RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468077.5

TARBP1-204, Transcript of TAR (HIV-1) RNA binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene TARBP1, Length 514 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARBP1-204ENST00000468077 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.14■■□□□ 1.62
TARBP1-204ENST00000468077 TNRQ92752 1358 aa25.14■■□□□ 1.61
TARBP1-204ENST00000468077 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.14■■□□□ 1.61
TARBP1-204ENST00000468077 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
TARBP1-204ENST00000468077 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
TARBP1-204ENST00000468077 PZPP20742 1482 aa25.11■■□□□ 1.61
TARBP1-204ENST00000468077 CEP162Q5TB80 1403 aa25.11■■□□□ 1.61
TARBP1-204ENST00000468077 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.1■■□□□ 1.61
TARBP1-204ENST00000468077 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
TARBP1-204ENST00000468077 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.08■■□□□ 1.6
TARBP1-204ENST00000468077 KIF3BO15066 747 aa25.06■■□□□ 1.6
TARBP1-204ENST00000468077 PIP4K2BP78356 416 aa25.06■■□□□ 1.6
TARBP1-204ENST00000468077 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.05■■□□□ 1.6
TARBP1-204ENST00000468077 TOM1O60784 492 aa25.04■■□□□ 1.6
TARBP1-204ENST00000468077 HSPA1LP34931 641 aa25.04■■□□□ 1.6
TARBP1-204ENST00000468077 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
TARBP1-204ENST00000468077 NLRP1Q9C000 1473 aa25.03■■□□□ 1.6
TARBP1-204ENST00000468077 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.01■■□□□ 1.59
TARBP1-204ENST00000468077 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.01■■□□□ 1.59
TARBP1-204ENST00000468077 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.01■■□□□ 1.59
TARBP1-204ENST00000468077 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.01■■□□□ 1.59
TARBP1-204ENST00000468077 ANKLE2Q86XL3 938 aa25■■□□□ 1.59
TARBP1-204ENST00000468077 NCOA2Q15596 1464 aa25■■□□□ 1.59
TARBP1-204ENST00000468077 DEPDC5O75140 1603 aa24.99■■□□□ 1.59
TARBP1-204ENST00000468077 MIA2Q96PC5 1412 aa24.98■■□□□ 1.59
TARBP1-204ENST00000468077 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
TARBP1-204ENST00000468077 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
TARBP1-204ENST00000468077 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.97■■□□□ 1.59
TARBP1-204ENST00000468077 MED14O60244 1454 aa24.96■■□□□ 1.59
TARBP1-204ENST00000468077 IQGAP1P46940 1657 aa24.96■■□□□ 1.59
TARBP1-204ENST00000468077 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.95■■□□□ 1.58
TARBP1-204ENST00000468077 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
TARBP1-204ENST00000468077 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
TARBP1-204ENST00000468077 SYNMO15061 1565 aa24.91■■□□□ 1.58
TARBP1-204ENST00000468077 ABCC3O15438 1527 aa24.9■■□□□ 1.58
TARBP1-204ENST00000468077 ALKQ9UM73 1620 aa24.9■■□□□ 1.58
TARBP1-204ENST00000468077 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
TARBP1-204ENST00000468077 TSPY4P0CV99 314 aa24.88■■□□□ 1.57
TARBP1-204ENST00000468077 TSPY10P0CW01 314 aa24.88■■□□□ 1.57
TARBP1-204ENST00000468077 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
TARBP1-204ENST00000468077 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.85■■□□□ 1.57
TARBP1-204ENST00000468077 ERVK-7P63135 1459 aa24.85■■□□□ 1.57
TARBP1-204ENST00000468077 LRRC7Q96NW7 1537 aa24.84■■□□□ 1.57
TARBP1-204ENST00000468077 STRCP1A6NGW2 1772 aa24.84■■□□□ 1.57
TARBP1-204ENST00000468077 MROH1Q8NDA8 1641 aa24.79■■□□□ 1.56
TARBP1-204ENST00000468077 CEP152O94986 1710 aa24.79■■□□□ 1.56
TARBP1-204ENST00000468077 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.79■■□□□ 1.56
TARBP1-204ENST00000468077 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
TARBP1-204ENST00000468077 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.77■■□□□ 1.56
