RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427644.1

LIMD1-AS1-201, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMD1-AS1, Length 1,536 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KDM5CP41229 1560 aa14.42□□□□□ -0.1
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP14.41□□□□□ -0.1
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KIF15Q9NS87 1388 aa14.41□□□□□ -0.1
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP14.41□□□□□ -0.1
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa14.41□□□□□ -0.1
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 AFAP1Q8N556 730 aa14.41□□□□□ -0.1
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ABCA6Q8N139 1617 aa14.29□□□□□ -0.12
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 UNC13BO14795 1591 aa14.28□□□□□ -0.12
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa14.28□□□□□ -0.12
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 REREQ9P2R6 1566 aa14.25□□□□□ -0.13
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ATP10AO60312 1499 aa14.24□□□□□ -0.13
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 BCORL1Q5H9F3 1711 aa14.24□□□□□ -0.13
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DEPDC5O75140 1603 aa14.24□□□□□ -0.13
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 YEATS2Q9ULM3 1422 aa14.23□□□□□ -0.13
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FAM135AQ9P2D6 1515 aa14.21□□□□□ -0.13
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 AGLP35573 1532 aa14.19□□□□□ -0.14
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TET3O43151 1660 aa14.15□□□□□ -0.14
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GGT6Q6P531 493 aa14.14□□□□□ -0.15
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LMTK2Q8IWU2 1503 aa14.13□□□□□ -0.15
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa14.11□□□□□ -0.15
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CEP152O94986 1710 aa14.11□□□□□ -0.15
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 EFCAB6Q5THR3 1501 aa14.1□□□□□ -0.15
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ABCC3O15438 1527 aa14.09□□□□□ -0.15
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 E9PCH4 1651 aa14.08□□□□□ -0.15
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 L3MBTL2Q969R5 705 aa14.08□□□□□ -0.16
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CCDC144AA2RUR9 1427 aa14.06□□□□□ -0.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa14.05□□□□□ -0.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa14.05□□□□□ -0.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa14.04□□□□□ -0.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TRPM2O94759 1503 aa14.04□□□□□ -0.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CNTLNQ9NXG0 1405 aa14.03□□□□□ -0.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PLA2R1Q13018 1463 aa14.03□□□□□ -0.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MLECQ14165 292 aa14.02□□□□□ -0.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PTPRTO14522 1441 aa14.02□□□□□ -0.17
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NPATQ14207 1427 aa14.01□□□□□ -0.17
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NBPF8Q3BBV2 869 aa14□□□□□ -0.17
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MROH2AA6NES4 1674 aa14□□□□□ -0.17
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa13.97□□□□□ -0.17
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PREX1Q8TCU6 1659 aa13.97□□□□□ -0.17
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NOS1P29475 1434 aa13.96□□□□□ -0.17
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KIF1BO60333 1816 aa13.95□□□□□ -0.18
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CLTCL1P53675 1640 aa13.95□□□□□ -0.18
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NEURL4Q96JN8 1562 aa13.95□□□□□ -0.18
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZMYM3Q14202 1370 aa13.95□□□□□ -0.18
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SLC52A1Q9NWF4 448 aa13.94□□□□□ -0.18
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ERVK-7P63135 1459 aa13.93□□□□□ -0.18
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa13.93□□□□□ -0.18
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