RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466888.5

VSTM2A-205, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 2A, humanhuman

TSL 3

Gene VSTM2A, Length 735 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2A-205ENST00000466888 KDM5DQ9BY66 1539 aa30.22■■■□□ 2.43
VSTM2A-205ENST00000466888 DAPK1P53355 1430 aa30.22■■■□□ 2.43
VSTM2A-205ENST00000466888 CROCC2H7BZ55 1655 aa30.21■■■□□ 2.43
VSTM2A-205ENST00000466888 DMRT2Q9Y5R5 561 aa30.21■■■□□ 2.43
VSTM2A-205ENST00000466888 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.2■■■□□ 2.43
VSTM2A-205ENST00000466888 MYO3AQ8NEV4 1616 aa30.2■■■□□ 2.43
VSTM2A-205ENST00000466888 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
VSTM2A-205ENST00000466888 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa30.18■■■□□ 2.42
VSTM2A-205ENST00000466888 DUOX2Q9NRD8 1548 aa30.17■■■□□ 2.42
VSTM2A-205ENST00000466888 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
VSTM2A-205ENST00000466888 FBXO41Q8TF61 875 aa30.16■■■□□ 2.42
VSTM2A-205ENST00000466888 KIF15Q9NS87 1388 aa30.15■■■□□ 2.42
VSTM2A-205ENST00000466888 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
VSTM2A-205ENST00000466888 NCOA1Q15788 1441 aa30.15■■■□□ 2.42
VSTM2A-205ENST00000466888 SHANK2Q9UPX8 1470 aa30.15■■■□□ 2.42
VSTM2A-205ENST00000466888 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa30.15■■■□□ 2.42
VSTM2A-205ENST00000466888 FAM135AQ9P2D6 1515 aa30.14■■■□□ 2.42
VSTM2A-205ENST00000466888 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
VSTM2A-205ENST00000466888 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
VSTM2A-205ENST00000466888 PZPP20742 1482 aa30.13■■■□□ 2.41
VSTM2A-205ENST00000466888 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
VSTM2A-205ENST00000466888 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
VSTM2A-205ENST00000466888 CERKQ8TCT0 537 aa30.12■■■□□ 2.41
VSTM2A-205ENST00000466888 TNRQ92752 1358 aa30.12■■■□□ 2.41
VSTM2A-205ENST00000466888 PTPRTO14522 1441 aa30.12■■■□□ 2.41
VSTM2A-205ENST00000466888 MROH1Q8NDA8 1641 aa30.11■■■□□ 2.41
VSTM2A-205ENST00000466888 ABCC3O15438 1527 aa30.09■■■□□ 2.41
VSTM2A-205ENST00000466888 CEP152O94986 1710 aa30.07■■■□□ 2.4
VSTM2A-205ENST00000466888 A2ML1A8K2U0 1454 aa30.06■■■□□ 2.4
VSTM2A-205ENST00000466888 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP30.06■■■□□ 2.4
VSTM2A-205ENST00000466888 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
VSTM2A-205ENST00000466888 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa30.05■■■□□ 2.4
VSTM2A-205ENST00000466888 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
VSTM2A-205ENST00000466888 ERBINQ96RT1 1412 aa30.04■■■□□ 2.4
VSTM2A-205ENST00000466888 PLA2R1Q13018 1463 aa30.01■■■□□ 2.4
VSTM2A-205ENST00000466888 PKD2Q13563 968 aa30■■■□□ 2.39
VSTM2A-205ENST00000466888 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
VSTM2A-205ENST00000466888 ADGRL2O95490 1459 aa29.95■■■□□ 2.39
VSTM2A-205ENST00000466888 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa29.94■■■□□ 2.38
VSTM2A-205ENST00000466888 ERVK-7P63135 1459 aa29.94■■■□□ 2.38
VSTM2A-205ENST00000466888 NLRP1Q9C000 1473 aa29.93■■■□□ 2.38
VSTM2A-205ENST00000466888 DEPDC5O75140 1603 aa29.93■■■□□ 2.38
VSTM2A-205ENST00000466888 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.92■■■□□ 2.38
VSTM2A-205ENST00000466888 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
VSTM2A-205ENST00000466888 LTBP4Q8N2S1 1624 aa29.91■■■□□ 2.38
VSTM2A-205ENST00000466888 UGGT1Q9NYU2 1555 aa29.9■■■□□ 2.38
VSTM2A-205ENST00000466888 KANK1Q14678 1352 aa29.9■■■□□ 2.38
