RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

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Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 MROH1Q8NDA8 1641 aa13.6□□□□□ -0.23
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GAPDHP28-201ENST00000455134 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM135AQ9P2D6 1515 aa13.59□□□□□ -0.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 CERKQ8TCT0 537 aa13.57□□□□□ -0.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 KDM5DQ9BY66 1539 aa13.57□□□□□ -0.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 NEURL4Q96JN8 1562 aa13.55□□□□□ -0.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 PLA2R1Q13018 1463 aa13.55□□□□□ -0.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 PTPN23Q9H3S7 1636 aa13.53□□□□□ -0.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 GGT6Q6P531 493 aa13.53□□□□□ -0.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 PZPP20742 1482 aa13.53□□□□□ -0.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 MYOM3Q5VTT5 1437 aa13.52□□□□□ -0.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 A2ML1A8K2U0 1454 aa13.52□□□□□ -0.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 DEPDC5O75140 1603 aa13.52□□□□□ -0.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 DMRT2Q9Y5R5 561 aa13.51□□□□□ -0.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 STRCP1A6NGW2 1772 aa13.5□□□□□ -0.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 UBR1Q8IWV7 1749 aa13.5□□□□□ -0.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 ABCC3O15438 1527 aa13.5□□□□□ -0.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 MIA2Q96PC5 1412 aa13.5□□□□□ -0.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 PPP6R1Q9UPN7 881 aa13.5□□□□□ -0.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa13.49□□□□□ -0.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 IQSEC2Q5JU85 1478 aa13.49□□□□□ -0.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 RSPH4AQ5TD94 716 aa13.48□□□□□ -0.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 KIF3BO15066 747 aa13.47□□□□□ -0.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa13.46□□□□□ -0.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 DUOX2Q9NRD8 1548 aa13.46□□□□□ -0.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 SHANK2Q9UPX8 1470 aa13.46□□□□□ -0.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 IQGAP1P46940 1657 aa13.46□□□□□ -0.26
GAPDHP28-201ENST00000455134 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
GAPDHP28-201ENST00000455134 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
GAPDHP28-201ENST00000455134 TNRQ92752 1358 aa13.45□□□□□ -0.26
GAPDHP28-201ENST00000455134 MYO5BQ9ULV0 1848 aa13.44□□□□□ -0.26
GAPDHP28-201ENST00000455134 ABCC5O15440 1437 aa13.43□□□□□ -0.26
GAPDHP28-201ENST00000455134 VWDEQ8N2E2 1590 aa13.43□□□□□ -0.26
GAPDHP28-201ENST00000455134 UGGT1Q9NYU2 1555 aa13.43□□□□□ -0.26
GAPDHP28-201ENST00000455134 ERVK-7P63135 1459 aa13.42□□□□□ -0.26
GAPDHP28-201ENST00000455134 NLRP1Q9C000 1473 aa13.42□□□□□ -0.26
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
GAPDHP28-201ENST00000455134 FGD6Q6ZV73 1430 aa13.41□□□□□ -0.26
GAPDHP28-201ENST00000455134 PIK3C2BO00750 1634 aa13.41□□□□□ -0.26
GAPDHP28-201ENST00000455134 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
GAPDHP28-201ENST00000455134 DAPK1P53355 1430 aa13.4□□□□□ -0.26
GAPDHP28-201ENST00000455134 TSPY4P0CV99 314 aa13.4□□□□□ -0.26
GAPDHP28-201ENST00000455134 TSPY10P0CW01 314 aa13.4□□□□□ -0.26
GAPDHP28-201ENST00000455134 PKD2Q13563 968 aa13.4□□□□□ -0.26
GAPDHP28-201ENST00000455134 MED14O60244 1454 aa13.4□□□□□ -0.26
GAPDHP28-201ENST00000455134 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa13.39□□□□□ -0.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 ALKQ9UM73 1620 aa13.39□□□□□ -0.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 ERBINQ96RT1 1412 aa13.39□□□□□ -0.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP13.37□□□□□ -0.27
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GAPDHP28-201ENST00000455134 KIF15Q9NS87 1388 aa13.36□□□□□ -0.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 GCC2Q8IWJ2 1684 aa13.36□□□□□ -0.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 CPS1P31327 1500 aa13.35□□□□□ -0.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 ADGRL2O95490 1459 aa13.35□□□□□ -0.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 LMTK2Q8IWU2 1503 aa13.34□□□□□ -0.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa13.34□□□□□ -0.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLIT1O75093 1534 aa13.34□□□□□ -0.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARHGAP23Q9P227 1491 aa13.33□□□□□ -0.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 EFCAB6Q5THR3 1501 aa13.33□□□□□ -0.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 TET3O43151 1660 aa13.32□□□□□ -0.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 UNC13BO14795 1591 aa13.32□□□□□ -0.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 E9PCH4 1651 aa13.31□□□□□ -0.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa13.29□□□□□ -0.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 ANKLE2Q86XL3 938 aa13.27□□□□□ -0.29
GAPDHP28-201ENST00000455134 LRRC7Q96NW7 1537 aa13.27□□□□□ -0.29
GAPDHP28-201ENST00000455134 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
GAPDHP28-201ENST00000455134 ADGRB3O60242 1522 aa13.26□□□□□ -0.29
GAPDHP28-201ENST00000455134 NOS1P29475 1434 aa13.26□□□□□ -0.29
GAPDHP28-201ENST00000455134 APLP2Q06481 763 aa13.26□□□□□ -0.29
GAPDHP28-201ENST00000455134 IQGAP3Q86VI3 1631 aa13.26□□□□□ -0.29
GAPDHP28-201ENST00000455134 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa13.26□□□□□ -0.29
GAPDHP28-201ENST00000455134 UBAP1LF5GYI3 381 aa13.25□□□□□ -0.29
GAPDHP28-201ENST00000455134 CHIC2Q9UKJ5 165 aa13.25□□□□□ -0.29
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa13.24□□□□□ -0.29
GAPDHP28-201ENST00000455134 ILDR2Q71H61 639 aa13.24□□□□□ -0.29
GAPDHP28-201ENST00000455134 DISP3Q9P2K9 1392 aa13.23□□□□□ -0.29
GAPDHP28-201ENST00000455134 LTKP29376 864 aa13.23□□□□□ -0.29
GAPDHP28-201ENST00000455134 NWD1Q149M9 1564 aa13.22□□□□□ -0.29
GAPDHP28-201ENST00000455134 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa13.22□□□□□ -0.29
GAPDHP28-201ENST00000455134 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa13.22□□□□□ -0.29
GAPDHP28-201ENST00000455134 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP13.21□□□□□ -0.29
GAPDHP28-201ENST00000455134 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 KANK1Q14678 1352 aa13.2□□□□□ -0.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM2Q9UHN6 1383 aa13.2□□□□□ -0.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 IDI1Q13907 227 aa13.17□□□□□ -0.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZFYVE9O95405 1425 aa13.16□□□□□ -0.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 HSPA1LP34931 641 aa13.15□□□□□ -0.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 TXNDC2Q86VQ3 553 aa13.15□□□□□ -0.3
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