RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468371.5

SHQ1-205, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SHQ1, Length 4,024 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-205ENST00000468371 ABCA9Q8IUA7 1624 aa8.45□□□□□ -1.06
SHQ1-205ENST00000468371 LMOD2Q6P5Q4 547 aa8.45□□□□□ -1.06
SHQ1-205ENST00000468371 LMTK3Q96Q04 1460 aa8.45□□□□□ -1.06
SHQ1-205ENST00000468371 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa8.45□□□□□ -1.06
SHQ1-205ENST00000468371 KIF13AQ9H1H9 1805 aa8.45□□□□□ -1.06
SHQ1-205ENST00000468371 FGD6Q6ZV73 1430 aa8.44□□□□□ -1.06
SHQ1-205ENST00000468371 NEFLP07196 543 aa8.44□□□□□ -1.06
SHQ1-205ENST00000468371 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa8.43□□□□□ -1.06
SHQ1-205ENST00000468371 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SHQ1-205ENST00000468371 FAM135AQ9P2D6 1515 aa8.43□□□□□ -1.06
SHQ1-205ENST00000468371 FBXO41Q8TF61 875 aa8.43□□□□□ -1.06
SHQ1-205ENST00000468371 POGKQ9P215 609 aa8.43□□□□□ -1.06
SHQ1-205ENST00000468371 TTC37Q6PGP7 1564 aa8.43□□□□□ -1.06
SHQ1-205ENST00000468371 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa8.43□□□□□ -1.06
SHQ1-205ENST00000468371 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
SHQ1-205ENST00000468371 MLH3Q9UHC1 1453 aa8.43□□□□□ -1.06
SHQ1-205ENST00000468371 MYO5CQ9NQX4 1742 aa8.42□□□□□ -1.06
SHQ1-205ENST00000468371 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa8.42□□□□□ -1.06
SHQ1-205ENST00000468371 VGFO15240 615 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
SHQ1-205ENST00000468371 STK26Q9P289 416 aa8.42□□□□□ -1.06
SHQ1-205ENST00000468371 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP8.42□□□□□ -1.06
SHQ1-205ENST00000468371 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa8.41□□□□□ -1.06
SHQ1-205ENST00000468371 TIAM1Q13009 1591 aa8.41□□□□□ -1.06
SHQ1-205ENST00000468371 A0A0G2JS52 829 aa8.4□□□□□ -1.06
SHQ1-205ENST00000468371 MIER1Q8N108 512 aa8.4□□□□□ -1.07
SHQ1-205ENST00000468371 IDI1Q13907 227 aa8.39□□□□□ -1.07
SHQ1-205ENST00000468371 ATP7AQ04656 1500 aa8.39□□□□□ -1.07
SHQ1-205ENST00000468371 POLR3GLQ9BT43 218 aa8.38□□□□□ -1.07
SHQ1-205ENST00000468371 HECW2Q9P2P5 1572 aa8.37□□□□□ -1.07
SHQ1-205ENST00000468371 DAPK1P53355 1430 aa8.37□□□□□ -1.07
SHQ1-205ENST00000468371 DISP3Q9P2K9 1392 aa8.37□□□□□ -1.07
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
SHQ1-205ENST00000468371 ITSN2Q9NZM3 1697 aa8.36□□□□□ -1.07
SHQ1-205ENST00000468371 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP8.36□□□□□ -1.07
SHQ1-205ENST00000468371 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa8.36□□□□□ -1.07
SHQ1-205ENST00000468371 FOXD1Q16676 465 aa8.35□□□□□ -1.07
SHQ1-205ENST00000468371 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
SHQ1-205ENST00000468371 ABCC1P33527 1531 aa8.35□□□□□ -1.07
SHQ1-205ENST00000468371 NUTM2FA1L443 756 aa8.35□□□□□ -1.07
SHQ1-205ENST00000468371 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
SHQ1-205ENST00000468371 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
SHQ1-205ENST00000468371 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
SHQ1-205ENST00000468371 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
SHQ1-205ENST00000468371 ABCC5O15440 1437 aa8.34□□□□□ -1.07
SHQ1-205ENST00000468371 MPHOSPH9Q99550 1183 aa8.34□□□□□ -1.07
SHQ1-205ENST00000468371 ZBTB7CA1YPR0 619 aa8.33□□□□□ -1.08
SHQ1-205ENST00000468371 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
SHQ1-205ENST00000468371 MSH6P52701 1360 aa8.33□□□□□ -1.08
