RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, human

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP4-204	ENST00000416021	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		32.27	■■■□□ 2.76
SH3BP4-204	ENST00000416021	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	32.27	■■■□□ 2.76
SH3BP4-204	ENST00000416021	ITGAE	P38570	1179 aa		32.27	■■■□□ 2.76
SH3BP4-204	ENST00000416021	NPAT	Q14207	1427 aa		32.26	■■■□□ 2.75
SH3BP4-204	ENST00000416021	PTPRK	Q15262	1439 aa		32.26	■■■□□ 2.75
SH3BP4-204	ENST00000416021	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		32.26	■■■□□ 2.75
SH3BP4-204	ENST00000416021	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	32.25	■■■□□ 2.75
SH3BP4-204	ENST00000416021	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		32.25	■■■□□ 2.75
SH3BP4-204	ENST00000416021	MROH2A	A6NES4	1674 aa		32.24	■■■□□ 2.75
SH3BP4-204	ENST00000416021	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	32.23	■■■□□ 2.75
SH3BP4-204	ENST00000416021	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	32.23	■■■□□ 2.75
SH3BP4-204	ENST00000416021	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	32.23	■■■□□ 2.75
SH3BP4-204	ENST00000416021	ADGRL2	O95490	1459 aa		32.22	■■■□□ 2.75
SH3BP4-204	ENST00000416021	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		32.21	■■■□□ 2.75
SH3BP4-204	ENST00000416021	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	32.18	■■■□□ 2.74
SH3BP4-204	ENST00000416021	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		32.18	■■■□□ 2.74
SH3BP4-204	ENST00000416021	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	32.16	■■■□□ 2.74
SH3BP4-204	ENST00000416021	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		32.15	■■■□□ 2.74
SH3BP4-204	ENST00000416021	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	32.14	■■■□□ 2.74
SH3BP4-204	ENST00000416021	ROCK1	Q13464	1354 aa		32.13	■■■□□ 2.73
SH3BP4-204	ENST00000416021	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		32.12	■■■□□ 2.73
SH3BP4-204	ENST00000416021	PZP	P20742	1482 aa		32.11	■■■□□ 2.73
SH3BP4-204	ENST00000416021	ABCC3	O15438	1527 aa		32.1	■■■□□ 2.73
SH3BP4-204	ENST00000416021	KANK1	Q14678	1352 aa		32.1	■■■□□ 2.73
SH3BP4-204	ENST00000416021	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		32.09	■■■□□ 2.73
SH3BP4-204	ENST00000416021	TNR	Q92752	1358 aa		32.08	■■■□□ 2.73
SH3BP4-204	ENST00000416021	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	32.01	■■■□□ 2.72
SH3BP4-204	ENST00000416021	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		32.01	■■■□□ 2.71
SH3BP4-204	ENST00000416021	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	31.98	■■■□□ 2.71
SH3BP4-204	ENST00000416021	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		31.97	■■■□□ 2.71
SH3BP4-204	ENST00000416021	DEPDC5	O75140	1603 aa		31.97	■■■□□ 2.71
SH3BP4-204	ENST00000416021	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		31.95	■■■□□ 2.7
SH3BP4-204	ENST00000416021	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		31.93	■■■□□ 2.7
SH3BP4-204	ENST00000416021	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		31.93	■■■□□ 2.7
SH3BP4-204	ENST00000416021	ERVK-7	P63135	1459 aa		31.92	■■■□□ 2.7
SH3BP4-204	ENST00000416021	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	31.92	■■■□□ 2.7
SH3BP4-204	ENST00000416021	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	31.92	■■■□□ 2.7
SH3BP4-204	ENST00000416021	CEP152	O94986	1710 aa		31.92	■■■□□ 2.7
SH3BP4-204	ENST00000416021	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		31.91	■■■□□ 2.7
SH3BP4-204	ENST00000416021	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		31.91	■■■□□ 2.7
SH3BP4-204	ENST00000416021	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		31.9	■■■□□ 2.7
SH3BP4-204	ENST00000416021	NLRP1	Q9C000	1473 aa		31.9	■■■□□ 2.7
SH3BP4-204	ENST00000416021	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		31.89	■■■□□ 2.7
SH3BP4-204	ENST00000416021	PKD2	Q13563	968 aa		31.88	■■■□□ 2.69
SH3BP4-204	ENST00000416021	STRC	Q7RTU9	1775 aa		31.86	■■■□□ 2.69
SH3BP4-204	ENST00000416021	NUP155	O75694	1391 aa		31.85	■■■□□ 2.69
SH3BP4-204	ENST00000416021	PTPRT	O14522	1441 aa		31.83	■■■□□ 2.69
SH3BP4-204	ENST00000416021	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	31.83	■■■□□ 2.69
SH3BP4-204	ENST00000416021	PLA2R1	Q13018	1463 aa		31.82	■■■□□ 2.68
SH3BP4-204	ENST00000416021	NAIP	Q13075	1403 aa		31.81	■■■□□ 2.68
SH3BP4-204	ENST00000416021	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		31.8	■■■□□ 2.68
SH3BP4-204	ENST00000416021	IDI1	Q13907	227 aa		31.79	■■■□□ 2.68
SH3BP4-204	ENST00000416021	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		31.79	■■■□□ 2.68
SH3BP4-204	ENST00000416021	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	31.79	■■■□□ 2.68
SH3BP4-204	ENST00000416021	UNC13B	O14795	1591 aa		31.76	■■■□□ 2.67
SH3BP4-204	ENST00000416021	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		31.75	■■■□□ 2.67
SH3BP4-204	ENST00000416021	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		31.75	■■■□□ 2.67
SH3BP4-204	ENST00000416021	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		31.75	■■■□□ 2.67
SH3BP4-204	ENST00000416021	NOS1	P29475	1434 aa		31.75	■■■□□ 2.67
SH3BP4-204	ENST00000416021	HFM1	A2PYH4	1435 aa		31.74	■■■□□ 2.67
SH3BP4-204	ENST00000416021	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	31.72	■■■□□ 2.67
SH3BP4-204	ENST00000416021	TRIM52	Q96A61	297 aa		31.7	■■■□□ 2.67
SH3BP4-204	ENST00000416021	CERK	Q8TCT0	537 aa		31.67	■■■□□ 2.66
SH3BP4-204	ENST00000416021	TET3	O43151	1660 aa		31.67	■■■□□ 2.66
SH3BP4-204	ENST00000416021	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		31.64	■■■□□ 2.66
SH3BP4-204	ENST00000416021	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		31.64	■■■□□ 2.66
SH3BP4-204	ENST00000416021	SYNM	O15061	1565 aa		31.62	■■■□□ 2.65
SH3BP4-204	ENST00000416021	LTK	P29376	864 aa		31.62	■■■□□ 2.65
SH3BP4-204	ENST00000416021	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	31.62	■■■□□ 2.65
SH3BP4-204	ENST00000416021	EID1	Q9Y6B2	187 aa		31.61	■■■□□ 2.65
SH3BP4-204	ENST00000416021	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		31.58	■■■□□ 2.65
SH3BP4-204	ENST00000416021	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	31.58	■■■□□ 2.65
SH3BP4-204	ENST00000416021	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		31.57	■■■□□ 2.65
SH3BP4-204	ENST00000416021	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		31.57	■■■□□ 2.64
SH3BP4-204	ENST00000416021	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	31.57	■■■□□ 2.64
SH3BP4-204	ENST00000416021	PIK3C2B	O00750	1634 aa		31.57	■■■□□ 2.64
SH3BP4-204	ENST00000416021	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	31.56	■■■□□ 2.64
SH3BP4-204	ENST00000416021	MED14	O60244	1454 aa		31.56	■■■□□ 2.64
SH3BP4-204	ENST00000416021		E9PCH4	1651 aa		31.55	■■■□□ 2.64
SH3BP4-204	ENST00000416021	FBXO41	Q8TF61	875 aa		31.55	■■■□□ 2.64
SH3BP4-204	ENST00000416021	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	31.55	■■■□□ 2.64
SH3BP4-204	ENST00000416021	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		31.54	■■■□□ 2.64
SH3BP4-204	ENST00000416021	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		31.53	■■■□□ 2.64
SH3BP4-204	ENST00000416021	SLIT1	O75093	1534 aa		31.53	■■■□□ 2.64
SH3BP4-204	ENST00000416021	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	31.51	■■■□□ 2.63
SH3BP4-204	ENST00000416021	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	31.48	■■■□□ 2.63
SH3BP4-204	ENST00000416021	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		31.48	■■■□□ 2.63
SH3BP4-204	ENST00000416021	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		31.47	■■■□□ 2.63
SH3BP4-204	ENST00000416021	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	31.46	■■■□□ 2.63
SH3BP4-204	ENST00000416021	ADGRB3	O60242	1522 aa		31.45	■■■□□ 2.63
SH3BP4-204	ENST00000416021	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	31.44	■■■□□ 2.62
SH3BP4-204	ENST00000416021	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		31.43	■■■□□ 2.62
SH3BP4-204	ENST00000416021	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	31.43	■■■□□ 2.62
SH3BP4-204	ENST00000416021	FOXD1	Q16676	465 aa		31.4	■■■□□ 2.62
SH3BP4-204	ENST00000416021	BCAN	Q96GW7	911 aa		31.4	■■■□□ 2.62
SH3BP4-204	ENST00000416021	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	31.39	■■■□□ 2.62
SH3BP4-204	ENST00000416021	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	31.38	■■■□□ 2.61
SH3BP4-204	ENST00000416021	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		31.38	■■■□□ 2.61
SH3BP4-204	ENST00000416021	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	31.37	■■■□□ 2.61
SH3BP4-204	ENST00000416021	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		31.37	■■■□□ 2.61

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.4 ms