RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444384.3

SFTPD-202, Transcript of surfactant protein D, humanhuman

TSL 3

Gene SFTPD, Length 659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPD-202ENST00000444384 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.16■■■□□ 2.26
SFTPD-202ENST00000444384 NPATQ14207 1427 aa29.16■■■□□ 2.26
SFTPD-202ENST00000444384 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.15■■■□□ 2.26
SFTPD-202ENST00000444384 KIF15Q9NS87 1388 aa29.14■■■□□ 2.26
SFTPD-202ENST00000444384 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
SFTPD-202ENST00000444384 PTPRKQ15262 1439 aa29.12■■■□□ 2.25
SFTPD-202ENST00000444384 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
SFTPD-202ENST00000444384 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.1■■■□□ 2.25
SFTPD-202ENST00000444384 MROH1Q8NDA8 1641 aa29.09■■■□□ 2.25
SFTPD-202ENST00000444384 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.08■■■□□ 2.25
SFTPD-202ENST00000444384 ERBINQ96RT1 1412 aa29.08■■■□□ 2.25
SFTPD-202ENST00000444384 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.07■■■□□ 2.24
SFTPD-202ENST00000444384 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.06■■■□□ 2.24
SFTPD-202ENST00000444384 MYO3AQ8NEV4 1616 aa29.05■■■□□ 2.24
SFTPD-202ENST00000444384 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
SFTPD-202ENST00000444384 ABCC3O15438 1527 aa29.04■■■□□ 2.24
SFTPD-202ENST00000444384 ADGRL2O95490 1459 aa29.04■■■□□ 2.24
SFTPD-202ENST00000444384 NCOA1Q15788 1441 aa29.04■■■□□ 2.24
SFTPD-202ENST00000444384 PZPP20742 1482 aa29.04■■■□□ 2.24
SFTPD-202ENST00000444384 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
SFTPD-202ENST00000444384 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
SFTPD-202ENST00000444384 STRCQ7RTU9 1775 aa29■■■□□ 2.23
SFTPD-202ENST00000444384 CEP152O94986 1710 aa29■■■□□ 2.23
SFTPD-202ENST00000444384 DEPDC5O75140 1603 aa28.98■■■□□ 2.23
SFTPD-202ENST00000444384 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
SFTPD-202ENST00000444384 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
SFTPD-202ENST00000444384 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa28.95■■■□□ 2.23
SFTPD-202ENST00000444384 TNRQ92752 1358 aa28.94■■■□□ 2.22
SFTPD-202ENST00000444384 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.91■■■□□ 2.22
SFTPD-202ENST00000444384 A2ML1A8K2U0 1454 aa28.9■■■□□ 2.22
SFTPD-202ENST00000444384 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.88■■■□□ 2.21
SFTPD-202ENST00000444384 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.88■■■□□ 2.21
SFTPD-202ENST00000444384 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28.87■■■□□ 2.21
SFTPD-202ENST00000444384 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
SFTPD-202ENST00000444384 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.86■■■□□ 2.21
SFTPD-202ENST00000444384 ROCK1Q13464 1354 aa28.86■■■□□ 2.21
SFTPD-202ENST00000444384 ERVK-7P63135 1459 aa28.85■■■□□ 2.21
SFTPD-202ENST00000444384 KANK1Q14678 1352 aa28.84■■■□□ 2.21
SFTPD-202ENST00000444384 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
SFTPD-202ENST00000444384 ITGAEP38570 1179 aa28.83■■■□□ 2.21
SFTPD-202ENST00000444384 PLA2R1Q13018 1463 aa28.83■■■□□ 2.21
SFTPD-202ENST00000444384 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.82■■■□□ 2.2
SFTPD-202ENST00000444384 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.82■■■□□ 2.2
SFTPD-202ENST00000444384 NLRP1Q9C000 1473 aa28.82■■■□□ 2.2
SFTPD-202ENST00000444384 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.81■■■□□ 2.2
SFTPD-202ENST00000444384 PTPRTO14522 1441 aa28.79■■■□□ 2.2
SFTPD-202ENST00000444384 UNC13BO14795 1591 aa28.75■■■□□ 2.19
SFTPD-202ENST00000444384 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.75■■■□□ 2.19
SFTPD-202ENST00000444384 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.75■■■□□ 2.19
SFTPD-202ENST00000444384 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.74■■■□□ 2.19
SFTPD-202ENST00000444384 PKD2Q13563 968 aa28.71■■■□□ 2.19
SFTPD-202ENST00000444384 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
SFTPD-202ENST00000444384 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
SFTPD-202ENST00000444384 TET3O43151 1660 aa28.67■■■□□ 2.18
SFTPD-202ENST00000444384 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
SFTPD-202ENST00000444384 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.66■■■□□ 2.18
SFTPD-202ENST00000444384 UBR1Q8IWV7 1749 aa28.66■■■□□ 2.18
SFTPD-202ENST00000444384 SYNMO15061 1565 aa28.64■■■□□ 2.18
SFTPD-202ENST00000444384 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.64■■■□□ 2.17
SFTPD-202ENST00000444384 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.63■■■□□ 2.17
SFTPD-202ENST00000444384 NOS1P29475 1434 aa28.62■■■□□ 2.17
SFTPD-202ENST00000444384 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
SFTPD-202ENST00000444384 PIK3C2BO00750 1634 aa28.61■■■□□ 2.17
SFTPD-202ENST00000444384 CERKQ8TCT0 537 aa28.6■■■□□ 2.17
SFTPD-202ENST00000444384 LTBP4Q8N2S1 1624 aa28.59■■■□□ 2.17
SFTPD-202ENST00000444384 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.58■■■□□ 2.17
SFTPD-202ENST00000444384 NAIPQ13075 1403 aa28.57■■■□□ 2.16
SFTPD-202ENST00000444384 E9PCH4 1651 aa28.57■■■□□ 2.16
SFTPD-202ENST00000444384 NUP155O75694 1391 aa28.56■■■□□ 2.16
SFTPD-202ENST00000444384 FBXO41Q8TF61 875 aa28.56■■■□□ 2.16
SFTPD-202ENST00000444384 MED14O60244 1454 aa28.53■■■□□ 2.16
SFTPD-202ENST00000444384 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
SFTPD-202ENST00000444384 ARHGAP23Q9P227 1491 aa28.53■■■□□ 2.16
SFTPD-202ENST00000444384 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
SFTPD-202ENST00000444384 IDI1Q13907 227 aa28.52■■■□□ 2.16
SFTPD-202ENST00000444384 SLIT1O75093 1534 aa28.52■■■□□ 2.16
SFTPD-202ENST00000444384 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
SFTPD-202ENST00000444384 IQGAP1P46940 1657 aa28.51■■■□□ 2.15
SFTPD-202ENST00000444384 HFM1A2PYH4 1435 aa28.51■■■□□ 2.15
SFTPD-202ENST00000444384 ADGRB3O60242 1522 aa28.49■■■□□ 2.15
SFTPD-202ENST00000444384 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
SFTPD-202ENST00000444384 STAG3Q9UJ98 1225 aa28.48■■■□□ 2.15
SFTPD-202ENST00000444384 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.47■■■□□ 2.15
SFTPD-202ENST00000444384 TMEM2Q9UHN6 1383 aa28.46■■■□□ 2.15
SFTPD-202ENST00000444384 LTKP29376 864 aa28.43■■■□□ 2.14
SFTPD-202ENST00000444384 MYO5BQ9ULV0 1848 aa28.41■■■□□ 2.14
SFTPD-202ENST00000444384 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.41■■■□□ 2.14
SFTPD-202ENST00000444384 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.4■■■□□ 2.14
SFTPD-202ENST00000444384 EID1Q9Y6B2 187 aa28.38■■■□□ 2.13
SFTPD-202ENST00000444384 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa28.38■■■□□ 2.13
SFTPD-202ENST00000444384 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa28.38■■■□□ 2.13
SFTPD-202ENST00000444384 CPS1P31327 1500 aa28.33■■■□□ 2.13
SFTPD-202ENST00000444384 TRIM52Q96A61 297 aa28.31■■■□□ 2.12
SFTPD-202ENST00000444384 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.31■■■□□ 2.12
SFTPD-202ENST00000444384 ZFYVE9O95405 1425 aa28.3■■■□□ 2.12
SFTPD-202ENST00000444384 CHGAP10645 457 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
SFTPD-202ENST00000444384 RIMS2Q9UQ26 1411 aa28.27■■■□□ 2.12
SFTPD-202ENST00000444384 TRPM2O94759 1503 aa28.26■■■□□ 2.11
SFTPD-202ENST00000444384 CLTCL1P53675 1640 aa28.23■■■□□ 2.11
SFTPD-202ENST00000444384 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms