RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466676.5

RUNDC3B-204, Transcript of RUN domain containing 3B, human

TSL 2

Gene RUNDC3B, Length 582 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PLA2R1	Q13018	1463 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RUNDC3B-204	ENST00000466676	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	13.58	□□□□□ -0.24
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RUNDC3B-204	ENST00000466676	A2M	P01023	1474 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RUNDC3B-204	ENST00000466676	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ATP7A	Q04656	1500 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RUNDC3B-204	ENST00000466676	GGT6	Q6P531	493 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RUNDC3B-204	ENST00000466676	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CAPN15	O75808	1086 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RUNDC3B-204	ENST00000466676	DSG3	P32926	999 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RUNDC3B-204	ENST00000466676	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TOM1	O60784	492 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PTPRK	Q15262	1439 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PLXNC1	O60486	1568 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RUNDC3B-204	ENST00000466676	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ILDR2	Q71H61	639 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RUNDC3B-204	ENST00000466676	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RUNDC3B-204	ENST00000466676	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
RUNDC3B-204	ENST00000466676	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TSPY4	P0CV99	314 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TSPY10	P0CW01	314 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RUNDC3B-204	ENST00000466676	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CPS1	P31327	1500 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CEP162	Q5TB80	1403 aa		13.46	□□□□□ -0.26
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TNR	Q92752	1358 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RUNDC3B-204	ENST00000466676	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KIF3B	O15066	747 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NLRP1	Q9C000	1473 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MBD5	Q9P267	1494 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PZP	P20742	1482 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RUNDC3B-204	ENST00000466676	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MIA2	Q96PC5	1412 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TIAM1	Q13009	1591 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
RUNDC3B-204	ENST00000466676	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PIP4K2B	P78356	416 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RUNDC3B-204	ENST00000466676	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MED14	O60244	1454 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RUNDC3B-204	ENST00000466676	HSPA1L	P34931	641 aa		13.35	□□□□□ -0.27
RUNDC3B-204	ENST00000466676	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
RUNDC3B-204	ENST00000466676	DEPDC5	O75140	1603 aa		13.35	□□□□□ -0.27
RUNDC3B-204	ENST00000466676	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	13.34	□□□□□ -0.27
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		13.34	□□□□□ -0.27
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		13.34	□□□□□ -0.27
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NCOA2	Q15596	1464 aa		13.34	□□□□□ -0.27
RUNDC3B-204	ENST00000466676	POLA2	Q14181	598 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
RUNDC3B-204	ENST00000466676	EID1	Q9Y6B2	187 aa		13.32	□□□□□ -0.28
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
RUNDC3B-204	ENST00000466676	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		13.29	□□□□□ -0.28
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
RUNDC3B-204	ENST00000466676	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
RUNDC3B-204	ENST00000466676	IQGAP1	P46940	1657 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RUNDC3B-204	ENST00000466676	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SYNM	O15061	1565 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KANK1	Q14678	1352 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RUNDC3B-204	ENST00000466676	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
RUNDC3B-204	ENST00000466676	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ABCB7	O75027	752 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NEUROD1	Q13562	356 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ABCC3	O15438	1527 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MAP3K1	Q13233	1512 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RUNDC3B-204	ENST00000466676	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ERVK-7	P63135	1459 aa		13.24	□□□□□ -0.29

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms