RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428469.1

JTB-204, Transcript of jumping translocation breakpoint, humanhuman

TSL 3

Gene JTB, Length 520 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JTB-204ENST00000428469 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa15.56■□□□□ 0.08
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JTB-204ENST00000428469 KDM5DQ9BY66 1539 aa15.54■□□□□ 0.08
JTB-204ENST00000428469 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
JTB-204ENST00000428469 MAST1Q9Y2H9 1570 aa15.53■□□□□ 0.08
JTB-204ENST00000428469 MIA2Q96PC5 1412 aa15.51■□□□□ 0.07
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JTB-204ENST00000428469 LTBP4Q8N2S1 1624 aa15.51■□□□□ 0.07
JTB-204ENST00000428469 A2ML1A8K2U0 1454 aa15.51■□□□□ 0.07
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JTB-204ENST00000428469 PLA2R1Q13018 1463 aa15.5■□□□□ 0.07
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JTB-204ENST00000428469 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
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JTB-204ENST00000428469 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
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JTB-204ENST00000428469 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa15.45■□□□□ 0.06
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JTB-204ENST00000428469 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP15.43■□□□□ 0.06
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JTB-204ENST00000428469 NLRP1Q9C000 1473 aa15.41■□□□□ 0.06
JTB-204ENST00000428469 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP15.41■□□□□ 0.064e-9■□□□□ 9.5
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JTB-204ENST00000428469 NEURL4Q96JN8 1562 aa15.41■□□□□ 0.06
JTB-204ENST00000428469 SHANK2Q9UPX8 1470 aa15.4■□□□□ 0.06
JTB-204ENST00000428469 ANKLE2Q86XL3 938 aa15.4■□□□□ 0.06
JTB-204ENST00000428469 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa15.39■□□□□ 0.05
JTB-204ENST00000428469 ERVK-7P63135 1459 aa15.39■□□□□ 0.05
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JTB-204ENST00000428469 ERBINQ96RT1 1412 aa15.37■□□□□ 0.05
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JTB-204ENST00000428469 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
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JTB-204ENST00000428469 STAG3Q9UJ98 1225 aa15.29■□□□□ 0.04
JTB-204ENST00000428469 PIK3C2BO00750 1634 aa15.28■□□□□ 0.04
JTB-204ENST00000428469 ILDR2Q71H61 639 aa15.28■□□□□ 0.04
JTB-204ENST00000428469 STRCP1A6NGW2 1772 aa15.28■□□□□ 0.04
JTB-204ENST00000428469 TXNDC2Q86VQ3 553 aa15.27■□□□□ 0.04
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JTB-204ENST00000428469 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
JTB-204ENST00000428469 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
JTB-204ENST00000428469 LTKP29376 864 aa15.25■□□□□ 0.03
JTB-204ENST00000428469 LMTK2Q8IWU2 1503 aa15.24■□□□□ 0.03
JTB-204ENST00000428469 EID1Q9Y6B2 187 aa15.24■□□□□ 0.03
JTB-204ENST00000428469 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa15.24■□□□□ 0.03
JTB-204ENST00000428469 SLIT1O75093 1534 aa15.23■□□□□ 0.03
JTB-204ENST00000428469 ARHGAP23Q9P227 1491 aa15.23■□□□□ 0.03
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JTB-204ENST00000428469 EFCAB6Q5THR3 1501 aa15.22■□□□□ 0.03
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JTB-204ENST00000428469 BCANQ96GW7 911 aa15.17■□□□□ 0.02
JTB-204ENST00000428469 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
JTB-204ENST00000428469 SLC52A1Q9NWF4 448 aa15.16■□□□□ 0.02
JTB-204ENST00000428469 ALKQ9UM73 1620 aa15.16■□□□□ 0.02
JTB-204ENST00000428469 ADGRB3O60242 1522 aa15.16■□□□□ 0.02
JTB-204ENST00000428469 UNC13BO14795 1591 aa15.15■□□□□ 0.02
JTB-204ENST00000428469 SLC26A8Q96RN1 970 aa15.15■□□□□ 0.02
JTB-204ENST00000428469 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
JTB-204ENST00000428469 CHGAP10645 457 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
JTB-204ENST00000428469 E9PCH4 1651 aa15.12■□□□□ 0.01
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