RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419770.1

C9orf116-204, Transcript of chromosome 9 open reading frame 116, humanhuman

TSL 5

Gene C9orf116, Length 273 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116-204ENST00000419770 MIA2Q96PC5 1412 aa29.78■■■□□ 2.36
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C9orf116-204ENST00000419770 LTBP4Q8N2S1 1624 aa29.74■■■□□ 2.35
C9orf116-204ENST00000419770 PKD2Q13563 968 aa29.73■■■□□ 2.35
C9orf116-204ENST00000419770 A2ML1A8K2U0 1454 aa29.73■■■□□ 2.35
C9orf116-204ENST00000419770 PZPP20742 1482 aa29.73■■■□□ 2.35
C9orf116-204ENST00000419770 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.72■■■□□ 2.35
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C9orf116-204ENST00000419770 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa29.71■■■□□ 2.35
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C9orf116-204ENST00000419770 TNRQ92752 1358 aa29.68■■■□□ 2.34
C9orf116-204ENST00000419770 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
C9orf116-204ENST00000419770 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
C9orf116-204ENST00000419770 APLP2Q06481 763 aa29.66■■■□□ 2.34
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C9orf116-204ENST00000419770 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
C9orf116-204ENST00000419770 ABCC3O15438 1527 aa29.58■■■□□ 2.33
C9orf116-204ENST00000419770 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.57■■■□□ 2.32
C9orf116-204ENST00000419770 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.57■■■□□ 2.32
C9orf116-204ENST00000419770 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.57■■■□□ 2.32
C9orf116-204ENST00000419770 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
C9orf116-204ENST00000419770 MROH1Q8NDA8 1641 aa29.55■■■□□ 2.32
C9orf116-204ENST00000419770 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
C9orf116-204ENST00000419770 ABCC5O15440 1437 aa29.52■■■□□ 2.32
C9orf116-204ENST00000419770 UGGT1Q9NYU2 1555 aa29.52■■■□□ 2.32
C9orf116-204ENST00000419770 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa29.51■■■□□ 2.31
C9orf116-204ENST00000419770 NEURL4Q96JN8 1562 aa29.51■■■□□ 2.31
C9orf116-204ENST00000419770 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.5■■■□□ 2.31
C9orf116-204ENST00000419770 KIF15Q9NS87 1388 aa29.5■■■□□ 2.31
C9orf116-204ENST00000419770 CEP152O94986 1710 aa29.48■■■□□ 2.31
C9orf116-204ENST00000419770 ERBINQ96RT1 1412 aa29.48■■■□□ 2.31
C9orf116-204ENST00000419770 ANKLE2Q86XL3 938 aa29.47■■■□□ 2.31
C9orf116-204ENST00000419770 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.47■■■□□ 2.31
C9orf116-204ENST00000419770 DAPK1P53355 1430 aa29.46■■■□□ 2.31
C9orf116-204ENST00000419770 ERVK-7P63135 1459 aa29.46■■■□□ 2.31
C9orf116-204ENST00000419770 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
C9orf116-204ENST00000419770 DEPDC5O75140 1603 aa29.45■■■□□ 2.31
C9orf116-204ENST00000419770 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.43■■■□□ 2.3
C9orf116-204ENST00000419770 MED14O60244 1454 aa29.41■■■□□ 2.3
C9orf116-204ENST00000419770 CPS1P31327 1500 aa29.4■■■□□ 2.3
C9orf116-204ENST00000419770 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa29.38■■■□□ 2.29
C9orf116-204ENST00000419770 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
C9orf116-204ENST00000419770 UBAP1LF5GYI3 381 aa29.38■■■□□ 2.29
C9orf116-204ENST00000419770 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.38■■■□□ 2.29
C9orf116-204ENST00000419770 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
C9orf116-204ENST00000419770 IQGAP1P46940 1657 aa29.35■■■□□ 2.29
C9orf116-204ENST00000419770 UBR1Q8IWV7 1749 aa29.34■■■□□ 2.29
C9orf116-204ENST00000419770 KANK1Q14678 1352 aa29.34■■■□□ 2.29
C9orf116-204ENST00000419770 VWDEQ8N2E2 1590 aa29.33■■■□□ 2.29
C9orf116-204ENST00000419770 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP29.31■■■□□ 2.28
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C9orf116-204ENST00000419770 DISP3Q9P2K9 1392 aa29.29■■■□□ 2.28
C9orf116-204ENST00000419770 LMTK2Q8IWU2 1503 aa29.27■■■□□ 2.28
C9orf116-204ENST00000419770 ADGRL2O95490 1459 aa29.27■■■□□ 2.28
C9orf116-204ENST00000419770 SLIT1O75093 1534 aa29.24■■■□□ 2.27
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C9orf116-204ENST00000419770 TOM1O60784 492 aa29.21■■■□□ 2.27
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C9orf116-204ENST00000419770 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
C9orf116-204ENST00000419770 EFCAB6Q5THR3 1501 aa29.17■■■□□ 2.26
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C9orf116-204ENST00000419770 EID1Q9Y6B2 187 aa29.16■■■□□ 2.26
C9orf116-204ENST00000419770 STRCP1A6NGW2 1772 aa29.16■■■□□ 2.26
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C9orf116-204ENST00000419770 LTKP29376 864 aa29.13■■■□□ 2.25
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C9orf116-204ENST00000419770 LRRC7Q96NW7 1537 aa29.11■■■□□ 2.25
C9orf116-204ENST00000419770 NOS1P29475 1434 aa29.11■■■□□ 2.25
C9orf116-204ENST00000419770 IDI1Q13907 227 aa29.09■■■□□ 2.25
C9orf116-204ENST00000419770 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
C9orf116-204ENST00000419770 ILDR2Q71H61 639 aa29.07■■■□□ 2.24
C9orf116-204ENST00000419770 ALKQ9UM73 1620 aa29.05■■■□□ 2.24
C9orf116-204ENST00000419770 ADGRB3O60242 1522 aa29.05■■■□□ 2.24
C9orf116-204ENST00000419770 HSPA1LP34931 641 aa29.05■■■□□ 2.24
C9orf116-204ENST00000419770 SLC52A1Q9NWF4 448 aa29.05■■■□□ 2.24
C9orf116-204ENST00000419770 TET3O43151 1660 aa29.05■■■□□ 2.24
C9orf116-204ENST00000419770 ROCK1Q13464 1354 aa29.02■■■□□ 2.24
C9orf116-204ENST00000419770 UNC13BO14795 1591 aa29.02■■■□□ 2.24
C9orf116-204ENST00000419770 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29■■■□□ 2.23
C9orf116-204ENST00000419770 SOCS7O14512 581 aa28.95■■■□□ 2.22
C9orf116-204ENST00000419770 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
C9orf116-204ENST00000419770 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.91■■■□□ 2.22
C9orf116-204ENST00000419770 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
C9orf116-204ENST00000419770 MYO5BQ9ULV0 1848 aa28.9■■■□□ 2.22
C9orf116-204ENST00000419770 E9PCH4 1651 aa28.89■■■□□ 2.22
C9orf116-204ENST00000419770 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa28.89■■■□□ 2.22
C9orf116-204ENST00000419770 KCNA6P17658 529 aa28.88■■■□□ 2.21
C9orf116-204ENST00000419770 SLC26A8Q96RN1 970 aa28.88■■■□□ 2.21
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