RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448514.1

GGTLC2-202, Transcript of gamma-glutamyltransferase light chain 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGTLC2, Length 678 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC2-202ENST00000448514 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.33■■□□□ 1.48
GGTLC2-202ENST00000448514 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.48
GGTLC2-202ENST00000448514 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
GGTLC2-202ENST00000448514 MAP3K1Q13233 1512 aa24.3■■□□□ 1.48
GGTLC2-202ENST00000448514 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.29■■□□□ 1.48
GGTLC2-202ENST00000448514 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.27■■□□□ 1.48
GGTLC2-202ENST00000448514 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.27■■□□□ 1.48
GGTLC2-202ENST00000448514 PZPP20742 1482 aa24.26■■□□□ 1.47
GGTLC2-202ENST00000448514 TNRQ92752 1358 aa24.25■■□□□ 1.47
GGTLC2-202ENST00000448514 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
GGTLC2-202ENST00000448514 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
GGTLC2-202ENST00000448514 MIA2Q96PC5 1412 aa24.24■■□□□ 1.47
GGTLC2-202ENST00000448514 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
GGTLC2-202ENST00000448514 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
GGTLC2-202ENST00000448514 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.21■■□□□ 1.47
GGTLC2-202ENST00000448514 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.19■■□□□ 1.46
GGTLC2-202ENST00000448514 NLRP1Q9C000 1473 aa24.16■■□□□ 1.46
GGTLC2-202ENST00000448514 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
GGTLC2-202ENST00000448514 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
GGTLC2-202ENST00000448514 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.12■■□□□ 1.45
GGTLC2-202ENST00000448514 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
GGTLC2-202ENST00000448514 ABCC3O15438 1527 aa24.1■■□□□ 1.45
GGTLC2-202ENST00000448514 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.09■■□□□ 1.45
GGTLC2-202ENST00000448514 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.08■■□□□ 1.45
GGTLC2-202ENST00000448514 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.08■■□□□ 1.45
GGTLC2-202ENST00000448514 UBAP1LF5GYI3 381 aa24.08■■□□□ 1.45
GGTLC2-202ENST00000448514 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.08■■□□□ 1.45
GGTLC2-202ENST00000448514 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
GGTLC2-202ENST00000448514 UGGT1Q9NYU2 1555 aa24.08■■□□□ 1.44
GGTLC2-202ENST00000448514 APLP2Q06481 763 aa24.07■■□□□ 1.44
GGTLC2-202ENST00000448514 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.06■■□□□ 1.44
GGTLC2-202ENST00000448514 MED14O60244 1454 aa24.06■■□□□ 1.44
GGTLC2-202ENST00000448514 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.05■■□□□ 1.44
GGTLC2-202ENST00000448514 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
GGTLC2-202ENST00000448514 CPS1P31327 1500 aa24.04■■□□□ 1.44
GGTLC2-202ENST00000448514 MROH1Q8NDA8 1641 aa24.03■■□□□ 1.44
GGTLC2-202ENST00000448514 ABCC5O15440 1437 aa24.03■■□□□ 1.44
GGTLC2-202ENST00000448514 ERVK-7P63135 1459 aa24.03■■□□□ 1.44
GGTLC2-202ENST00000448514 KIF15Q9NS87 1388 aa24.03■■□□□ 1.44
GGTLC2-202ENST00000448514 DEPDC5O75140 1603 aa24.02■■□□□ 1.44
GGTLC2-202ENST00000448514 ERBINQ96RT1 1412 aa24.01■■□□□ 1.43
GGTLC2-202ENST00000448514 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
GGTLC2-202ENST00000448514 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24■■□□□ 1.43
GGTLC2-202ENST00000448514 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.98■■□□□ 1.43
GGTLC2-202ENST00000448514 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.98■■□□□ 1.43
GGTLC2-202ENST00000448514 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.97■■□□□ 1.43
