RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465957.1

HPS1-207, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene HPS1, Length 922 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-207ENST00000465957 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.48■■□□□ 1.67
HPS1-207ENST00000465957 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
HPS1-207ENST00000465957 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.47■■□□□ 1.67
HPS1-207ENST00000465957 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.46■■□□□ 1.67
HPS1-207ENST00000465957 PTPRTO14522 1441 aa25.46■■□□□ 1.67
HPS1-207ENST00000465957 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.44■■□□□ 1.66
HPS1-207ENST00000465957 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.43■■□□□ 1.66
HPS1-207ENST00000465957 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
HPS1-207ENST00000465957 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.41■■□□□ 1.66
HPS1-207ENST00000465957 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
HPS1-207ENST00000465957 ABCC5O15440 1437 aa25.4■■□□□ 1.66
HPS1-207ENST00000465957 PZPP20742 1482 aa25.39■■□□□ 1.65
HPS1-207ENST00000465957 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.38■■□□□ 1.65
HPS1-207ENST00000465957 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.38■■□□□ 1.65
HPS1-207ENST00000465957 TNRQ92752 1358 aa25.38■■□□□ 1.65
HPS1-207ENST00000465957 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.36■■□□□ 1.65
HPS1-207ENST00000465957 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
HPS1-207ENST00000465957 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.35■■□□□ 1.65
HPS1-207ENST00000465957 KIF15Q9NS87 1388 aa25.34■■□□□ 1.65
HPS1-207ENST00000465957 DAPK1P53355 1430 aa25.34■■□□□ 1.65
HPS1-207ENST00000465957 PLA2R1Q13018 1463 aa25.34■■□□□ 1.65
HPS1-207ENST00000465957 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
HPS1-207ENST00000465957 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.33■■□□□ 1.65
HPS1-207ENST00000465957 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
HPS1-207ENST00000465957 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
HPS1-207ENST00000465957 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.33■■□□□ 1.65
HPS1-207ENST00000465957 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.32■■□□□ 1.64
HPS1-207ENST00000465957 ABCC3O15438 1527 aa25.32■■□□□ 1.64
HPS1-207ENST00000465957 PKD2Q13563 968 aa25.32■■□□□ 1.64
HPS1-207ENST00000465957 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.32■■□□□ 1.64
HPS1-207ENST00000465957 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.31■■□□□ 1.64
HPS1-207ENST00000465957 LTBP4Q8N2S1 1624 aa25.3■■□□□ 1.64
HPS1-207ENST00000465957 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
HPS1-207ENST00000465957 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
HPS1-207ENST00000465957 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
HPS1-207ENST00000465957 CEP152O94986 1710 aa25.24■■□□□ 1.63
HPS1-207ENST00000465957 ERBINQ96RT1 1412 aa25.24■■□□□ 1.63
HPS1-207ENST00000465957 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.24■■□□□ 1.63
HPS1-207ENST00000465957 NLRP1Q9C000 1473 aa25.23■■□□□ 1.63
HPS1-207ENST00000465957 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.23■■□□□ 1.63
HPS1-207ENST00000465957 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.22■■□□□ 1.63
HPS1-207ENST00000465957 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
HPS1-207ENST00000465957 ERVK-7P63135 1459 aa25.21■■□□□ 1.63
HPS1-207ENST00000465957 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.2■■□□□ 1.62
HPS1-207ENST00000465957 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.19■■□□□ 1.62
HPS1-207ENST00000465957 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
HPS1-207ENST00000465957 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
