RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467987.1

ESRRA-204, Transcript of estrogen related receptor alpha, humanhuman

TSL 3

Gene ESRRA, Length 610 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRA-204ENST00000467987 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa42.66■■■■■ 4.42
ESRRA-204ENST00000467987 PTPRTO14522 1441 aa42.65■■■■■ 4.42
ESRRA-204ENST00000467987 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa42.65■■■■■ 4.42
ESRRA-204ENST00000467987 PTPN23Q9H3S7 1636 aa42.63■■■■■ 4.41
ESRRA-204ENST00000467987 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP42.63■■■■■ 4.41
ESRRA-204ENST00000467987 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP42.6■■■■■ 4.41
ESRRA-204ENST00000467987 PZPP20742 1482 aa42.55■■■■■ 4.4
ESRRA-204ENST00000467987 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP42.55■■■■■ 4.4
ESRRA-204ENST00000467987 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP42.55■■■■■ 4.4
ESRRA-204ENST00000467987 ABCC5O15440 1437 aa42.54■■■■■ 4.4
ESRRA-204ENST00000467987 FGD6Q6ZV73 1430 aa42.54■■■■■ 4.4
ESRRA-204ENST00000467987 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP42.54■■■■■ 4.4
ESRRA-204ENST00000467987 CROCC2H7BZ55 1655 aa42.52■■■■■ 4.4
ESRRA-204ENST00000467987 SHANK2Q9UPX8 1470 aa42.51■■■■■ 4.4
ESRRA-204ENST00000467987 DUOX2Q9NRD8 1548 aa42.51■■■■■ 4.39
ESRRA-204ENST00000467987 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa42.5■■■■■ 4.39
ESRRA-204ENST00000467987 TNRQ92752 1358 aa42.5■■■■■ 4.39
ESRRA-204ENST00000467987 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP42.49■■■■■ 4.39
ESRRA-204ENST00000467987 A2ML1A8K2U0 1454 aa42.49■■■■■ 4.39
ESRRA-204ENST00000467987 PLA2R1Q13018 1463 aa42.49■■■■■ 4.39
ESRRA-204ENST00000467987 DAPK1P53355 1430 aa42.46■■■■■ 4.39
ESRRA-204ENST00000467987 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP42.46■■■■■ 4.39
ESRRA-204ENST00000467987 KIF15Q9NS87 1388 aa42.44■■■■■ 4.38
ESRRA-204ENST00000467987 PKD2Q13563 968 aa42.44■■■■■ 4.38
ESRRA-204ENST00000467987 ABCC3O15438 1527 aa42.43■■■■■ 4.38
ESRRA-204ENST00000467987 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP42.43■■■■■ 4.38
ESRRA-204ENST00000467987 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa42.42■■■■■ 4.38
ESRRA-204ENST00000467987 MROH1Q8NDA8 1641 aa42.4■■■■■ 4.38
ESRRA-204ENST00000467987 ERBINQ96RT1 1412 aa42.35■■■■■ 4.37
ESRRA-204ENST00000467987 LTBP4Q8N2S1 1624 aa42.33■■■■■ 4.37
ESRRA-204ENST00000467987 CEP152O94986 1710 aa42.32■■■■■ 4.37
ESRRA-204ENST00000467987 CHIC2Q9UKJ5 165 aa42.32■■■■■ 4.37
ESRRA-204ENST00000467987 NLRP1Q9C000 1473 aa42.3■■■■■ 4.36
ESRRA-204ENST00000467987 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa42.29■■■■■ 4.36
ESRRA-204ENST00000467987 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP42.26■■■■■ 4.36
ESRRA-204ENST00000467987 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa42.26■■■■■ 4.36
ESRRA-204ENST00000467987 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP42.25■■■■■ 4.35
ESRRA-204ENST00000467987 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP42.24■■■■■ 4.35
ESRRA-204ENST00000467987 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP42.23■■■■■ 4.35
ESRRA-204ENST00000467987 ERVK-7P63135 1459 aa42.23■■■■■ 4.35
ESRRA-204ENST00000467987 UGGT1Q9NYU2 1555 aa42.22■■■■■ 4.35
ESRRA-204ENST00000467987 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP42.21■■■■■ 4.35
ESRRA-204ENST00000467987 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP42.21■■■■■ 4.35
ESRRA-204ENST00000467987 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP42.2■■■■■ 4.35