TARBP1-204ENST00000468077 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
TARBP1-204ENST00000468077 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.72■■□□□ 1.55
TARBP1-204ENST00000468077 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
TARBP1-204ENST00000468077 SLIT1O75093 1534 aa24.7■■□□□ 1.54
TARBP1-204ENST00000468077 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
TARBP1-204ENST00000468077 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.7■■□□□ 1.54
TARBP1-204ENST00000468077 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.69■■□□□ 1.54
TARBP1-204ENST00000468077 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.68■■□□□ 1.54
TARBP1-204ENST00000468077 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.65■■□□□ 1.54
TARBP1-204ENST00000468077 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
TARBP1-204ENST00000468077 ERBINQ96RT1 1412 aa24.63■■□□□ 1.53
TARBP1-204ENST00000468077 LTKP29376 864 aa24.63■■□□□ 1.53
TARBP1-204ENST00000468077 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.63■■□□□ 1.53
TARBP1-204ENST00000468077 KIF15Q9NS87 1388 aa24.63■■□□□ 1.53
TARBP1-204ENST00000468077 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.62■■□□□ 1.53
TARBP1-204ENST00000468077 PIK3C2BO00750 1634 aa24.62■■□□□ 1.53
TARBP1-204ENST00000468077 EID1Q9Y6B2 187 aa24.62■■□□□ 1.53
TARBP1-204ENST00000468077 MAP3K1Q13233 1512 aa24.61■■□□□ 1.53
TARBP1-204ENST00000468077 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.57■■□□□ 1.52
TARBP1-204ENST00000468077 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
TARBP1-204ENST00000468077 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
TARBP1-204ENST00000468077 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.56■■□□□ 1.52
TARBP1-204ENST00000468077 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.55■■□□□ 1.52
TARBP1-204ENST00000468077 KANK1Q14678 1352 aa24.54■■□□□ 1.52
TARBP1-204ENST00000468077 FAM135BQ49AJ0 1406 aa24.54■■□□□ 1.52
TARBP1-204ENST00000468077 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
TARBP1-204ENST00000468077 TMEM94Q12767 1356 aa24.53■■□□□ 1.52
TARBP1-204ENST00000468077 ABCC5O15440 1437 aa24.52■■□□□ 1.52
TARBP1-204ENST00000468077 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.52■■□□□ 1.523e-7■■■□□ 16.5
TARBP1-204ENST00000468077 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.52■■□□□ 1.52
TARBP1-204ENST00000468077 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.51■■□□□ 1.51
TARBP1-204ENST00000468077 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa24.5■■□□□ 1.51
TARBP1-204ENST00000468077 LMTK2Q8IWU2 1503 aa24.49■■□□□ 1.51
TARBP1-204ENST00000468077 DAPK1P53355 1430 aa24.48■■□□□ 1.51
TARBP1-204ENST00000468077 ADGRB3O60242 1522 aa24.47■■□□□ 1.51
TARBP1-204ENST00000468077 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
TARBP1-204ENST00000468077 NWD1Q149M9 1564 aa24.46■■□□□ 1.51
TARBP1-204ENST00000468077 KCNA6P17658 529 aa24.45■■□□□ 1.5
TARBP1-204ENST00000468077 TET3O43151 1660 aa24.44■■□□□ 1.5
TARBP1-204ENST00000468077 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.43■■□□□ 1.5
TARBP1-204ENST00000468077 IDI1Q13907 227 aa24.42■■□□□ 1.5
TARBP1-204ENST00000468077 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
TARBP1-204ENST00000468077 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.42■■□□□ 1.5
TARBP1-204ENST00000468077 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.41■■□□□ 1.5
TARBP1-204ENST00000468077 NOS1P29475 1434 aa24.4■■□□□ 1.5
TARBP1-204ENST00000468077 MSH6P52701 1360 aa24.4■■□□□ 1.5
TARBP1-204ENST00000468077 POTEAQ6S8J7 498 aa24.39■■□□□ 1.49
TARBP1-204ENST00000468077 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
TARBP1-204ENST00000468077 PHLPP1O60346 1717 aa24.36■■□□□ 1.49
TARBP1-204ENST00000468077 BCANQ96GW7 911 aa24.36■■□□□ 1.49
TARBP1-204ENST00000468077 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.35■■□□□ 1.49
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