RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 HSPA2P54652 639 aa38.32■■■■□ 3.72
HTATSF1-202ENST00000425695 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa38.32■■■■□ 3.72
HTATSF1-202ENST00000425695 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP38.31■■■■□ 3.72
HTATSF1-202ENST00000425695 ITGAEP38570 1179 aa38.3■■■■□ 3.72
HTATSF1-202ENST00000425695 NCOA1Q15788 1441 aa38.29■■■■□ 3.72
HTATSF1-202ENST00000425695 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP38.27■■■■□ 3.72
HTATSF1-202ENST00000425695 PTPRKQ15262 1439 aa38.26■■■■□ 3.72
HTATSF1-202ENST00000425695 PREX1Q8TCU6 1659 aa38.26■■■■□ 3.71
HTATSF1-202ENST00000425695 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP38.23■■■■□ 3.71
HTATSF1-202ENST00000425695 KDM5DQ9BY66 1539 aa38.22■■■■□ 3.71
HTATSF1-202ENST00000425695 ADGRL2O95490 1459 aa38.22■■■■□ 3.71
HTATSF1-202ENST00000425695 ERBINQ96RT1 1412 aa38.22■■■■□ 3.71
HTATSF1-202ENST00000425695 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa38.21■■■■□ 3.71
HTATSF1-202ENST00000425695 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP38.2■■■■□ 3.712e-8■■■■■ 27.2
HTATSF1-202ENST00000425695 NPATQ14207 1427 aa38.19■■■■□ 3.7
HTATSF1-202ENST00000425695 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP38.18■■■■□ 3.7
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM135AQ9P2D6 1515 aa38.16■■■■□ 3.7
HTATSF1-202ENST00000425695 MROH1Q8NDA8 1641 aa38.16■■■■□ 3.7
HTATSF1-202ENST00000425695 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP38.15■■■■□ 3.7
HTATSF1-202ENST00000425695 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP38.12■■■■□ 3.69
HTATSF1-202ENST00000425695 ABCC3O15438 1527 aa38.12■■■■□ 3.69
HTATSF1-202ENST00000425695 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa38.08■■■■□ 3.69
HTATSF1-202ENST00000425695 CEP152O94986 1710 aa38.07■■■■□ 3.69
HTATSF1-202ENST00000425695 PZPP20742 1482 aa38.07■■■■□ 3.68
HTATSF1-202ENST00000425695 ROCK1Q13464 1354 aa38.06■■■■□ 3.68
HTATSF1-202ENST00000425695 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP38.05■■■■□ 3.68
HTATSF1-202ENST00000425695 KANK1Q14678 1352 aa38.04■■■■□ 3.68
HTATSF1-202ENST00000425695 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP38.03■■■■□ 3.68
HTATSF1-202ENST00000425695 DEPDC5O75140 1603 aa38.02■■■■□ 3.68
HTATSF1-202ENST00000425695 TNRQ92752 1358 aa38.01■■■■□ 3.68
HTATSF1-202ENST00000425695 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP37.99■■■■□ 3.67
HTATSF1-202ENST00000425695 MYO3AQ8NEV4 1616 aa37.98■■■■□ 3.67
HTATSF1-202ENST00000425695 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa37.98■■■■□ 3.67
HTATSF1-202ENST00000425695 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP37.91■■■■□ 3.66
HTATSF1-202ENST00000425695 VWDEQ8N2E2 1590 aa37.88■■■■□ 3.65
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP37.88■■■■□ 3.65
HTATSF1-202ENST00000425695 STRCQ7RTU9 1775 aa37.88■■■■□ 3.65
HTATSF1-202ENST00000425695 A2ML1A8K2U0 1454 aa37.87■■■■□ 3.65
HTATSF1-202ENST00000425695 ERVK-7P63135 1459 aa37.87■■■■□ 3.65
HTATSF1-202ENST00000425695 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa37.85■■■■□ 3.65
HTATSF1-202ENST00000425695 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa37.84■■■■□ 3.65
HTATSF1-202ENST00000425695 LMTK2Q8IWU2 1503 aa37.83■■■■□ 3.65
HTATSF1-202ENST00000425695 DMRT2Q9Y5R5 561 aa37.79■■■■□ 3.64
HTATSF1-202ENST00000425695 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa37.79■■■■□ 3.64
HTATSF1-202ENST00000425695 NLRP1Q9C000 1473 aa37.78■■■■□ 3.64
HTATSF1-202ENST00000425695 UNC13BO14795 1591 aa37.78■■■■□ 3.64
HTATSF1-202ENST00000425695 NUP155O75694 1391 aa37.74■■■■□ 3.63
HTATSF1-202ENST00000425695 EFCAB6Q5THR3 1501 aa37.73■■■■□ 3.63
