RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 KIAA0556O60303 1618 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-206ENST00000469947 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1-206ENST00000469947 CRBNQ96SW2 442 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1-206ENST00000469947 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1-206ENST00000469947 KIF14Q15058 1648 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1-206ENST00000469947 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1-206ENST00000469947 JPH4Q96JJ6 628 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1-206ENST00000469947 RALBP1Q15311 655 aa17.88■□□□□ 0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 DCAF11Q8TEB1 546 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 C20orf194Q5TEA3 1177 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 NFKBIBQ15653 356 aa17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 NLRP13Q86W25 1043 aa17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 RALGAPBQ86X10 1494 aa17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 GSE1Q14687 1217 aa17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 CHD1O14646 1710 aa17.83■□□□□ 0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 NUP155O75694 1391 aa17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 DDRGK1Q96HY6 314 aa17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 PDE3BQ13370 1112 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 PLB1Q6P1J6 1458 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 PARD3Q8TEW0 1356 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 E9PCH4 1651 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 NBPF1Q3BBV0 1214 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 RGL3Q3MIN7 710 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 RGS3P49796 1198 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 KDM2BQ8NHM5 1336 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 ADGBQ8N7X0 1667 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 C8orf34Q49A92 452 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-206ENST00000469947 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-206ENST00000469947 PANK3Q9H999 370 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-206ENST00000469947 ADGRL2O95490 1459 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-206ENST00000469947 ADAMTS8Q9UP79 889 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-206ENST00000469947 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-206ENST00000469947 DISP3Q9P2K9 1392 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-206ENST00000469947 INSRP06213 1382 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM161AQ3B820 660 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-206ENST00000469947 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-206ENST00000469947 ERCC6L2Q5T890 1561 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-206ENST00000469947 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-206ENST00000469947 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1-206ENST00000469947 PTPRGP23470 1445 aa17.65■□□□□ 0.42
SH3BP1-206ENST00000469947 C9orf84Q5VXU9 1444 aa17.64■□□□□ 0.42
SH3BP1-206ENST00000469947 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa17.64■□□□□ 0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 CROCC2H7BZ55 1655 aa17.64■□□□□ 0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 ABCA8O94911 1581 aa17.63■□□□□ 0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP17.63■□□□□ 0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 DUSP27Q5VZP5 1158 aa17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 SHROOM2Q13796 1616 aa17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 ITSN2Q9NZM3 1697 aa17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 PRAG1Q86YV5 1406 aa17.61■□□□□ 0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 TSPY4P0CV99 314 aa17.61■□□□□ 0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 TSPY10P0CW01 314 aa17.61■□□□□ 0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 TESK2Q96S53 571 aa17.61■□□□□ 0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 ATP10BO94823 1461 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 KDM5DQ9BY66 1539 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP17.59■□□□□ 0.413e-7■■■■□ 23.3
SH3BP1-206ENST00000469947 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP17.58■□□□□ 0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 CCDC146Q8IYE0 955 aa17.58■□□□□ 0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 CLASP1Q7Z460 1538 aa17.58■□□□□ 0.4
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SH3BP1-206ENST00000469947 CCDC144AA2RUR9 1427 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP1-206ENST00000469947 GOLGA2Q08379 1002 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP1-206ENST00000469947 ARXQ96QS3 562 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP1-206ENST00000469947 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM43AQ8N2R8 423 aa17.55■□□□□ 0.4
SH3BP1-206ENST00000469947 ERBINQ96RT1 1412 aa17.55■□□□□ 0.4
SH3BP1-206ENST00000469947 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
SH3BP1-206ENST00000469947 PLEKHD1A6NEE1 506 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-206ENST00000469947 BCAR3O75815 825 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-206ENST00000469947 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-206ENST00000469947 PPP2R1AP30153 589 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-206ENST00000469947 TMF1P82094 1093 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-206ENST00000469947 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-206ENST00000469947 SEC24BO95487 1268 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-206ENST00000469947 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1-206ENST00000469947 IGHDP01880 384 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1-206ENST00000469947 RSPH6AQ9H0K4 717 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1-206ENST00000469947 A2MP01023 1474 aa17.52■□□□□ 0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM135AQ9P2D6 1515 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 KNSTRNQ9Y448 316 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF521Q96K83 1311 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 USP19O94966 1318 aa17.5■□□□□ 0.39
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