RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407117.6

ANKRD54-203, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD54, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-203ENST00000407117 PTPRTO14522 1441 aa43.33■■■■■ 4.53
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ANKRD54-203ENST00000407117 FGD6Q6ZV73 1430 aa43.32■■■■■ 4.53
ANKRD54-203ENST00000407117 SHANK2Q9UPX8 1470 aa43.31■■■■■ 4.52
ANKRD54-203ENST00000407117 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP43.3■■■■■ 4.52
ANKRD54-203ENST00000407117 PZPP20742 1482 aa43.28■■■■■ 4.52
ANKRD54-203ENST00000407117 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP43.28■■■■■ 4.52
ANKRD54-203ENST00000407117 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP43.28■■■■■ 4.52
ANKRD54-203ENST00000407117 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP43.28■■■■■ 4.52
ANKRD54-203ENST00000407117 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa43.27■■■■■ 4.52
ANKRD54-203ENST00000407117 ABCC5O15440 1437 aa43.27■■■■■ 4.52
ANKRD54-203ENST00000407117 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP43.27■■■■■ 4.52
ANKRD54-203ENST00000407117 DUOX2Q9NRD8 1548 aa43.25■■■■■ 4.51
ANKRD54-203ENST00000407117 CERKQ8TCT0 537 aa43.24■■■■■ 4.51
ANKRD54-203ENST00000407117 CROCC2H7BZ55 1655 aa43.22■■■■■ 4.51
ANKRD54-203ENST00000407117 DAPK1P53355 1430 aa43.21■■■■■ 4.51
ANKRD54-203ENST00000407117 PLA2R1Q13018 1463 aa43.2■■■■■ 4.51
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ANKRD54-203ENST00000407117 A2ML1A8K2U0 1454 aa43.19■■■■■ 4.5
ANKRD54-203ENST00000407117 TNRQ92752 1358 aa43.18■■■■■ 4.5
ANKRD54-203ENST00000407117 KIF15Q9NS87 1388 aa43.18■■■■■ 4.5
ANKRD54-203ENST00000407117 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP43.17■■■■■ 4.5
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ANKRD54-203ENST00000407117 ERBINQ96RT1 1412 aa43.13■■■■■ 4.49
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ANKRD54-203ENST00000407117 MROH1Q8NDA8 1641 aa43.1■■■■■ 4.49
ANKRD54-203ENST00000407117 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa43.09■■■■■ 4.49
ANKRD54-203ENST00000407117 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa43.07■■■■■ 4.49
ANKRD54-203ENST00000407117 NLRP1Q9C000 1473 aa43.05■■■■■ 4.48
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ANKRD54-203ENST00000407117 DEPDC5O75140 1603 aa42.91■■■■■ 4.46
ANKRD54-203ENST00000407117 UGGT1Q9NYU2 1555 aa42.9■■■■■ 4.46
ANKRD54-203ENST00000407117 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa42.89■■■■■ 4.46
ANKRD54-203ENST00000407117 KANK1Q14678 1352 aa42.88■■■■■ 4.45
ANKRD54-203ENST00000407117 IQSEC2Q5JU85 1478 aa42.84■■■■■ 4.45
ANKRD54-203ENST00000407117 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP42.84■■■■■ 4.45
ANKRD54-203ENST00000407117 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP42.83■■■■■ 4.45
ANKRD54-203ENST00000407117 ANKLE2Q86XL3 938 aa42.82■■■■■ 4.45
ANKRD54-203ENST00000407117 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP42.81■■■■■ 4.44
ANKRD54-203ENST00000407117 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP42.8■■■■■ 4.44
ANKRD54-203ENST00000407117 NEURL4Q96JN8 1562 aa42.78■■■■■ 4.44
ANKRD54-203ENST00000407117 LMTK2Q8IWU2 1503 aa42.76■■■■■ 4.44
ANKRD54-203ENST00000407117 VWDEQ8N2E2 1590 aa42.76■■■■■ 4.44
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ANKRD54-203ENST00000407117 UBR1Q8IWV7 1749 aa42.63■■■■■ 4.41
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ANKRD54-203ENST00000407117 IQGAP1P46940 1657 aa42.54■■■■■ 4.4
ANKRD54-203ENST00000407117 SLIT1O75093 1534 aa42.53■■■■■ 4.4
ANKRD54-203ENST00000407117 ARHGAP23Q9P227 1491 aa42.53■■■■■ 4.4
ANKRD54-203ENST00000407117 NOS1P29475 1434 aa42.52■■■■■ 4.4
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ANKRD54-203ENST00000407117 SYNMO15061 1565 aa42.46■■■■■ 4.39
ANKRD54-203ENST00000407117 TXNDC2Q86VQ3 553 aa42.43■■■■■ 4.38
ANKRD54-203ENST00000407117 SLC52A1Q9NWF4 448 aa42.43■■■■■ 4.38
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ANKRD54-203ENST00000407117 TET3O43151 1660 aa42.43■■■■■ 4.38
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ANKRD54-203ENST00000407117 NUP155O75694 1391 aa42.26■■■■■ 4.35
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ANKRD54-203ENST00000407117 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa42.1■■■■■ 4.33
ANKRD54-203ENST00000407117 HDGFP51858 240 aaKnown RBP42.1■■■■■ 4.33
ANKRD54-203ENST00000407117 ZFYVE9O95405 1425 aa42.1■■■■■ 4.33
ANKRD54-203ENST00000407117 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP42.07■■■■■ 4.33
ANKRD54-203ENST00000407117 PIP4K2BP78356 416 aa42.07■■■■■ 4.33
ANKRD54-203ENST00000407117 NAIPQ13075 1403 aa42.06■■■■■ 4.32
ANKRD54-203ENST00000407117 RIMS2Q9UQ26 1411 aa42.05■■■■■ 4.32
ANKRD54-203ENST00000407117 SLC26A8Q96RN1 970 aa42.03■■■■■ 4.32
ANKRD54-203ENST00000407117 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa42.02■■■■■ 4.32
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