RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	27.07	■■□□□ 1.92
USP19-210	ENST00000465902	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		27.06	■■□□□ 1.92
USP19-210	ENST00000465902	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	27.05	■■□□□ 1.92
USP19-210	ENST00000465902	NCOA1	Q15788	1441 aa		27.05	■■□□□ 1.92
USP19-210	ENST00000465902	MROH2A	A6NES4	1674 aa		27.05	■■□□□ 1.92
USP19-210	ENST00000465902	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	27.04	■■□□□ 1.92
USP19-210	ENST00000465902	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		27.04	■■□□□ 1.92
USP19-210	ENST00000465902	ADGRL2	O95490	1459 aa		27.03	■■□□□ 1.92
USP19-210	ENST00000465902	ZMYM3	Q14202	1370 aa		27.03	■■□□□ 1.92
USP19-210	ENST00000465902	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		27.03	■■□□□ 1.92
USP19-210	ENST00000465902	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		27.03	■■□□□ 1.92
USP19-210	ENST00000465902	PTPRK	Q15262	1439 aa		27.02	■■□□□ 1.92
USP19-210	ENST00000465902	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	27.02	■■□□□ 1.92
USP19-210	ENST00000465902	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		27.01	■■□□□ 1.91
USP19-210	ENST00000465902	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	27	■■□□□ 1.91
USP19-210	ENST00000465902	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	26.98	■■□□□ 1.91
USP19-210	ENST00000465902	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		26.98	■■□□□ 1.91
USP19-210	ENST00000465902	NPAT	Q14207	1427 aa		26.96	■■□□□ 1.91
USP19-210	ENST00000465902	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		26.92	■■□□□ 1.9
USP19-210	ENST00000465902	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		26.92	■■□□□ 1.9
USP19-210	ENST00000465902	CEP152	O94986	1710 aa		26.92	■■□□□ 1.9
USP19-210	ENST00000465902	ROCK1	Q13464	1354 aa		26.92	■■□□□ 1.9
USP19-210	ENST00000465902	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		26.91	■■□□□ 1.9
USP19-210	ENST00000465902	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	26.9	■■□□□ 1.9
USP19-210	ENST00000465902	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		26.9	■■□□□ 1.9
USP19-210	ENST00000465902	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	26.9	■■□□□ 1.9
USP19-210	ENST00000465902	KANK1	Q14678	1352 aa		26.89	■■□□□ 1.9
USP19-210	ENST00000465902	ABCC3	O15438	1527 aa		26.89	■■□□□ 1.89
USP19-210	ENST00000465902	DEPDC5	O75140	1603 aa		26.87	■■□□□ 1.89
USP19-210	ENST00000465902	FBXO41	Q8TF61	875 aa		26.87	■■□□□ 1.89
USP19-210	ENST00000465902	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	26.86	■■□□□ 1.89
USP19-210	ENST00000465902	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	26.85	■■□□□ 1.89
USP19-210	ENST00000465902	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		26.83	■■□□□ 1.88
USP19-210	ENST00000465902	PZP	P20742	1482 aa		26.82	■■□□□ 1.88
USP19-210	ENST00000465902	STRC	Q7RTU9	1775 aa		26.82	■■□□□ 1.88
USP19-210	ENST00000465902	PTPRT	O14522	1441 aa		26.78	■■□□□ 1.88
USP19-210	ENST00000465902	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		26.77	■■□□□ 1.88
USP19-210	ENST00000465902	TNR	Q92752	1358 aa		26.77	■■□□□ 1.88
USP19-210	ENST00000465902	CERK	Q8TCT0	537 aa		26.76	■■□□□ 1.87
USP19-210	ENST00000465902	UNC13B	O14795	1591 aa		26.73	■■□□□ 1.87
USP19-210	ENST00000465902	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		26.73	■■□□□ 1.87
USP19-210	ENST00000465902	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		26.72	■■□□□ 1.87
USP19-210	ENST00000465902	NAIP	Q13075	1403 aa		26.71	■■□□□ 1.87
USP19-210	ENST00000465902	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	26.7	■■□□□ 1.86
USP19-210	ENST00000465902	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		26.7	■■□□□ 1.86
USP19-210	ENST00000465902	ERVK-7	P63135	1459 aa		26.69	■■□□□ 1.86
USP19-210	ENST00000465902	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		26.69	■■□□□ 1.86
USP19-210	ENST00000465902	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	26.69	■■□□□ 1.86
USP19-210	ENST00000465902	NUP155	O75694	1391 aa		26.68	■■□□□ 1.86
USP19-210	ENST00000465902	PLA2R1	Q13018	1463 aa		26.68	■■□□□ 1.86
USP19-210	ENST00000465902	PKD2	Q13563	968 aa		26.67	■■□□□ 1.86
