RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450602.6

CXorf40A-211, Transcript of chromosome X open reading frame 40A, humanhuman

APPRIS P3 TSL 3 BASIC

Gene CXorf40A, Length 1,204 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf40A-211ENST00000450602 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.46■■□□□ 1.35
CXorf40A-211ENST00000450602 ERBINQ96RT1 1412 aa23.42■■□□□ 1.34
CXorf40A-211ENST00000450602 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
CXorf40A-211ENST00000450602 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
CXorf40A-211ENST00000450602 ADGRL2O95490 1459 aa23.4■■□□□ 1.34
CXorf40A-211ENST00000450602 PTPRKQ15262 1439 aa23.4■■□□□ 1.34
CXorf40A-211ENST00000450602 KANK1Q14678 1352 aa23.4■■□□□ 1.34
CXorf40A-211ENST00000450602 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
CXorf40A-211ENST00000450602 C3P01024 1663 aa23.37■■□□□ 1.33
CXorf40A-211ENST00000450602 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.36■■□□□ 1.33
CXorf40A-211ENST00000450602 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.36■■□□□ 1.33
CXorf40A-211ENST00000450602 ROCK1Q13464 1354 aa23.36■■□□□ 1.33
CXorf40A-211ENST00000450602 HSPA2P54652 639 aa23.35■■□□□ 1.33
CXorf40A-211ENST00000450602 MROH2AA6NES4 1674 aa23.35■■□□□ 1.33
CXorf40A-211ENST00000450602 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.34■■□□□ 1.33
CXorf40A-211ENST00000450602 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
CXorf40A-211ENST00000450602 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.32■■□□□ 1.32
CXorf40A-211ENST00000450602 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
CXorf40A-211ENST00000450602 NPATQ14207 1427 aa23.31■■□□□ 1.32
CXorf40A-211ENST00000450602 LMTK3Q96Q04 1460 aa23.3■■□□□ 1.32
CXorf40A-211ENST00000450602 ABCC3O15438 1527 aa23.27■■□□□ 1.32
CXorf40A-211ENST00000450602 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
CXorf40A-211ENST00000450602 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.25■■□□□ 1.31
CXorf40A-211ENST00000450602 PZPP20742 1482 aa23.24■■□□□ 1.31
CXorf40A-211ENST00000450602 TNRQ92752 1358 aa23.24■■□□□ 1.31
CXorf40A-211ENST00000450602 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
CXorf40A-211ENST00000450602 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
CXorf40A-211ENST00000450602 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.22■■□□□ 1.31
CXorf40A-211ENST00000450602 CEP152O94986 1710 aa23.2■■□□□ 1.3
CXorf40A-211ENST00000450602 NUP155O75694 1391 aa23.19■■□□□ 1.3
CXorf40A-211ENST00000450602 DEPDC5O75140 1603 aa23.19■■□□□ 1.3
CXorf40A-211ENST00000450602 TRIM52Q96A61 297 aa23.18■■□□□ 1.3
CXorf40A-211ENST00000450602 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.17■■□□□ 1.3
CXorf40A-211ENST00000450602 NAIPQ13075 1403 aa23.15■■□□□ 1.3
CXorf40A-211ENST00000450602 STAG3Q9UJ98 1225 aa23.14■■□□□ 1.29
CXorf40A-211ENST00000450602 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.14■■□□□ 1.29
CXorf40A-211ENST00000450602 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.13■■□□□ 1.29
CXorf40A-211ENST00000450602 ERVK-7P63135 1459 aa23.12■■□□□ 1.29
CXorf40A-211ENST00000450602 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
CXorf40A-211ENST00000450602 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.12■■□□□ 1.29
CXorf40A-211ENST00000450602 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.11■■□□□ 1.29
CXorf40A-211ENST00000450602 HFM1A2PYH4 1435 aa23.11■■□□□ 1.29
CXorf40A-211ENST00000450602 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
CXorf40A-211ENST00000450602 A2ML1A8K2U0 1454 aa23.11■■□□□ 1.29
CXorf40A-211ENST00000450602 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.1■■□□□ 1.29
CXorf40A-211ENST00000450602 NLRP1Q9C000 1473 aa23.1■■□□□ 1.29
CXorf40A-211ENST00000450602 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
CXorf40A-211ENST00000450602 UNC13BO14795 1591 aa23.09■■□□□ 1.29
CXorf40A-211ENST00000450602 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.08■■□□□ 1.29
