RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NEURL4Q96JN8 1562 aa27.08■■□□□ 1.93
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TNRQ92752 1358 aa27.08■■□□□ 1.93
RFX3-AS1-201ENST00000423112 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.01■■□□□ 1.91
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
RFX3-AS1-201ENST00000423112 VWDEQ8N2E2 1590 aa27.01■■□□□ 1.91
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27■■□□□ 1.91
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PZPP20742 1482 aa27■■□□□ 1.91
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.99■■□□□ 1.91
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MED14O60244 1454 aa26.98■■□□□ 1.91
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.96■■□□□ 1.91
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NLRP1Q9C000 1473 aa26.96■■□□□ 1.91
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.96■■□□□ 1.91
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ALKQ9UM73 1620 aa26.95■■□□□ 1.91
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KIF3BO15066 747 aa26.95■■□□□ 1.9
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DEPDC5O75140 1603 aa26.94■■□□□ 1.9
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MBD5Q9P267 1494 aa26.94■■□□□ 1.9
RFX3-AS1-201ENST00000423112 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.94■■□□□ 1.9
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MIA2Q96PC5 1412 aa26.94■■□□□ 1.9
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.93■■□□□ 1.9
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LRRC7Q96NW7 1537 aa26.86■■□□□ 1.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IQGAP1P46940 1657 aa26.85■■□□□ 1.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TIAM1Q13009 1591 aa26.85■■□□□ 1.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SYNMO15061 1565 aa26.84■■□□□ 1.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.83■■□□□ 1.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.81■■□□□ 1.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.8■■□□□ 1.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.79■■□□□ 1.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CEP162Q5TB80 1403 aa26.77■■□□□ 1.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 STRCP1A6NGW2 1772 aa26.76■■□□□ 1.87
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TSPY4P0CV99 314 aa26.7■■□□□ 1.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TSPY10P0CW01 314 aa26.7■■□□□ 1.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.69■■□□□ 1.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ERVK-7P63135 1459 aa26.67■■□□□ 1.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ABCC3O15438 1527 aa26.66■■□□□ 1.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM135BQ49AJ0 1406 aa26.65■■□□□ 1.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.63■■□□□ 1.85
RFX3-AS1-201ENST00000423112 POTEAQ6S8J7 498 aa26.61■■□□□ 1.85
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.61■■□□□ 1.85
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NCOA2Q15596 1464 aa26.61■■□□□ 1.85
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UBR1Q8IWV7 1749 aa26.59■■□□□ 1.85
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EID1Q9Y6B2 187 aa26.59■■□□□ 1.85
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.58■■□□□ 1.85
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LTKP29376 864 aa26.58■■□□□ 1.85
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLIT1O75093 1534 aa26.58■■□□□ 1.85
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
RFX3-AS1-201ENST00000423112 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.51■■□□□ 1.83
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM94Q12767 1356 aa26.49■■□□□ 1.83
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.49■■□□□ 1.83
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.48■■□□□ 1.83
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.47■■□□□ 1.83
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.46■■□□□ 1.83
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CEP152O94986 1710 aa26.45■■□□□ 1.83
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa26.45■■□□□ 1.82
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KCNA6P17658 529 aa26.45■■□□□ 1.82
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
RFX3-AS1-201ENST00000423112 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.43■■□□□ 1.82
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.41■■□□□ 1.82
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAP3K1Q13233 1512 aa26.39■■□□□ 1.81
RFX3-AS1-201ENST00000423112 JCADQ9P266 1359 aa26.38■■□□□ 1.81
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PIK3C2BO00750 1634 aa26.37■■□□□ 1.81
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MSH6P52701 1360 aa26.35■■□□□ 1.81
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.34■■□□□ 1.81
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC26A8Q96RN1 970 aa26.34■■□□□ 1.81
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLAIN2Q9P270 581 aa26.33■■□□□ 1.81
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.32■■□□□ 1.8
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TET3O43151 1660 aa26.32■■□□□ 1.8
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ERBINQ96RT1 1412 aa26.31■■□□□ 1.8
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KANK1Q14678 1352 aa26.31■■□□□ 1.8
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PHLPP1O60346 1717 aa26.3■■□□□ 1.8
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KIF15Q9NS87 1388 aa26.3■■□□□ 1.8
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IDI1Q13907 227 aa26.29■■□□□ 1.8
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NWD1Q149M9 1564 aa26.29■■□□□ 1.8
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP26.28■■□□□ 1.8
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.28■■□□□ 1.8
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa26.26■■□□□ 1.79
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BCANQ96GW7 911 aa26.24■■□□□ 1.79
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.23■■□□□ 1.79
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.23■■□□□ 1.79
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.21■■□□□ 1.79
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRIM52Q96A61 297 aa26.19■■□□□ 1.78
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.19■■□□□ 1.78
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