USP19-210	ENST00000465902	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		26.67	■■□□□ 1.86
USP19-210	ENST00000465902	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		26.67	■■□□□ 1.86
USP19-210	ENST00000465902	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		26.66	■■□□□ 1.86
USP19-210	ENST00000465902	HFM1	A2PYH4	1435 aa		26.66	■■□□□ 1.86
USP19-210	ENST00000465902	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		26.66	■■□□□ 1.86
USP19-210	ENST00000465902	TET3	O43151	1660 aa		26.66	■■□□□ 1.86
USP19-210	ENST00000465902	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		26.64	■■□□□ 1.85
USP19-210	ENST00000465902	NLRP1	Q9C000	1473 aa		26.63	■■□□□ 1.85
USP19-210	ENST00000465902	TRIM52	Q96A61	297 aa		26.62	■■□□□ 1.85
USP19-210	ENST00000465902	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		26.57	■■□□□ 1.84
USP19-210	ENST00000465902		E9PCH4	1651 aa		26.57	■■□□□ 1.84
USP19-210	ENST00000465902	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	26.56	■■□□□ 1.84
USP19-210	ENST00000465902	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	26.56	■■□□□ 1.84
USP19-210	ENST00000465902	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		26.54	■■□□□ 1.84
USP19-210	ENST00000465902	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		26.54	■■□□□ 1.84
USP19-210	ENST00000465902	SYNM	O15061	1565 aa		26.52	■■□□□ 1.84
USP19-210	ENST00000465902	NOS1	P29475	1434 aa		26.51	■■□□□ 1.83
USP19-210	ENST00000465902	PIK3C2B	O00750	1634 aa		26.5	■■□□□ 1.83
USP19-210	ENST00000465902	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		26.5	■■□□□ 1.83
USP19-210	ENST00000465902	IDI1	Q13907	227 aa		26.49	■■□□□ 1.83
USP19-210	ENST00000465902	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	26.48	■■□□□ 1.83
USP19-210	ENST00000465902	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		26.48	■■□□□ 1.83
USP19-210	ENST00000465902	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		26.48	■■□□□ 1.83
USP19-210	ENST00000465902	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		26.47	■■□□□ 1.83
USP19-210	ENST00000465902	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	26.47	■■□□□ 1.83
USP19-210	ENST00000465902	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	26.46	■■□□□ 1.83
USP19-210	ENST00000465902	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		26.44	■■□□□ 1.82
USP19-210	ENST00000465902	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		26.42	■■□□□ 1.82
USP19-210	ENST00000465902	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	26.42	■■□□□ 1.82
USP19-210	ENST00000465902	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		26.41	■■□□□ 1.82
USP19-210	ENST00000465902	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		26.39	■■□□□ 1.82
USP19-210	ENST00000465902	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		26.39	■■□□□ 1.82
USP19-210	ENST00000465902	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	26.38	■■□□□ 1.81
USP19-210	ENST00000465902	MED14	O60244	1454 aa		26.38	■■□□□ 1.81
USP19-210	ENST00000465902	ADGRB3	O60242	1522 aa		26.38	■■□□□ 1.81
USP19-210	ENST00000465902	EID1	Q9Y6B2	187 aa		26.37	■■□□□ 1.81
USP19-210	ENST00000465902	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	26.37	■■□□□ 1.81
USP19-210	ENST00000465902	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		26.36	■■□□□ 1.81
USP19-210	ENST00000465902	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	26.35	■■□□□ 1.81
USP19-210	ENST00000465902	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		26.34	■■□□□ 1.81
USP19-210	ENST00000465902	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		26.33	■■□□□ 1.81
USP19-210	ENST00000465902	SLIT1	O75093	1534 aa		26.33	■■□□□ 1.81
USP19-210	ENST00000465902	FOXD1	Q16676	465 aa		26.32	■■□□□ 1.8
USP19-210	ENST00000465902	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		26.32	■■□□□ 1.8
USP19-210	ENST00000465902	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	26.31	■■□□□ 1.8
USP19-210	ENST00000465902	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		26.31	■■□□□ 1.8
USP19-210	ENST00000465902	LTK	P29376	864 aa		26.31	■■□□□ 1.8
USP19-210	ENST00000465902	IQGAP1	P46940	1657 aa		26.3	■■□□□ 1.8
USP19-210	ENST00000465902	TRPM2	O94759	1503 aa		26.28	■■□□□ 1.8

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 608.9 ms