RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441400.5

AFF3-212, Transcript of AF4/FMR2 family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene AFF3, Length 543 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF3-212ENST00000441400 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP41.81■■■■■ 4.28
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AFF3-212ENST00000441400 SHANK2Q9UPX8 1470 aa41.8■■■■■ 4.28
AFF3-212ENST00000441400 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP41.79■■■■■ 4.28
AFF3-212ENST00000441400 FBXO41Q8TF61 875 aa41.77■■■■■ 4.28
AFF3-212ENST00000441400 NCOA1Q15788 1441 aa41.77■■■■■ 4.28
AFF3-212ENST00000441400 ABCC5O15440 1437 aa41.75■■■■■ 4.27
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AFF3-212ENST00000441400 PZPP20742 1482 aa41.73■■■■■ 4.27
AFF3-212ENST00000441400 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa41.73■■■■■ 4.27
AFF3-212ENST00000441400 DUOX2Q9NRD8 1548 aa41.73■■■■■ 4.27
AFF3-212ENST00000441400 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa41.73■■■■■ 4.27
AFF3-212ENST00000441400 DAPK1P53355 1430 aa41.69■■■■■ 4.27
AFF3-212ENST00000441400 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP41.68■■■■■ 4.26
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AFF3-212ENST00000441400 MROH1Q8NDA8 1641 aa41.64■■■■■ 4.26
AFF3-212ENST00000441400 KIF15Q9NS87 1388 aa41.63■■■■■ 4.26
AFF3-212ENST00000441400 A2ML1A8K2U0 1454 aa41.63■■■■■ 4.25
AFF3-212ENST00000441400 ABCC3O15438 1527 aa41.63■■■■■ 4.25
AFF3-212ENST00000441400 TNRQ92752 1358 aa41.62■■■■■ 4.25
AFF3-212ENST00000441400 CERKQ8TCT0 537 aa41.6■■■■■ 4.25
AFF3-212ENST00000441400 ERBINQ96RT1 1412 aa41.6■■■■■ 4.25
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AFF3-212ENST00000441400 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa41.52■■■■■ 4.24
AFF3-212ENST00000441400 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP41.52■■■■■ 4.24
AFF3-212ENST00000441400 CEP152O94986 1710 aa41.5■■■■■ 4.23
AFF3-212ENST00000441400 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa41.5■■■■■ 4.23
AFF3-212ENST00000441400 NLRP1Q9C000 1473 aa41.49■■■■■ 4.23
AFF3-212ENST00000441400 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa41.47■■■■■ 4.23
AFF3-212ENST00000441400 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa41.47■■■■■ 4.23
AFF3-212ENST00000441400 DEPDC5O75140 1603 aa41.47■■■■■ 4.23
AFF3-212ENST00000441400 ADGRL2O95490 1459 aa41.44■■■■■ 4.22
AFF3-212ENST00000441400 LTBP4Q8N2S1 1624 aa41.41■■■■■ 4.22
AFF3-212ENST00000441400 CHIC2Q9UKJ5 165 aa41.41■■■■■ 4.22
AFF3-212ENST00000441400 ERVK-7P63135 1459 aa41.41■■■■■ 4.22
AFF3-212ENST00000441400 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP41.39■■■■■ 4.22
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AFF3-212ENST00000441400 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa41.36■■■■■ 4.21
AFF3-212ENST00000441400 UGGT1Q9NYU2 1555 aa41.36■■■■■ 4.21
AFF3-212ENST00000441400 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP41.32■■■■■ 4.21
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AFF3-212ENST00000441400 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP41.32■■■■■ 4.2
AFF3-212ENST00000441400 VWDEQ8N2E2 1590 aa41.29■■■■■ 4.2
AFF3-212ENST00000441400 NEURL4Q96JN8 1562 aa41.29■■■■■ 4.2
AFF3-212ENST00000441400 LMTK2Q8IWU2 1503 aa41.28■■■■■ 4.2
AFF3-212ENST00000441400 IQSEC2Q5JU85 1478 aa41.28■■■■■ 4.2
AFF3-212ENST00000441400 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP41.26■■■■■ 4.2
AFF3-212ENST00000441400 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41.25■■■■■ 4.19
AFF3-212ENST00000441400 ANKLE2Q86XL3 938 aa41.22■■■■■ 4.19
AFF3-212ENST00000441400 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP41.21■■■■■ 4.19
AFF3-212ENST00000441400 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa41.2■■■■■ 4.19
AFF3-212ENST00000441400 UBR1Q8IWV7 1749 aa41.18■■■■■ 4.18
AFF3-212ENST00000441400 MED14O60244 1454 aa41.17■■■■■ 4.18
AFF3-212ENST00000441400 EFCAB6Q5THR3 1501 aa41.13■■■■■ 4.17
AFF3-212ENST00000441400 ROCK1Q13464 1354 aa41.12■■■■■ 4.17
AFF3-212ENST00000441400 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP41.1■■■■■ 4.17
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AFF3-212ENST00000441400 UNC13BO14795 1591 aa41.03■■■■■ 4.16
AFF3-212ENST00000441400 SLIT1O75093 1534 aa41.03■■■■■ 4.16
AFF3-212ENST00000441400 ARHGAP23Q9P227 1491 aa41.02■■■■■ 4.16
AFF3-212ENST00000441400 NOS1P29475 1434 aa41.01■■■■■ 4.16
AFF3-212ENST00000441400 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP41.01■■■■■ 4.16
AFF3-212ENST00000441400 SYNMO15061 1565 aa41■■■■■ 4.15
AFF3-212ENST00000441400 CPS1P31327 1500 aa41■■■■■ 4.15
AFF3-212ENST00000441400 TET3O43151 1660 aa41■■■■■ 4.15
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AFF3-212ENST00000441400 IDI1Q13907 227 aa40.91■■■■■ 4.14
AFF3-212ENST00000441400 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP40.9■■■■■ 4.14
AFF3-212ENST00000441400 TMEM2Q9UHN6 1383 aa40.88■■■■■ 4.14
AFF3-212ENST00000441400 IQGAP3Q86VI3 1631 aa40.87■■■■■ 4.13
AFF3-212ENST00000441400 LTKP29376 864 aa40.87■■■■■ 4.13
AFF3-212ENST00000441400 ITGAEP38570 1179 aa40.87■■■■■ 4.13
AFF3-212ENST00000441400 SLC52A1Q9NWF4 448 aa40.87■■■■■ 4.13
AFF3-212ENST00000441400 TXNDC2Q86VQ3 553 aa40.86■■■■■ 4.13
AFF3-212ENST00000441400 STAG3Q9UJ98 1225 aa40.86■■■■■ 4.13
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AFF3-212ENST00000441400 EID1Q9Y6B2 187 aa40.85■■■■■ 4.13
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AFF3-212ENST00000441400 TOM1O60784 492 aa40.63■■■■■ 4.09
AFF3-212ENST00000441400 ZFYVE9O95405 1425 aa40.61■■■■■ 4.09
AFF3-212ENST00000441400 NAIPQ13075 1403 aa40.59■■■■■ 4.09
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AFF3-212ENST00000441400 HDGFP51858 240 aaKnown RBP40.52■■■■■ 4.08
AFF3-212ENST00000441400 HFM1A2PYH4 1435 aa40.5■■■■■ 4.07
AFF3-212ENST00000441400 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa40.5■■■■■ 4.07
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