RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429755.8

HOXB-AS3-201, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 435 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-201ENST00000429755 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
HOXB-AS3-201ENST00000429755 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXB-AS3-201ENST00000429755 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PZPP20742 1482 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
HOXB-AS3-201ENST00000429755 LTBP4Q8N2S1 1624 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TNRQ92752 1358 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXB-AS3-201ENST00000429755 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
HOXB-AS3-201ENST00000429755 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NLRP1Q9C000 1473 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXB-AS3-201ENST00000429755 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
HOXB-AS3-201ENST00000429755 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
HOXB-AS3-201ENST00000429755 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
HOXB-AS3-201ENST00000429755 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ABCC5O15440 1437 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ABCC3O15438 1527 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ERBINQ96RT1 1412 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KIF15Q9NS87 1388 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-201ENST00000429755 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-201ENST00000429755 UGGT1Q9NYU2 1555 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-201ENST00000429755 DAPK1P53355 1430 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MED14O60244 1454 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-201ENST00000429755 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.03■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-201ENST00000429755 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.02■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.02■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MROH1Q8NDA8 1641 aa24.01■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ERVK-7P63135 1459 aa24■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-201ENST00000429755 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-201ENST00000429755 DEPDC5O75140 1603 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KANK1Q14678 1352 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CPS1P31327 1500 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NEURL4Q96JN8 1562 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-201ENST00000429755 UBAP1LF5GYI3 381 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ADGRL2O95490 1459 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TOM1O60784 492 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-201ENST00000429755 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.9■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CEP152O94986 1710 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-201ENST00000429755 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.89■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.89■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-201ENST00000429755 EID1Q9Y6B2 187 aa23.86■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ARHGAP23Q9P227 1491 aa23.86■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-201ENST00000429755 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.86■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-201ENST00000429755 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SLIT1O75093 1534 aa23.84■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-201ENST00000429755 UBR1Q8IWV7 1749 aa23.84■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-201ENST00000429755 IQGAP1P46940 1657 aa23.84■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-201ENST00000429755 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.84■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TXNDC2Q86VQ3 553 aa23.84■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.83■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.81■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-201ENST00000429755 LTKP29376 864 aa23.8■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-201ENST00000429755 IDI1Q13907 227 aa23.8■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-201ENST00000429755 STAG3Q9UJ98 1225 aa23.8■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TMEM2Q9UHN6 1383 aa23.79■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NOS1P29475 1434 aa23.78■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-201ENST00000429755 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ROCK1Q13464 1354 aa23.75■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-201ENST00000429755 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-201ENST00000429755 LRRC7Q96NW7 1537 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PIK3C2BO00750 1634 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-201ENST00000429755 HDGFP51858 240 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SYNMO15061 1565 aa23.7■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PIP4K2BP78356 416 aa23.7■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-201ENST00000429755 HSPA1LP34931 641 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ILDR2Q71H61 639 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-201ENST00000429755 STRCP1A6NGW2 1772 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KCNA6P17658 529 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TET3O43151 1660 aa23.64■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SOCS7O14512 581 aa23.64■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ADGRB3O60242 1522 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-201ENST00000429755 UNC13BO14795 1591 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ALKQ9UM73 1620 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP23.59■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-201ENST00000429755 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.58■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SLC26A8Q96RN1 970 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NUP155O75694 1391 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ZFYVE9O95405 1425 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TBX22Q9Y458 520 aa23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms