RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468247.1

RERE-210, Transcript of arginine-glutamic acid dipeptide repeats, humanhuman

TSL 2

Gene RERE, Length 414 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RERE-210ENST00000468247 ABCC5O15440 1437 aa32.79■■■□□ 2.84
RERE-210ENST00000468247 FGD6Q6ZV73 1430 aa32.79■■■□□ 2.84
RERE-210ENST00000468247 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa32.78■■■□□ 2.84
RERE-210ENST00000468247 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP32.78■■■□□ 2.84
RERE-210ENST00000468247 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP32.78■■■□□ 2.84
RERE-210ENST00000468247 FAM135AQ9P2D6 1515 aa32.77■■■□□ 2.84
RERE-210ENST00000468247 PTPRTO14522 1441 aa32.77■■■□□ 2.84
RERE-210ENST00000468247 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP32.76■■■□□ 2.84
RERE-210ENST00000468247 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP32.76■■■□□ 2.84
RERE-210ENST00000468247 CERKQ8TCT0 537 aa32.76■■■□□ 2.83
RERE-210ENST00000468247 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP32.75■■■□□ 2.83
RERE-210ENST00000468247 PZPP20742 1482 aa32.74■■■□□ 2.83
RERE-210ENST00000468247 CROCC2H7BZ55 1655 aa32.74■■■□□ 2.83
RERE-210ENST00000468247 SHANK2Q9UPX8 1470 aa32.73■■■□□ 2.83
RERE-210ENST00000468247 DAPK1P53355 1430 aa32.71■■■□□ 2.83
RERE-210ENST00000468247 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP32.71■■■□□ 2.83
RERE-210ENST00000468247 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa32.71■■■□□ 2.83
RERE-210ENST00000468247 DUOX2Q9NRD8 1548 aa32.7■■■□□ 2.83
RERE-210ENST00000468247 TNRQ92752 1358 aa32.7■■■□□ 2.82
RERE-210ENST00000468247 MROH1Q8NDA8 1641 aa32.69■■■□□ 2.82
RERE-210ENST00000468247 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP32.69■■■□□ 2.82
RERE-210ENST00000468247 KIF15Q9NS87 1388 aa32.69■■■□□ 2.82
RERE-210ENST00000468247 A2ML1A8K2U0 1454 aa32.68■■■□□ 2.82
RERE-210ENST00000468247 ABCC3O15438 1527 aa32.68■■■□□ 2.82
RERE-210ENST00000468247 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa32.67■■■□□ 2.82
RERE-210ENST00000468247 PLA2R1Q13018 1463 aa32.66■■■□□ 2.82
RERE-210ENST00000468247 CHIC2Q9UKJ5 165 aa32.61■■■□□ 2.81
RERE-210ENST00000468247 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP32.6■■■□□ 2.81
RERE-210ENST00000468247 ERBINQ96RT1 1412 aa32.59■■■□□ 2.81
RERE-210ENST00000468247 PKD2Q13563 968 aa32.58■■■□□ 2.81
RERE-210ENST00000468247 LTBP4Q8N2S1 1624 aa32.58■■■□□ 2.81
RERE-210ENST00000468247 CEP152O94986 1710 aa32.57■■■□□ 2.8
RERE-210ENST00000468247 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP32.54■■■□□ 2.8
RERE-210ENST00000468247 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP32.53■■■□□ 2.8
RERE-210ENST00000468247 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa32.53■■■□□ 2.8
RERE-210ENST00000468247 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa32.53■■■□□ 2.8
RERE-210ENST00000468247 ERVK-7P63135 1459 aa32.52■■■□□ 2.8
RERE-210ENST00000468247 NLRP1Q9C000 1473 aa32.52■■■□□ 2.8
RERE-210ENST00000468247 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP32.49■■■□□ 2.79
RERE-210ENST00000468247 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP32.48■■■□□ 2.791e-8■■□□□ 12.6
RERE-210ENST00000468247 DEPDC5O75140 1603 aa32.48■■■□□ 2.79
RERE-210ENST00000468247 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP32.47■■■□□ 2.79
RERE-210ENST00000468247 ADGRL2O95490 1459 aa32.47■■■□□ 2.79
RERE-210ENST00000468247 UGGT1Q9NYU2 1555 aa32.46■■■□□ 2.79
RERE-210ENST00000468247 NEURL4Q96JN8 1562 aa32.45■■■□□ 2.79
RERE-210ENST00000468247 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP32.43■■■□□ 2.78
RERE-210ENST00000468247 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa32.43■■■□□ 2.78
RERE-210ENST00000468247 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP32.42■■■□□ 2.78
RERE-210ENST00000468247 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP32.42■■■□□ 2.78
RERE-210ENST00000468247 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP32.42■■■□□ 2.78
RERE-210ENST00000468247 VWDEQ8N2E2 1590 aa32.38■■■□□ 2.77
RERE-210ENST00000468247 ANKLE2Q86XL3 938 aa32.37■■■□□ 2.77
RERE-210ENST00000468247 KANK1Q14678 1352 aa32.36■■■□□ 2.77
RERE-210ENST00000468247 LMTK2Q8IWU2 1503 aa32.35■■■□□ 2.77
RERE-210ENST00000468247 IQSEC2Q5JU85 1478 aa32.34■■■□□ 2.77
RERE-210ENST00000468247 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa32.32■■■□□ 2.76
RERE-210ENST00000468247 MED14O60244 1454 aa32.3■■■□□ 2.76
RERE-210ENST00000468247 UBR1Q8IWV7 1749 aa32.3■■■□□ 2.76
RERE-210ENST00000468247 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP32.29■■■□□ 2.76
RERE-210ENST00000468247 EFCAB6Q5THR3 1501 aa32.25■■■□□ 2.75
RERE-210ENST00000468247 PIK3C2BO00750 1634 aa32.22■■■□□ 2.75
RERE-210ENST00000468247 IQGAP1P46940 1657 aa32.21■■■□□ 2.75
RERE-210ENST00000468247 SYNMO15061 1565 aa32.21■■■□□ 2.75
RERE-210ENST00000468247 ROCK1Q13464 1354 aa32.2■■■□□ 2.75
RERE-210ENST00000468247 ARHGAP23Q9P227 1491 aa32.2■■■□□ 2.75
RERE-210ENST00000468247 NOS1P29475 1434 aa32.19■■■□□ 2.74
RERE-210ENST00000468247 LTKP29376 864 aa32.19■■■□□ 2.74
RERE-210ENST00000468247 ITGAEP38570 1179 aa32.19■■■□□ 2.74
RERE-210ENST00000468247 SLIT1O75093 1534 aa32.18■■■□□ 2.74
RERE-210ENST00000468247 IDI1Q13907 227 aa32.18■■■□□ 2.74
RERE-210ENST00000468247 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP32.16■■■□□ 2.74
RERE-210ENST00000468247 CPS1P31327 1500 aa32.16■■■□□ 2.74
RERE-210ENST00000468247 UNC13BO14795 1591 aa32.15■■■□□ 2.74
RERE-210ENST00000468247 UBAP1LF5GYI3 381 aa32.14■■■□□ 2.74
RERE-210ENST00000468247 TXNDC2Q86VQ3 553 aa32.13■■■□□ 2.73
RERE-210ENST00000468247 TMEM2Q9UHN6 1383 aa32.11■■■□□ 2.73
RERE-210ENST00000468247 TET3O43151 1660 aa32.11■■■□□ 2.73
RERE-210ENST00000468247 STAG3Q9UJ98 1225 aa32.1■■■□□ 2.73
RERE-210ENST00000468247 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP32.09■■■□□ 2.73
RERE-210ENST00000468247 STRCP1A6NGW2 1772 aa32.08■■■□□ 2.73
RERE-210ENST00000468247 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP32.07■■■□□ 2.72
RERE-210ENST00000468247 EID1Q9Y6B2 187 aa32.05■■■□□ 2.72
RERE-210ENST00000468247 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP32.04■■■□□ 2.72
RERE-210ENST00000468247 SLC52A1Q9NWF4 448 aa32.04■■■□□ 2.72
RERE-210ENST00000468247 GCC2Q8IWJ2 1684 aa32.04■■■□□ 2.72
RERE-210ENST00000468247 ADGRB3O60242 1522 aa32.04■■■□□ 2.72
RERE-210ENST00000468247 IQGAP3Q86VI3 1631 aa32.01■■■□□ 2.72
RERE-210ENST00000468247 E9PCH4 1651 aa32■■■□□ 2.71
RERE-210ENST00000468247 LRRC7Q96NW7 1537 aa31.99■■■□□ 2.71
RERE-210ENST00000468247 NUP155O75694 1391 aa31.98■■■□□ 2.71
RERE-210ENST00000468247 ALKQ9UM73 1620 aa31.94■■■□□ 2.7
RERE-210ENST00000468247 TOM1O60784 492 aa31.92■■■□□ 2.7
RERE-210ENST00000468247 PIP4K2BP78356 416 aa31.92■■■□□ 2.7
RERE-210ENST00000468247 MYO5BQ9ULV0 1848 aa31.91■■■□□ 2.7
RERE-210ENST00000468247 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa31.9■■■□□ 2.7
RERE-210ENST00000468247 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP31.9■■■□□ 2.7
RERE-210ENST00000468247 SLC26A8Q96RN1 970 aa31.89■■■□□ 2.7
RERE-210ENST00000468247 ZFYVE9O95405 1425 aa31.89■■■□□ 2.7
RERE-210ENST00000468247 NAIPQ13075 1403 aa31.85■■■□□ 2.69
RERE-210ENST00000468247 RIMS2Q9UQ26 1411 aa31.85■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.3 ms