HTATSF1-202ENST00000425695 NAIPQ13075 1403 aa37.73■■■■□ 3.63
HTATSF1-202ENST00000425695 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP37.72■■■■□ 3.63
HTATSF1-202ENST00000425695 UGGT1Q9NYU2 1555 aa37.71■■■■□ 3.63
HTATSF1-202ENST00000425695 PLA2R1Q13018 1463 aa37.69■■■■□ 3.62
HTATSF1-202ENST00000425695 PKD2Q13563 968 aa37.68■■■■□ 3.62
HTATSF1-202ENST00000425695 TET3O43151 1660 aa37.68■■■■□ 3.62
HTATSF1-202ENST00000425695 PTPRTO14522 1441 aa37.66■■■■□ 3.62
HTATSF1-202ENST00000425695 GCC2Q8IWJ2 1684 aa37.64■■■■□ 3.62
HTATSF1-202ENST00000425695 IQGAP3Q86VI3 1631 aa37.64■■■■□ 3.62
HTATSF1-202ENST00000425695 HFM1A2PYH4 1435 aa37.63■■■■□ 3.61
HTATSF1-202ENST00000425695 NOS1P29475 1434 aa37.61■■■■□ 3.61
HTATSF1-202ENST00000425695 IDI1Q13907 227 aa37.61■■■■□ 3.61
HTATSF1-202ENST00000425695 ANKLE2Q86XL3 938 aa37.6■■■■□ 3.61
HTATSF1-202ENST00000425695 SYNMO15061 1565 aa37.59■■■■□ 3.61
HTATSF1-202ENST00000425695 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP37.59■■■■□ 3.61
HTATSF1-202ENST00000425695 STAG3Q9UJ98 1225 aa37.59■■■■□ 3.61
HTATSF1-202ENST00000425695 TRIM52Q96A61 297 aa37.57■■■■□ 3.6
HTATSF1-202ENST00000425695 E9PCH4 1651 aa37.56■■■■□ 3.6
HTATSF1-202ENST00000425695 UBR1Q8IWV7 1749 aa37.56■■■■□ 3.6
HTATSF1-202ENST00000425695 PIK3C2BO00750 1634 aa37.55■■■■□ 3.6
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC52A1Q9NWF4 448 aa37.52■■■■□ 3.6
HTATSF1-202ENST00000425695 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP37.51■■■■□ 3.6
HTATSF1-202ENST00000425695 NEURL4Q96JN8 1562 aa37.46■■■■□ 3.59
HTATSF1-202ENST00000425695 TXNDC2Q86VQ3 553 aa37.43■■■■□ 3.58
HTATSF1-202ENST00000425695 CERKQ8TCT0 537 aa37.43■■■■□ 3.58
HTATSF1-202ENST00000425695 LTKP29376 864 aa37.42■■■■□ 3.58
HTATSF1-202ENST00000425695 CHGAP10645 457 aaKnown RBP37.41■■■■□ 3.58
HTATSF1-202ENST00000425695 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP37.4■■■■□ 3.58
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP37.39■■■■□ 3.58
HTATSF1-202ENST00000425695 EID1Q9Y6B2 187 aa37.39■■■■□ 3.58
HTATSF1-202ENST00000425695 TMEM2Q9UHN6 1383 aa37.39■■■■□ 3.58
HTATSF1-202ENST00000425695 ARHGAP23Q9P227 1491 aa37.38■■■■□ 3.57
HTATSF1-202ENST00000425695 ADGRB3O60242 1522 aa37.37■■■■□ 3.57
HTATSF1-202ENST00000425695 SLIT1O75093 1534 aa37.37■■■■□ 3.57
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP37.37■■■■□ 3.57
HTATSF1-202ENST00000425695 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP37.36■■■■□ 3.57
HTATSF1-202ENST00000425695 MED14O60244 1454 aa37.36■■■■□ 3.57
HTATSF1-202ENST00000425695 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP37.35■■■■□ 3.57
HTATSF1-202ENST00000425695 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP37.35■■■■□ 3.57
HTATSF1-202ENST00000425695 SETD5Q9C0A6 1442 aa37.33■■■■□ 3.57
HTATSF1-202ENST00000425695 MYO5BQ9ULV0 1848 aa37.31■■■■□ 3.56
HTATSF1-202ENST00000425695 LTBP4Q8N2S1 1624 aa37.31■■■■□ 3.56
HTATSF1-202ENST00000425695 IQGAP1P46940 1657 aa37.31■■■■□ 3.56
HTATSF1-202ENST00000425695 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa37.3■■■■□ 3.56
HTATSF1-202ENST00000425695 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa37.28■■■■□ 3.56
HTATSF1-202ENST00000425695 FBXO41Q8TF61 875 aa37.25■■■■□ 3.55
HTATSF1-202ENST00000425695 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP37.25■■■■□ 3.55
HTATSF1-202ENST00000425695 FOXD1Q16676 465 aa37.23■■■■□ 3.55
HTATSF1-202ENST00000425695 MPHOSPH9Q99550 1183 aa37.22■■■■□ 3.55
HTATSF1-202ENST00000425695 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa37.21■■■■□ 3.55
HTATSF1-202ENST00000425695 RIMS2Q9UQ26 1411 aa37.2■■■■□ 3.55
HTATSF1-202ENST00000425695 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP37.19■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms