RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000432588.5

ACTB-205, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-205ENST00000432588 PKD2Q13563 968 aa25.54■■□□□ 1.68
ACTB-205ENST00000432588 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
ACTB-205ENST00000432588 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.53■■□□□ 1.68
ACTB-205ENST00000432588 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.53■■□□□ 1.68
ACTB-205ENST00000432588 MIA2Q96PC5 1412 aa25.51■■□□□ 1.67
ACTB-205ENST00000432588 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.5■■□□□ 1.67
ACTB-205ENST00000432588 LTBP4Q8N2S1 1624 aa25.5■■□□□ 1.67
ACTB-205ENST00000432588 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.49■■□□□ 1.67
ACTB-205ENST00000432588 PZPP20742 1482 aa25.48■■□□□ 1.67
ACTB-205ENST00000432588 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
ACTB-205ENST00000432588 APLP2Q06481 763 aa25.48■■□□□ 1.67
ACTB-205ENST00000432588 TNRQ92752 1358 aa25.47■■□□□ 1.67
ACTB-205ENST00000432588 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.47■■□□□ 1.67
ACTB-205ENST00000432588 IQSEC2Q5JU85 1478 aa25.47■■□□□ 1.67
ACTB-205ENST00000432588 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
ACTB-205ENST00000432588 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
ACTB-205ENST00000432588 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
ACTB-205ENST00000432588 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
ACTB-205ENST00000432588 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
ACTB-205ENST00000432588 NLRP1Q9C000 1473 aa25.38■■□□□ 1.65
ACTB-205ENST00000432588 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
ACTB-205ENST00000432588 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
ACTB-205ENST00000432588 ABCC3O15438 1527 aa25.35■■□□□ 1.65
ACTB-205ENST00000432588 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.34■■□□□ 1.65
ACTB-205ENST00000432588 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.32■■□□□ 1.64
ACTB-205ENST00000432588 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.32■■□□□ 1.64
ACTB-205ENST00000432588 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
ACTB-205ENST00000432588 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.31■■□□□ 1.64
ACTB-205ENST00000432588 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.31■■□□□ 1.644e-28■■□□□ 12.2
ACTB-205ENST00000432588 KIF15Q9NS87 1388 aa25.31■■□□□ 1.64
ACTB-205ENST00000432588 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.3■■□□□ 1.64
ACTB-205ENST00000432588 ABCC5O15440 1437 aa25.29■■□□□ 1.64
ACTB-205ENST00000432588 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.28■■□□□ 1.64
ACTB-205ENST00000432588 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.27■■□□□ 1.64
ACTB-205ENST00000432588 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.27■■□□□ 1.64
ACTB-205ENST00000432588 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.27■■□□□ 1.64
ACTB-205ENST00000432588 UBAP1LF5GYI3 381 aa25.27■■□□□ 1.64
ACTB-205ENST00000432588 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.27■■□□□ 1.64
ACTB-205ENST00000432588 ERBINQ96RT1 1412 aa25.27■■□□□ 1.64
ACTB-205ENST00000432588 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.26■■□□□ 1.63
ACTB-205ENST00000432588 ERVK-7P63135 1459 aa25.26■■□□□ 1.63
ACTB-205ENST00000432588 DAPK1P53355 1430 aa25.25■■□□□ 1.63
ACTB-205ENST00000432588 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.22■■□□□ 1.63
ACTB-205ENST00000432588 CEP152O94986 1710 aa25.22■■□□□ 1.63
ACTB-205ENST00000432588 DEPDC5O75140 1603 aa25.22■■□□□ 1.63
ACTB-205ENST00000432588 CPS1P31327 1500 aa25.22■■□□□ 1.63
ACTB-205ENST00000432588 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
ACTB-205ENST00000432588 MED14O60244 1454 aa25.21■■□□□ 1.63
ACTB-205ENST00000432588 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.63
