RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416453.6

GTF3C2-AS1-201, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GTF3C2-AS1, Length 863 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
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GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ERVK-7P63135 1459 aa15.58■□□□□ 0.08
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GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NLRP1Q9C000 1473 aa15.52■□□□□ 0.07
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 HFM1A2PYH4 1435 aa15.51■□□□□ 0.07
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GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 UBR1Q8IWV7 1749 aa15.48■□□□□ 0.07
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GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NEURL4Q96JN8 1562 aa15.44■□□□□ 0.06
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa15.43■□□□□ 0.06
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ADGRB3O60242 1522 aa15.43■□□□□ 0.06
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MYO5BQ9ULV0 1848 aa15.41■□□□□ 0.06
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa15.41■□□□□ 0.06
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PTPRTO14522 1441 aa15.39■□□□□ 0.05
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 IQGAP1P46940 1657 aa15.38■□□□□ 0.05
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SLIT1O75093 1534 aa15.37■□□□□ 0.05
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa15.36■□□□□ 0.05
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ARHGAP23Q9P227 1491 aa15.36■□□□□ 0.05
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TRIM52Q96A61 297 aa15.36■□□□□ 0.05
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SETD5Q9C0A6 1442 aa15.35■□□□□ 0.05
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 IDI1Q13907 227 aa15.35■□□□□ 0.05
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CLTCL1P53675 1640 aa15.35■□□□□ 0.05
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TRPM2O94759 1503 aa15.34■□□□□ 0.05
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PKD2Q13563 968 aa15.34■□□□□ 0.05
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 STAG3Q9UJ98 1225 aa15.33■□□□□ 0.04
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa15.33■□□□□ 0.04
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SLC52A1Q9NWF4 448 aa15.32■□□□□ 0.04
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