RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418548.3

SFTA3-201, Transcript of surfactant associated 3, humanhuman

TSL 3

Gene SFTA3, Length 870 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3-201ENST00000418548 A2MP01023 1474 aa21.4■■□□□ 1.02
SFTA3-201ENST00000418548 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa21.37■■□□□ 1.01
SFTA3-201ENST00000418548 REREQ9P2R6 1566 aa21.36■■□□□ 1.01
SFTA3-201ENST00000418548 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
SFTA3-201ENST00000418548 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.32■■□□□ 1
SFTA3-201ENST00000418548 KIF3BO15066 747 aa21.31■■□□□ 1
SFTA3-201ENST00000418548 AGLP35573 1532 aa21.3■■□□□ 1
SFTA3-201ENST00000418548 UNC13BO14795 1591 aa21.28■■□□□ 1
SFTA3-201ENST00000418548 TRIM52Q96A61 297 aa21.28■■□□□ 1
SFTA3-201ENST00000418548 DEPDC5O75140 1603 aa21.27■■□□□ 1
SFTA3-201ENST00000418548 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
SFTA3-201ENST00000418548 KDM5DQ9BY66 1539 aa21.26■□□□□ 0.99
SFTA3-201ENST00000418548 NUP155O75694 1391 aa21.25■□□□□ 0.99
SFTA3-201ENST00000418548 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa21.24■□□□□ 0.99
SFTA3-201ENST00000418548 MROH1Q8NDA8 1641 aa21.23■□□□□ 0.99
SFTA3-201ENST00000418548 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
SFTA3-201ENST00000418548 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.22■□□□□ 0.99
SFTA3-201ENST00000418548 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
SFTA3-201ENST00000418548 VWDEQ8N2E2 1590 aa21.22■□□□□ 0.99
SFTA3-201ENST00000418548 PZPP20742 1482 aa21.21■□□□□ 0.99
SFTA3-201ENST00000418548 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.21■□□□□ 0.99
SFTA3-201ENST00000418548 IQGAP3Q86VI3 1631 aa21.2■□□□□ 0.98
SFTA3-201ENST00000418548 GGT6Q6P531 493 aa21.2■□□□□ 0.98
SFTA3-201ENST00000418548 KANK1Q14678 1352 aa21.2■□□□□ 0.98
SFTA3-201ENST00000418548 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
SFTA3-201ENST00000418548 FAM135AQ9P2D6 1515 aa21.18■□□□□ 0.98
SFTA3-201ENST00000418548 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
SFTA3-201ENST00000418548 LMTK2Q8IWU2 1503 aa21.14■□□□□ 0.98
SFTA3-201ENST00000418548 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
SFTA3-201ENST00000418548 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.12■□□□□ 0.97
SFTA3-201ENST00000418548 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa21.12■□□□□ 0.97
SFTA3-201ENST00000418548 PKD2Q13563 968 aa21.12■□□□□ 0.97
SFTA3-201ENST00000418548 ABCC3O15438 1527 aa21.11■□□□□ 0.97
SFTA3-201ENST00000418548 TET3O43151 1660 aa21.11■□□□□ 0.97
SFTA3-201ENST00000418548 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
SFTA3-201ENST00000418548 MLECQ14165 292 aa21.09■□□□□ 0.97
SFTA3-201ENST00000418548 CEP152O94986 1710 aa21.09■□□□□ 0.97
SFTA3-201ENST00000418548 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa21.05■□□□□ 0.96
SFTA3-201ENST00000418548 EFCAB6Q5THR3 1501 aa21.05■□□□□ 0.96
SFTA3-201ENST00000418548 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa21.05■□□□□ 0.96
SFTA3-201ENST00000418548 E9PCH4 1651 aa21.05■□□□□ 0.96
SFTA3-201ENST00000418548 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
SFTA3-201ENST00000418548 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa21.03■□□□□ 0.96
SFTA3-201ENST00000418548 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.03■□□□□ 0.96
SFTA3-201ENST00000418548 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
SFTA3-201ENST00000418548 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
SFTA3-201ENST00000418548 NPATQ14207 1427 aa21.01■□□□□ 0.95
SFTA3-201ENST00000418548 POTEDQ86YR6 584 aa21■□□□□ 0.95
SFTA3-201ENST00000418548 PTPRTO14522 1441 aa21■□□□□ 0.95