ESRRA-204ENST00000467987 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP42.19■■■■■ 4.34
ESRRA-204ENST00000467987 DEPDC5O75140 1603 aa42.19■■■■■ 4.34
ESRRA-204ENST00000467987 ANKLE2Q86XL3 938 aa42.16■■■■■ 4.34
ESRRA-204ENST00000467987 ADGRL2O95490 1459 aa42.15■■■■■ 4.34
ESRRA-204ENST00000467987 IQSEC2Q5JU85 1478 aa42.15■■■■■ 4.34
ESRRA-204ENST00000467987 KANK1Q14678 1352 aa42.14■■■■■ 4.34
ESRRA-204ENST00000467987 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa42.14■■■■■ 4.34
ESRRA-204ENST00000467987 NEURL4Q96JN8 1562 aa42.14■■■■■ 4.34
ESRRA-204ENST00000467987 VWDEQ8N2E2 1590 aa42.01■■■■■ 4.32
ESRRA-204ENST00000467987 LMTK2Q8IWU2 1503 aa42.01■■■■■ 4.32
ESRRA-204ENST00000467987 MED14O60244 1454 aa42■■■■■ 4.31
ESRRA-204ENST00000467987 UBR1Q8IWV7 1749 aa42■■■■■ 4.31
ESRRA-204ENST00000467987 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP41.99■■■■■ 4.31
ESRRA-204ENST00000467987 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa41.98■■■■■ 4.31
ESRRA-204ENST00000467987 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP41.95■■■■■ 4.31
ESRRA-204ENST00000467987 IQGAP1P46940 1657 aa41.91■■■■■ 4.3
ESRRA-204ENST00000467987 CPS1P31327 1500 aa41.87■■■■■ 4.29
ESRRA-204ENST00000467987 EFCAB6Q5THR3 1501 aa41.87■■■■■ 4.29
ESRRA-204ENST00000467987 PIK3C2BO00750 1634 aa41.86■■■■■ 4.29
ESRRA-204ENST00000467987 UBAP1LF5GYI3 381 aa41.85■■■■■ 4.29
ESRRA-204ENST00000467987 ROCK1Q13464 1354 aa41.84■■■■■ 4.29
ESRRA-204ENST00000467987 SLIT1O75093 1534 aa41.83■■■■■ 4.29
ESRRA-204ENST00000467987 ARHGAP23Q9P227 1491 aa41.82■■■■■ 4.29
ESRRA-204ENST00000467987 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP41.81■■■■■ 4.28
ESRRA-204ENST00000467987 STAG3Q9UJ98 1225 aa41.81■■■■■ 4.28
ESRRA-204ENST00000467987 IDI1Q13907 227 aa41.8■■■■■ 4.28
ESRRA-204ENST00000467987 TXNDC2Q86VQ3 553 aa41.8■■■■■ 4.28
ESRRA-204ENST00000467987 NOS1P29475 1434 aa41.79■■■■■ 4.28
ESRRA-204ENST00000467987 LTKP29376 864 aa41.79■■■■■ 4.28
ESRRA-204ENST00000467987 SYNMO15061 1565 aa41.79■■■■■ 4.28
ESRRA-204ENST00000467987 ITGAEP38570 1179 aa41.78■■■■■ 4.28
ESRRA-204ENST00000467987 EID1Q9Y6B2 187 aa41.76■■■■■ 4.28
ESRRA-204ENST00000467987 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP41.75■■■■■ 4.27
ESRRA-204ENST00000467987 UNC13BO14795 1591 aa41.74■■■■■ 4.27
ESRRA-204ENST00000467987 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP41.73■■■■■ 4.27
ESRRA-204ENST00000467987 TET3O43151 1660 aa41.73■■■■■ 4.27
ESRRA-204ENST00000467987 TMEM2Q9UHN6 1383 aa41.73■■■■■ 4.27
ESRRA-204ENST00000467987 SLC52A1Q9NWF4 448 aa41.7■■■■■ 4.27
ESRRA-204ENST00000467987 STRCP1A6NGW2 1772 aa41.67■■■■■ 4.26
ESRRA-204ENST00000467987 GCC2Q8IWJ2 1684 aa41.67■■■■■ 4.26
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ESRRA-204ENST00000467987 IQGAP3Q86VI3 1631 aa41.58■■■■■ 4.25
ESRRA-204ENST00000467987 LRRC7Q96NW7 1537 aa41.56■■■■■ 4.24
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ESRRA-204ENST00000467987 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP41.54■■■■■ 4.24
ESRRA-204ENST00000467987 PIP4K2BP78356 416 aa41.54■■■■■ 4.24
ESRRA-204ENST00000467987 MYO5BQ9ULV0 1848 aa41.49■■■■■ 4.23
ESRRA-204ENST00000467987 DISP3Q9P2K9 1392 aa41.46■■■■■ 4.23
ESRRA-204ENST00000467987 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa41.44■■■■■ 4.22
ESRRA-204ENST00000467987 SLC26A8Q96RN1 970 aa41.43■■■■■ 4.22
ESRRA-204ENST00000467987 ALKQ9UM73 1620 aa41.42■■■■■ 4.22
ESRRA-204ENST00000467987 CHGAP10645 457 aaKnown RBP41.4■■■■■ 4.22
ESRRA-204ENST00000467987 HDGFP51858 240 aaKnown RBP41.4■■■■■ 4.22
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