ACTB-205ENST00000432588 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.19■■□□□ 1.62
ACTB-205ENST00000432588 KANK1Q14678 1352 aa25.18■■□□□ 1.62
ACTB-205ENST00000432588 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.18■■□□□ 1.622e-37■□□□□ 8.4
ACTB-205ENST00000432588 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.18■■□□□ 1.62
ACTB-205ENST00000432588 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.16■■□□□ 1.62
ACTB-205ENST00000432588 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.14■■□□□ 1.61
ACTB-205ENST00000432588 IQGAP1P46940 1657 aa25.13■■□□□ 1.61
ACTB-205ENST00000432588 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
ACTB-205ENST00000432588 TOM1O60784 492 aa25.12■■□□□ 1.61
ACTB-205ENST00000432588 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.11■■□□□ 1.61
ACTB-205ENST00000432588 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
ACTB-205ENST00000432588 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
ACTB-205ENST00000432588 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
ACTB-205ENST00000432588 ADGRL2O95490 1459 aa25.06■■□□□ 1.6
ACTB-205ENST00000432588 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.06■■□□□ 1.6
ACTB-205ENST00000432588 PIP4K2BP78356 416 aa25.05■■□□□ 1.6
ACTB-205ENST00000432588 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.05■■□□□ 1.6
ACTB-205ENST00000432588 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.05■■□□□ 1.6
ACTB-205ENST00000432588 EID1Q9Y6B2 187 aa25.05■■□□□ 1.6
ACTB-205ENST00000432588 SLIT1O75093 1534 aa25.05■■□□□ 1.6
ACTB-205ENST00000432588 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.04■■□□□ 1.6
ACTB-205ENST00000432588 LTKP29376 864 aa25.02■■□□□ 1.6
ACTB-205ENST00000432588 ILDR2Q71H61 639 aa25.01■■□□□ 1.59
ACTB-205ENST00000432588 PIK3C2BO00750 1634 aa25.01■■□□□ 1.59
ACTB-205ENST00000432588 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.99■■□□□ 1.59
ACTB-205ENST00000432588 SYNMO15061 1565 aa24.98■■□□□ 1.59
ACTB-205ENST00000432588 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.98■■□□□ 1.59
ACTB-205ENST00000432588 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.98■■□□□ 1.59
ACTB-205ENST00000432588 LRRC7Q96NW7 1537 aa24.97■■□□□ 1.59
ACTB-205ENST00000432588 HSPA1LP34931 641 aa24.97■■□□□ 1.59
ACTB-205ENST00000432588 IDI1Q13907 227 aa24.97■■□□□ 1.59
ACTB-205ENST00000432588 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
ACTB-205ENST00000432588 STRCP1A6NGW2 1772 aa24.95■■□□□ 1.58
ACTB-205ENST00000432588 NOS1P29475 1434 aa24.95■■□□□ 1.58
ACTB-205ENST00000432588 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.93■■□□□ 1.58
ACTB-205ENST00000432588 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
ACTB-205ENST00000432588 SOCS7O14512 581 aa24.91■■□□□ 1.58
ACTB-205ENST00000432588 ADGRB3O60242 1522 aa24.89■■□□□ 1.57
ACTB-205ENST00000432588 ALKQ9UM73 1620 aa24.89■■□□□ 1.57
ACTB-205ENST00000432588 ROCK1Q13464 1354 aa24.86■■□□□ 1.57
ACTB-205ENST00000432588 TET3O43151 1660 aa24.85■■□□□ 1.57
ACTB-205ENST00000432588 UNC13BO14795 1591 aa24.83■■□□□ 1.57
ACTB-205ENST00000432588 BCANQ96GW7 911 aa24.81■■□□□ 1.56
ACTB-205ENST00000432588 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.81■■□□□ 1.56
ACTB-205ENST00000432588 KCNA6P17658 529 aa24.8■■□□□ 1.56
ACTB-205ENST00000432588 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
ACTB-205ENST00000432588 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.8■■□□□ 1.56
ACTB-205ENST00000432588 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
ACTB-205ENST00000432588 ITGAEP38570 1179 aa24.77■■□□□ 1.56
ACTB-205ENST00000432588 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
ACTB-205ENST00000432588 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
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