RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447687.2

CD27-AS1-203, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene CD27-AS1, Length 467 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-203ENST00000447687 MPHOSPH9Q99550 1183 aa9.77□□□□□ -0.85
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CD27-AS1-203ENST00000447687 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP9.76□□□□□ -0.85
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CD27-AS1-203ENST00000447687 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa9.75□□□□□ -0.85
CD27-AS1-203ENST00000447687 FAM135AQ9P2D6 1515 aa9.75□□□□□ -0.85
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CD27-AS1-203ENST00000447687 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa9.53□□□□□ -0.88
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CD27-AS1-203ENST00000447687 ADGRB3O60242 1522 aa9.52□□□□□ -0.88
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CD27-AS1-203ENST00000447687 HDGFP51858 240 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CD27-AS1-203ENST00000447687 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
CD27-AS1-203ENST00000447687 VGFO15240 615 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
CD27-AS1-203ENST00000447687 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
CD27-AS1-203ENST00000447687 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
CD27-AS1-203ENST00000447687 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa9.46□□□□□ -0.89
CD27-AS1-203ENST00000447687 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP9.46□□□□□ -0.9
CD27-AS1-203ENST00000447687 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP9.46□□□□□ -0.9
CD27-AS1-203ENST00000447687 IFT172Q9UG01 1749 aa9.45□□□□□ -0.9
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CD27-AS1-203ENST00000447687 PLPPR3Q6T4P5 718 aa9.45□□□□□ -0.9
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