HPS1-207ENST00000465957 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
HPS1-207ENST00000465957 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.17■■□□□ 1.62
HPS1-207ENST00000465957 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.17■■□□□ 1.62
HPS1-207ENST00000465957 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
HPS1-207ENST00000465957 DEPDC5O75140 1603 aa25.14■■□□□ 1.61
HPS1-207ENST00000465957 KANK1Q14678 1352 aa25.13■■□□□ 1.61
HPS1-207ENST00000465957 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.12■■□□□ 1.61
HPS1-207ENST00000465957 ADGRL2O95490 1459 aa25.12■■□□□ 1.61
HPS1-207ENST00000465957 IQSEC2Q5JU85 1478 aa25.11■■□□□ 1.61
HPS1-207ENST00000465957 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
HPS1-207ENST00000465957 MED14O60244 1454 aa25.06■■□□□ 1.6
HPS1-207ENST00000465957 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.05■■□□□ 1.6
HPS1-207ENST00000465957 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.05■■□□□ 1.6
HPS1-207ENST00000465957 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.04■■□□□ 1.6
HPS1-207ENST00000465957 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.04■■□□□ 1.6
HPS1-207ENST00000465957 UBAP1LF5GYI3 381 aa25.03■■□□□ 1.6
HPS1-207ENST00000465957 LTKP29376 864 aa25■■□□□ 1.59
HPS1-207ENST00000465957 ITGAEP38570 1179 aa25■■□□□ 1.59
HPS1-207ENST00000465957 IQGAP1P46940 1657 aa25■■□□□ 1.59
HPS1-207ENST00000465957 IDI1Q13907 227 aa24.99■■□□□ 1.59
HPS1-207ENST00000465957 PIK3C2BO00750 1634 aa24.98■■□□□ 1.59
HPS1-207ENST00000465957 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.98■■□□□ 1.59
HPS1-207ENST00000465957 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.97■■□□□ 1.59
HPS1-207ENST00000465957 CPS1P31327 1500 aa24.96■■□□□ 1.59
HPS1-207ENST00000465957 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.96■■□□□ 1.59
HPS1-207ENST00000465957 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
HPS1-207ENST00000465957 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.96■■□□□ 1.59
HPS1-207ENST00000465957 SYNMO15061 1565 aa24.95■■□□□ 1.58
HPS1-207ENST00000465957 SLIT1O75093 1534 aa24.95■■□□□ 1.58
HPS1-207ENST00000465957 NOS1P29475 1434 aa24.94■■□□□ 1.58
HPS1-207ENST00000465957 ROCK1Q13464 1354 aa24.93■■□□□ 1.58
HPS1-207ENST00000465957 EID1Q9Y6B2 187 aa24.92■■□□□ 1.58
HPS1-207ENST00000465957 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.92■■□□□ 1.58
HPS1-207ENST00000465957 STRCP1A6NGW2 1772 aa24.89■■□□□ 1.57
HPS1-207ENST00000465957 UNC13BO14795 1591 aa24.88■■□□□ 1.57
HPS1-207ENST00000465957 PIP4K2BP78356 416 aa24.87■■□□□ 1.57
HPS1-207ENST00000465957 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.87■■□□□ 1.57
HPS1-207ENST00000465957 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
HPS1-207ENST00000465957 TET3O43151 1660 aa24.86■■□□□ 1.57
HPS1-207ENST00000465957 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
HPS1-207ENST00000465957 TOM1O60784 492 aa24.85■■□□□ 1.57
HPS1-207ENST00000465957 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
HPS1-207ENST00000465957 ADGRB3O60242 1522 aa24.83■■□□□ 1.57
HPS1-207ENST00000465957 LRRC7Q96NW7 1537 aa24.83■■□□□ 1.57
HPS1-207ENST00000465957 NUP155O75694 1391 aa24.81■■□□□ 1.56
HPS1-207ENST00000465957 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.81■■□□□ 1.56
HPS1-207ENST00000465957 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.81■■□□□ 1.56
HPS1-207ENST00000465957 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.79■■□□□ 1.56
HPS1-207ENST00000465957 E9PCH4 1651 aa24.78■■□□□ 1.56
HPS1-207ENST00000465957 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
HPS1-207ENST00000465957 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.78■■□□□ 1.56
HPS1-207ENST00000465957 ALKQ9UM73 1620 aa24.77■■□□□ 1.56
HPS1-207ENST00000465957 HSPA1LP34931 641 aa24.77■■□□□ 1.56
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