VSTM2A-205ENST00000466888 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
VSTM2A-205ENST00000466888 ITGAEP38570 1179 aa29.87■■■□□ 2.37
VSTM2A-205ENST00000466888 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa29.87■■■□□ 2.37
VSTM2A-205ENST00000466888 ANKLE2Q86XL3 938 aa29.86■■■□□ 2.37
VSTM2A-205ENST00000466888 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
VSTM2A-205ENST00000466888 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.85■■■□□ 2.37
VSTM2A-205ENST00000466888 VWDEQ8N2E2 1590 aa29.83■■■□□ 2.37
VSTM2A-205ENST00000466888 NEURL4Q96JN8 1562 aa29.83■■■□□ 2.37
VSTM2A-205ENST00000466888 LMTK2Q8IWU2 1503 aa29.8■■■□□ 2.36
VSTM2A-205ENST00000466888 UBR1Q8IWV7 1749 aa29.77■■■□□ 2.36
VSTM2A-205ENST00000466888 ROCK1Q13464 1354 aa29.74■■■□□ 2.35
VSTM2A-205ENST00000466888 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
VSTM2A-205ENST00000466888 IDI1Q13907 227 aa29.72■■■□□ 2.35
VSTM2A-205ENST00000466888 MED14O60244 1454 aa29.71■■■□□ 2.35
VSTM2A-205ENST00000466888 PIK3C2BO00750 1634 aa29.71■■■□□ 2.35
VSTM2A-205ENST00000466888 EFCAB6Q5THR3 1501 aa29.7■■■□□ 2.34
VSTM2A-205ENST00000466888 LTKP29376 864 aa29.68■■■□□ 2.34
VSTM2A-205ENST00000466888 STAG3Q9UJ98 1225 aa29.68■■■□□ 2.34
VSTM2A-205ENST00000466888 SYNMO15061 1565 aa29.68■■■□□ 2.34
VSTM2A-205ENST00000466888 TXNDC2Q86VQ3 553 aa29.67■■■□□ 2.34
VSTM2A-205ENST00000466888 NOS1P29475 1434 aa29.67■■■□□ 2.34
VSTM2A-205ENST00000466888 IQSEC2Q5JU85 1478 aa29.67■■■□□ 2.34
VSTM2A-205ENST00000466888 IQGAP1P46940 1657 aa29.66■■■□□ 2.34
VSTM2A-205ENST00000466888 UNC13BO14795 1591 aa29.64■■■□□ 2.34
VSTM2A-205ENST00000466888 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
VSTM2A-205ENST00000466888 ARHGAP23Q9P227 1491 aa29.63■■■□□ 2.33
VSTM2A-205ENST00000466888 TET3O43151 1660 aa29.63■■■□□ 2.33
VSTM2A-205ENST00000466888 SLIT1O75093 1534 aa29.61■■■□□ 2.33
VSTM2A-205ENST00000466888 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
VSTM2A-205ENST00000466888 EID1Q9Y6B2 187 aa29.59■■■□□ 2.33
VSTM2A-205ENST00000466888 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.59■■■□□ 2.33
VSTM2A-205ENST00000466888 UBAP1LF5GYI3 381 aa29.58■■■□□ 2.33
VSTM2A-205ENST00000466888 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
VSTM2A-205ENST00000466888 SLC52A1Q9NWF4 448 aa29.58■■■□□ 2.33
VSTM2A-205ENST00000466888 TMEM2Q9UHN6 1383 aa29.58■■■□□ 2.33
VSTM2A-205ENST00000466888 NUP155O75694 1391 aa29.57■■■□□ 2.32
VSTM2A-205ENST00000466888 E9PCH4 1651 aa29.55■■■□□ 2.32
VSTM2A-205ENST00000466888 CPS1P31327 1500 aa29.55■■■□□ 2.32
VSTM2A-205ENST00000466888 STRCP1A6NGW2 1772 aa29.54■■■□□ 2.32
VSTM2A-205ENST00000466888 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
VSTM2A-205ENST00000466888 IQGAP3Q86VI3 1631 aa29.54■■■□□ 2.32
VSTM2A-205ENST00000466888 ADGRB3O60242 1522 aa29.5■■■□□ 2.31
VSTM2A-205ENST00000466888 MYO5BQ9ULV0 1848 aa29.5■■■□□ 2.31
VSTM2A-205ENST00000466888 CHGAP10645 457 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
VSTM2A-205ENST00000466888 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
VSTM2A-205ENST00000466888 NAIPQ13075 1403 aa29.45■■■□□ 2.3
VSTM2A-205ENST00000466888 SLC26A8Q96RN1 970 aa29.43■■■□□ 2.3
VSTM2A-205ENST00000466888 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa29.42■■■□□ 2.3
VSTM2A-205ENST00000466888 LRRC7Q96NW7 1537 aa29.42■■■□□ 2.3
VSTM2A-205ENST00000466888 PIP4K2BP78356 416 aa29.41■■■□□ 2.3
VSTM2A-205ENST00000466888 TOM1O60784 492 aa29.4■■■□□ 2.3
VSTM2A-205ENST00000466888 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
VSTM2A-205ENST00000466888 BCANQ96GW7 911 aa29.39■■■□□ 2.3
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