RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 NEUROD1Q13562 356 aa29.45■■■□□ 2.31
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ODC1-202ENST00000405333 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.42■■■□□ 2.3
ODC1-202ENST00000405333 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.42■■■□□ 2.3
ODC1-202ENST00000405333 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.41■■■□□ 2.3
ODC1-202ENST00000405333 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa29.4■■■□□ 2.3
ODC1-202ENST00000405333 PKD2Q13563 968 aa29.4■■■□□ 2.3
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ODC1-202ENST00000405333 LMTK2Q8IWU2 1503 aa29.07■■■□□ 2.24
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ODC1-202ENST00000405333 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.01■■■□□ 2.24
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ODC1-202ENST00000405333 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
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ODC1-202ENST00000405333 PRAG1Q86YV5 1406 aa28.66■■■□□ 2.18
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ODC1-202ENST00000405333 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28.64■■■□□ 2.17
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ODC1-202ENST00000405333 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa28.53■■■□□ 2.16
ODC1-202ENST00000405333 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP28.51■■■□□ 2.16
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ODC1-202ENST00000405333 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
ODC1-202ENST00000405333 MYOM2P54296 1465 aa28.5■■■□□ 2.15
ODC1-202ENST00000405333 CARD11Q9BXL7 1154 aa28.49■■■□□ 2.15
ODC1-202ENST00000405333 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
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