1391 aa47.79■■■■■ 5.24
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HMG20B-209ENST00000470356 SLC26A8Q96RN1 970 aa47.75■■■■■ 5.23
HMG20B-209ENST00000470356 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa47.74■■■■■ 5.23
HMG20B-209ENST00000470356 ZFYVE9O95405 1425 aa47.73■■■■■ 5.23
HMG20B-209ENST00000470356 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP47.73■■■■■ 5.23
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