RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470271.5

CTPS1-206, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-206ENST00000470271 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
CTPS1-206ENST00000470271 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa30.58■■■□□ 2.49
CTPS1-206ENST00000470271 PREX1Q8TCU6 1659 aa30.58■■■□□ 2.49
CTPS1-206ENST00000470271 FAM135AQ9P2D6 1515 aa30.56■■■□□ 2.48
CTPS1-206ENST00000470271 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
CTPS1-206ENST00000470271 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa30.54■■■□□ 2.48
CTPS1-206ENST00000470271 KDM5DQ9BY66 1539 aa30.54■■■□□ 2.48
CTPS1-206ENST00000470271 NCOA1Q15788 1441 aa30.54■■■□□ 2.48
CTPS1-206ENST00000470271 ERBINQ96RT1 1412 aa30.54■■■□□ 2.48
CTPS1-206ENST00000470271 NPATQ14207 1427 aa30.53■■■□□ 2.48
CTPS1-206ENST00000470271 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa30.53■■■□□ 2.48
CTPS1-206ENST00000470271 ADGRL2O95490 1459 aa30.52■■■□□ 2.48
CTPS1-206ENST00000470271 HSPA2P54652 639 aa30.52■■■□□ 2.48
CTPS1-206ENST00000470271 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.49■■■□□ 2.47
CTPS1-206ENST00000470271 PTPRKQ15262 1439 aa30.48■■■□□ 2.47
CTPS1-206ENST00000470271 MROH1Q8NDA8 1641 aa30.46■■■□□ 2.47
CTPS1-206ENST00000470271 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
CTPS1-206ENST00000470271 ABCC3O15438 1527 aa30.42■■■□□ 2.46
CTPS1-206ENST00000470271 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP30.41■■■□□ 2.46
CTPS1-206ENST00000470271 PZPP20742 1482 aa30.41■■■□□ 2.46
CTPS1-206ENST00000470271 ITGAEP38570 1179 aa30.4■■■□□ 2.46
CTPS1-206ENST00000470271 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
CTPS1-206ENST00000470271 DEPDC5O75140 1603 aa30.38■■■□□ 2.45
CTPS1-206ENST00000470271 ROCK1Q13464 1354 aa30.38■■■□□ 2.45
CTPS1-206ENST00000470271 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
CTPS1-206ENST00000470271 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP30.37■■■□□ 2.456e-6■□□□□ 11
CTPS1-206ENST00000470271 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa30.37■■■□□ 2.45
CTPS1-206ENST00000470271 CEP152O94986 1710 aa30.36■■■□□ 2.45
CTPS1-206ENST00000470271 MYO3AQ8NEV4 1616 aa30.35■■■□□ 2.45
CTPS1-206ENST00000470271 KANK1Q14678 1352 aa30.34■■■□□ 2.45
CTPS1-206ENST00000470271 TNRQ92752 1358 aa30.32■■■□□ 2.44
CTPS1-206ENST00000470271 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa30.31■■■□□ 2.44
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
CTPS1-206ENST00000470271 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP30.28■■■□□ 2.44
CTPS1-206ENST00000470271 VWDEQ8N2E2 1590 aa30.25■■■□□ 2.43
CTPS1-206ENST00000470271 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa30.25■■■□□ 2.43
CTPS1-206ENST00000470271 A2ML1A8K2U0 1454 aa30.25■■■□□ 2.43
CTPS1-206ENST00000470271 STRCQ7RTU9 1775 aa30.24■■■□□ 2.43
CTPS1-206ENST00000470271 LMTK2Q8IWU2 1503 aa30.23■■■□□ 2.43
CTPS1-206ENST00000470271 ERVK-7P63135 1459 aa30.23■■■□□ 2.43
CTPS1-206ENST00000470271 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa30.23■■■□□ 2.43
CTPS1-206ENST00000470271 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
CTPS1-206ENST00000470271 NLRP1Q9C000 1473 aa30.2■■■□□ 2.43
CTPS1-206ENST00000470271 DMRT2Q9Y5R5 561 aa30.19■■■□□ 2.42
CTPS1-206ENST00000470271 UNC13BO14795 1591 aa30.16■■■□□ 2.42
CTPS1-206ENST00000470271 PLA2R1Q13018 1463 aa30.15■■■□□ 2.42
CTPS1-206ENST00000470271 EFCAB6Q5THR3 1501 aa30.13■■■□□ 2.41
CTPS1-206ENST00000470271 PTPRTO14522 1441 aa30.1■■■□□ 2.41