GGTLC2-202ENST00000448514 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.96■■□□□ 1.43
GGTLC2-202ENST00000448514 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
GGTLC2-202ENST00000448514 DAPK1P53355 1430 aa23.96■■□□□ 1.43
GGTLC2-202ENST00000448514 ILDR2Q71H61 639 aa23.96■■□□□ 1.43
GGTLC2-202ENST00000448514 TOM1O60784 492 aa23.95■■□□□ 1.42
GGTLC2-202ENST00000448514 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.93■■□□□ 1.42
GGTLC2-202ENST00000448514 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.91■■□□□ 1.42
GGTLC2-202ENST00000448514 CEP152O94986 1710 aa23.91■■□□□ 1.42
GGTLC2-202ENST00000448514 IQGAP1P46940 1657 aa23.9■■□□□ 1.42
GGTLC2-202ENST00000448514 KANK1Q14678 1352 aa23.9■■□□□ 1.42
GGTLC2-202ENST00000448514 SOCS7O14512 581 aa23.88■■□□□ 1.41
GGTLC2-202ENST00000448514 ARHGAP23Q9P227 1491 aa23.87■■□□□ 1.41
GGTLC2-202ENST00000448514 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.87■■□□□ 1.41
GGTLC2-202ENST00000448514 UBR1Q8IWV7 1749 aa23.87■■□□□ 1.41
GGTLC2-202ENST00000448514 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
GGTLC2-202ENST00000448514 SLIT1O75093 1534 aa23.86■■□□□ 1.41
GGTLC2-202ENST00000448514 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.86■■□□□ 1.41
GGTLC2-202ENST00000448514 PIP4K2BP78356 416 aa23.85■■□□□ 1.41
GGTLC2-202ENST00000448514 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.85■■□□□ 1.41
GGTLC2-202ENST00000448514 LTKP29376 864 aa23.84■■□□□ 1.41
GGTLC2-202ENST00000448514 TXNDC2Q86VQ3 553 aa23.84■■□□□ 1.41
GGTLC2-202ENST00000448514 HSPA1LP34931 641 aa23.83■■□□□ 1.41
GGTLC2-202ENST00000448514 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.4
GGTLC2-202ENST00000448514 EID1Q9Y6B2 187 aa23.82■■□□□ 1.4
GGTLC2-202ENST00000448514 ADGRL2O95490 1459 aa23.81■■□□□ 1.4
GGTLC2-202ENST00000448514 LRRC7Q96NW7 1537 aa23.81■■□□□ 1.4
GGTLC2-202ENST00000448514 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
GGTLC2-202ENST00000448514 TMEM2Q9UHN6 1383 aa23.79■■□□□ 1.4
GGTLC2-202ENST00000448514 SYNMO15061 1565 aa23.78■■□□□ 1.4
GGTLC2-202ENST00000448514 IDI1Q13907 227 aa23.77■■□□□ 1.4
GGTLC2-202ENST00000448514 ALKQ9UM73 1620 aa23.77■■□□□ 1.4
GGTLC2-202ENST00000448514 STAG3Q9UJ98 1225 aa23.76■■□□□ 1.39
GGTLC2-202ENST00000448514 NOS1P29475 1434 aa23.76■■□□□ 1.39
GGTLC2-202ENST00000448514 STRCP1A6NGW2 1772 aa23.75■■□□□ 1.39
GGTLC2-202ENST00000448514 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
GGTLC2-202ENST00000448514 PIK3C2BO00750 1634 aa23.74■■□□□ 1.39
GGTLC2-202ENST00000448514 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
GGTLC2-202ENST00000448514 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.74■■□□□ 1.39
GGTLC2-202ENST00000448514 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.73■■□□□ 1.39
GGTLC2-202ENST00000448514 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.72■■□□□ 1.39
GGTLC2-202ENST00000448514 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
GGTLC2-202ENST00000448514 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
GGTLC2-202ENST00000448514 KCNA6P17658 529 aa23.65■■□□□ 1.38
GGTLC2-202ENST00000448514 ADGRB3O60242 1522 aa23.64■■□□□ 1.38
GGTLC2-202ENST00000448514 TET3O43151 1660 aa23.64■■□□□ 1.38
GGTLC2-202ENST00000448514 ROCK1Q13464 1354 aa23.62■■□□□ 1.37
GGTLC2-202ENST00000448514 SLC26A8Q96RN1 970 aa23.6■■□□□ 1.37
GGTLC2-202ENST00000448514 TMEM94Q12767 1356 aa23.58■■□□□ 1.37
GGTLC2-202ENST00000448514 HDGFP51858 240 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
GGTLC2-202ENST00000448514 FAM135BQ49AJ0 1406 aa23.57■■□□□ 1.36
GGTLC2-202ENST00000448514 ZFYVE9O95405 1425 aa23.56■■□□□ 1.36
GGTLC2-202ENST00000448514 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
GGTLC2-202ENST00000448514 UNC13BO14795 1591 aa23.56■■□□□ 1.36
GGTLC2-202ENST00000448514 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa23.54■■□□□ 1.36
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