SHQ1-205ENST00000468371 CADPS2Q86UW7 1296 aa8.33□□□□□ -1.08
SHQ1-205ENST00000468371 DCAF11Q8TEB1 546 aa8.32□□□□□ -1.08
SHQ1-205ENST00000468371 MAP3K1Q13233 1512 aa8.32□□□□□ -1.08
SHQ1-205ENST00000468371 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa8.32□□□□□ -1.08
SHQ1-205ENST00000468371 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
SHQ1-205ENST00000468371 DUOX2Q9NRD8 1548 aa8.32□□□□□ -1.08
SHQ1-205ENST00000468371 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa8.32□□□□□ -1.08
SHQ1-205ENST00000468371 MADDQ8WXG6 1647 aa8.31□□□□□ -1.08
SHQ1-205ENST00000468371 NPATQ14207 1427 aa8.31□□□□□ -1.08
SHQ1-205ENST00000468371 NCOA1Q15788 1441 aa8.31□□□□□ -1.08
SHQ1-205ENST00000468371 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
SHQ1-205ENST00000468371 PREX2Q70Z35 1606 aa8.31□□□□□ -1.08
SHQ1-205ENST00000468371 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa8.31□□□□□ -1.08
SHQ1-205ENST00000468371 CCDC144AA2RUR9 1427 aa8.3□□□□□ -1.08
SHQ1-205ENST00000468371 KCNA6P17658 529 aa8.3□□□□□ -1.08
SHQ1-205ENST00000468371 ERBINQ96RT1 1412 aa8.3□□□□□ -1.08
SHQ1-205ENST00000468371 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
SHQ1-205ENST00000468371 MBD5Q9P267 1494 aa8.29□□□□□ -1.08
SHQ1-205ENST00000468371 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
SHQ1-205ENST00000468371 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa8.28□□□□□ -1.08
SHQ1-205ENST00000468371 PTPN23Q9H3S7 1636 aa8.28□□□□□ -1.08
SHQ1-205ENST00000468371 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
SHQ1-205ENST00000468371 ESCO1Q5FWF5 840 aa8.28□□□□□ -1.08
SHQ1-205ENST00000468371 C19orf44Q9H6X5 657 aa8.27□□□□□ -1.08
SHQ1-205ENST00000468371 LTKP29376 864 aa8.27□□□□□ -1.09
SHQ1-205ENST00000468371 PSME1Q06323 249 aa8.27□□□□□ -1.09
SHQ1-205ENST00000468371 SETD5Q9C0A6 1442 aa8.27□□□□□ -1.09
SHQ1-205ENST00000468371 NLRP1Q9C000 1473 aa8.27□□□□□ -1.09
SHQ1-205ENST00000468371 AGLP35573 1532 aa8.27□□□□□ -1.09
SHQ1-205ENST00000468371 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
SHQ1-205ENST00000468371 ROCK1Q13464 1354 aa8.27□□□□□ -1.09
SHQ1-205ENST00000468371 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa8.26□□□□□ -1.09
SHQ1-205ENST00000468371 TBX22Q9Y458 520 aa8.26□□□□□ -1.09
SHQ1-205ENST00000468371 UGGT1Q9NYU2 1555 aa8.26□□□□□ -1.09
SHQ1-205ENST00000468371 A2ML1A8K2U0 1454 aa8.26□□□□□ -1.09
SHQ1-205ENST00000468371 TONSLQ96HA7 1378 aa8.26□□□□□ -1.09
SHQ1-205ENST00000468371 NGLY1Q96IV0 654 aa8.26□□□□□ -1.09
SHQ1-205ENST00000468371 TRAK1Q9UPV9 953 aa8.26□□□□□ -1.09
SHQ1-205ENST00000468371 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa8.25□□□□□ -1.09
SHQ1-205ENST00000468371 TMEM2Q9UHN6 1383 aa8.25□□□□□ -1.09
SHQ1-205ENST00000468371 PTPRKQ15262 1439 aa8.25□□□□□ -1.09
SHQ1-205ENST00000468371 KDM5DQ9BY66 1539 aa8.25□□□□□ -1.09
SHQ1-205ENST00000468371 SLAIN2Q9P270 581 aa8.25□□□□□ -1.09
SHQ1-205ENST00000468371 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
SHQ1-205ENST00000468371 FKBP8Q14318 412 aa8.25□□□□□ -1.09
SHQ1-205ENST00000468371 TMC1Q8TDI8 760 aa8.25□□□□□ -1.09
SHQ1-205ENST00000468371 RIMS2Q9UQ26 1411 aa8.24□□□□□ -1.09
SHQ1-205ENST00000468371 ADAMTS2O95450 1211 aa8.24□□□□□ -1.09
SHQ1-205ENST00000468371 TMEM132EQ6IEE7 984 aa8.24□□□□□ -1.09
SHQ1-205ENST00000468371 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa8.23□□□□□ -1.09
SHQ1-205ENST00000468371 PZPP20742 1482 aa8.23□□□□□ -1.09
SHQ1-205ENST00000468371 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 100.2 ms