CTPS1-206ENST00000470271 UGGT1Q9NYU2 1555 aa30.1■■■□□ 2.41
CTPS1-206ENST00000470271 PKD2Q13563 968 aa30.09■■■□□ 2.41
CTPS1-206ENST00000470271 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
CTPS1-206ENST00000470271 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa30.09■■■□□ 2.41
CTPS1-206ENST00000470271 TET3O43151 1660 aa30.07■■■□□ 2.41
CTPS1-206ENST00000470271 NAIPQ13075 1403 aa30.07■■■□□ 2.4
CTPS1-206ENST00000470271 NUP155O75694 1391 aa30.06■■■□□ 2.4
CTPS1-206ENST00000470271 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
CTPS1-206ENST00000470271 IQGAP3Q86VI3 1631 aa30.04■■■□□ 2.4
CTPS1-206ENST00000470271 GCC2Q8IWJ2 1684 aa30.04■■■□□ 2.4
CTPS1-206ENST00000470271 HFM1A2PYH4 1435 aa30.03■■■□□ 2.4
CTPS1-206ENST00000470271 NOS1P29475 1434 aa30.03■■■□□ 2.4
CTPS1-206ENST00000470271 SYNMO15061 1565 aa29.99■■■□□ 2.39
CTPS1-206ENST00000470271 UBR1Q8IWV7 1749 aa29.99■■■□□ 2.39
CTPS1-206ENST00000470271 ANKLE2Q86XL3 938 aa29.98■■■□□ 2.39
CTPS1-206ENST00000470271 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
CTPS1-206ENST00000470271 IDI1Q13907 227 aa29.96■■■□□ 2.39
CTPS1-206ENST00000470271 PIK3C2BO00750 1634 aa29.96■■■□□ 2.39
CTPS1-206ENST00000470271 E9PCH4 1651 aa29.95■■■□□ 2.39
CTPS1-206ENST00000470271 SLC52A1Q9NWF4 448 aa29.94■■■□□ 2.38
CTPS1-206ENST00000470271 STAG3Q9UJ98 1225 aa29.93■■■□□ 2.38
CTPS1-206ENST00000470271 NEURL4Q96JN8 1562 aa29.92■■■□□ 2.38
CTPS1-206ENST00000470271 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
CTPS1-206ENST00000470271 CERKQ8TCT0 537 aa29.87■■■□□ 2.37
CTPS1-206ENST00000470271 MED14O60244 1454 aa29.87■■■□□ 2.37
CTPS1-206ENST00000470271 ARHGAP23Q9P227 1491 aa29.87■■■□□ 2.37
CTPS1-206ENST00000470271 SLIT1O75093 1534 aa29.86■■■□□ 2.37
CTPS1-206ENST00000470271 TRIM52Q96A61 297 aa29.86■■■□□ 2.37
CTPS1-206ENST00000470271 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
CTPS1-206ENST00000470271 ADGRB3O60242 1522 aa29.85■■■□□ 2.37
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM2Q9UHN6 1383 aa29.84■■■□□ 2.37
CTPS1-206ENST00000470271 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
CTPS1-206ENST00000470271 TXNDC2Q86VQ3 553 aa29.82■■■□□ 2.36
CTPS1-206ENST00000470271 EID1Q9Y6B2 187 aa29.82■■■□□ 2.36
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
CTPS1-206ENST00000470271 LTKP29376 864 aa29.81■■■□□ 2.36
CTPS1-206ENST00000470271 LTBP4Q8N2S1 1624 aa29.81■■■□□ 2.36
CTPS1-206ENST00000470271 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
CTPS1-206ENST00000470271 IQGAP1P46940 1657 aa29.79■■■□□ 2.36
CTPS1-206ENST00000470271 FBXO41Q8TF61 875 aa29.76■■■□□ 2.35
CTPS1-206ENST00000470271 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa29.76■■■□□ 2.35
CTPS1-206ENST00000470271 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa29.74■■■□□ 2.35
CTPS1-206ENST00000470271 CHGAP10645 457 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
CTPS1-206ENST00000470271 MYO5BQ9ULV0 1848 aa29.73■■■□□ 2.35
CTPS1-206ENST00000470271 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.72■■■□□ 2.35
CTPS1-206ENST00000470271 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
CTPS1-206ENST00000470271 TRPM2O94759 1503 aa29.66■■■□□ 2.34
CTPS1-206ENST00000470271 ZFYVE9O95405 1425 aa29.66■■■□□ 2.34
CTPS1-206ENST00000470271 RIMS2Q9UQ26 1411 aa29.66■■■□□ 2.34
CTPS1-206ENST00000470271 HDGFP51858 240 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
CTPS1-206ENST00000470271 IQSEC2Q5JU85 1478 aa29.65■■■□□ 2.34
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