CXorf40A-211ENST00000450602 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.07■■□□□ 1.28
CXorf40A-211ENST00000450602 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.05■■□□□ 1.28
CXorf40A-211ENST00000450602 PKD2Q13563 968 aa23.05■■□□□ 1.28
CXorf40A-211ENST00000450602 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.04■■□□□ 1.28
CXorf40A-211ENST00000450602 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.04■■□□□ 1.28
CXorf40A-211ENST00000450602 ANKLE2Q86XL3 938 aa23.03■■□□□ 1.28
CXorf40A-211ENST00000450602 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.03■■□□□ 1.28
CXorf40A-211ENST00000450602 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
CXorf40A-211ENST00000450602 IDI1Q13907 227 aa23.02■■□□□ 1.28
CXorf40A-211ENST00000450602 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
CXorf40A-211ENST00000450602 TET3O43151 1660 aa23.02■■□□□ 1.28
CXorf40A-211ENST00000450602 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
CXorf40A-211ENST00000450602 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
CXorf40A-211ENST00000450602 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23■■□□□ 1.27
CXorf40A-211ENST00000450602 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.99■■□□□ 1.27
CXorf40A-211ENST00000450602 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
CXorf40A-211ENST00000450602 NOS1P29475 1434 aa22.98■■□□□ 1.27
CXorf40A-211ENST00000450602 PLA2R1Q13018 1463 aa22.98■■□□□ 1.27
CXorf40A-211ENST00000450602 EID1Q9Y6B2 187 aa22.97■■□□□ 1.27
CXorf40A-211ENST00000450602 STRCQ7RTU9 1775 aa22.94■■□□□ 1.26
CXorf40A-211ENST00000450602 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.94■■□□□ 1.26
CXorf40A-211ENST00000450602 PTPRTO14522 1441 aa22.93■■□□□ 1.26
CXorf40A-211ENST00000450602 E9PCH4 1651 aa22.92■■□□□ 1.26
CXorf40A-211ENST00000450602 SYNMO15061 1565 aa22.91■■□□□ 1.26
CXorf40A-211ENST00000450602 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
CXorf40A-211ENST00000450602 BCANQ96GW7 911 aa22.9■■□□□ 1.26
CXorf40A-211ENST00000450602 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.9■■□□□ 1.26
CXorf40A-211ENST00000450602 PIK3C2BO00750 1634 aa22.9■■□□□ 1.26
CXorf40A-211ENST00000450602 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.89■■□□□ 1.26
CXorf40A-211ENST00000450602 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.87■■□□□ 1.25
CXorf40A-211ENST00000450602 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
CXorf40A-211ENST00000450602 FOXD1Q16676 465 aa22.86■■□□□ 1.25
CXorf40A-211ENST00000450602 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.86■■□□□ 1.25
CXorf40A-211ENST00000450602 LTKP29376 864 aa22.85■■□□□ 1.25
CXorf40A-211ENST00000450602 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
CXorf40A-211ENST00000450602 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
CXorf40A-211ENST00000450602 ADGRB3O60242 1522 aa22.82■■□□□ 1.24
CXorf40A-211ENST00000450602 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
CXorf40A-211ENST00000450602 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
CXorf40A-211ENST00000450602 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.81■■□□□ 1.24
CXorf40A-211ENST00000450602 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
CXorf40A-211ENST00000450602 SLIT1O75093 1534 aa22.79■■□□□ 1.24
CXorf40A-211ENST00000450602 HRCP23327 699 aa22.79■■□□□ 1.24
CXorf40A-211ENST00000450602 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
CXorf40A-211ENST00000450602 CERKQ8TCT0 537 aa22.79■■□□□ 1.24
CXorf40A-211ENST00000450602 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.79■■□□□ 1.24
CXorf40A-211ENST00000450602 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
CXorf40A-211ENST00000450602 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.79■■□□□ 1.24
CXorf40A-211ENST00000450602 MED14O60244 1454 aa22.77■■□□□ 1.24
CXorf40A-211ENST00000450602 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
CXorf40A-211ENST00000450602 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.7 ms