SFTA3-201ENST00000418548 PLA2R1Q13018 1463 aa20.99■□□□□ 0.95
SFTA3-201ENST00000418548 ADAMTSL3P82987 1691 aa20.99■□□□□ 0.95
SFTA3-201ENST00000418548 ZMYM3Q14202 1370 aa20.98■□□□□ 0.95
SFTA3-201ENST00000418548 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
SFTA3-201ENST00000418548 MROH2AA6NES4 1674 aa20.97■□□□□ 0.95
SFTA3-201ENST00000418548 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa20.97■□□□□ 0.95
SFTA3-201ENST00000418548 NOS1P29475 1434 aa20.95■□□□□ 0.94
SFTA3-201ENST00000418548 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.94■□□□□ 0.94
SFTA3-201ENST00000418548 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa20.94■□□□□ 0.94
SFTA3-201ENST00000418548 TRPM2O94759 1503 aa20.92■□□□□ 0.94
SFTA3-201ENST00000418548 MADDQ8WXG6 1647 aa20.92■□□□□ 0.94
SFTA3-201ENST00000418548 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
SFTA3-201ENST00000418548 PREX1Q8TCU6 1659 aa20.89■□□□□ 0.94
SFTA3-201ENST00000418548 ERVK-7P63135 1459 aa20.88■□□□□ 0.93
SFTA3-201ENST00000418548 CCDC144AA2RUR9 1427 aa20.88■□□□□ 0.93
SFTA3-201ENST00000418548 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa20.88■□□□□ 0.93
SFTA3-201ENST00000418548 C3P01024 1663 aa20.87■□□□□ 0.93
SFTA3-201ENST00000418548 NEUROD1Q13562 356 aa20.87■□□□□ 0.93
SFTA3-201ENST00000418548 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
SFTA3-201ENST00000418548 SLC52A1Q9NWF4 448 aa20.86■□□□□ 0.93
SFTA3-201ENST00000418548 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa20.86■□□□□ 0.93
SFTA3-201ENST00000418548 SYNMO15061 1565 aa20.85■□□□□ 0.93
SFTA3-201ENST00000418548 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
SFTA3-201ENST00000418548 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
SFTA3-201ENST00000418548 PIK3C2BO00750 1634 aa20.83■□□□□ 0.93
SFTA3-201ENST00000418548 CLTCL1P53675 1640 aa20.83■□□□□ 0.93
SFTA3-201ENST00000418548 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
SFTA3-201ENST00000418548 IDI1Q13907 227 aa20.81■□□□□ 0.92
SFTA3-201ENST00000418548 UGGT1Q9NYU2 1555 aa20.8■□□□□ 0.92
SFTA3-201ENST00000418548 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
SFTA3-201ENST00000418548 TNRQ92752 1358 aa20.8■□□□□ 0.92
SFTA3-201ENST00000418548 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
SFTA3-201ENST00000418548 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa20.79■□□□□ 0.92
SFTA3-201ENST00000418548 PTPRMP28827 1452 aa20.79■□□□□ 0.92
SFTA3-201ENST00000418548 NEURL4Q96JN8 1562 aa20.79■□□□□ 0.92
SFTA3-201ENST00000418548 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa20.78■□□□□ 0.92
SFTA3-201ENST00000418548 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa20.78■□□□□ 0.92
SFTA3-201ENST00000418548 KIF1BO60333 1816 aa20.78■□□□□ 0.92
SFTA3-201ENST00000418548 TONSLQ96HA7 1378 aa20.76■□□□□ 0.91
SFTA3-201ENST00000418548 L3MBTL2Q969R5 705 aa20.75■□□□□ 0.91
SFTA3-201ENST00000418548 NLRP1Q9C000 1473 aa20.74■□□□□ 0.91
SFTA3-201ENST00000418548 ADGRB3O60242 1522 aa20.72■□□□□ 0.91
SFTA3-201ENST00000418548 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa20.71■□□□□ 0.91
SFTA3-201ENST00000418548 RGL3Q3MIN7 710 aa20.71■□□□□ 0.91
SFTA3-201ENST00000418548 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
SFTA3-201ENST00000418548 CHGAP10645 457 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
SFTA3-201ENST00000418548 STAC3Q96MF2 364 aa20.69■□□□□ 0.9
SFTA3-201ENST00000418548 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
SFTA3-201ENST00000418548 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa20.69■□□□□ 0.9
SFTA3-201ENST00000418548 A2ML1A8K2U0 1454 aa20.67■□□□□ 0.9
SFTA3-201ENST00000418548 MYO5BQ9ULV0 1848 aa20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms