RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395833.7

LMO2-202, Transcript of LIM domain only 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO2, Length 1,687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2-202ENST00000395833 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP42.5■■■■■ 4.39
LMO2-202ENST00000395833 IQGAP3Q86VI3 1631 aa42.49■■■■■ 4.39
LMO2-202ENST00000395833 RICTORQ6R327 1708 aa42.48■■■■■ 4.39
LMO2-202ENST00000395833 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP42.44■■■■■ 4.38
LMO2-202ENST00000395833 A2MP01023 1474 aa42.42■■■■■ 4.38
LMO2-202ENST00000395833 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP42.41■■■■■ 4.38
LMO2-202ENST00000395833 DEPDC5O75140 1603 aa42.39■■■■■ 4.38
LMO2-202ENST00000395833 ABCA6Q8N139 1617 aa42.39■■■■■ 4.38
LMO2-202ENST00000395833 KIF3BO15066 747 aa42.38■■■■■ 4.38
LMO2-202ENST00000395833 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP42.38■■■■■ 4.38
LMO2-202ENST00000395833 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa42.36■■■■■ 4.37
LMO2-202ENST00000395833 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP42.36■■■■■ 4.37
LMO2-202ENST00000395833 KANK1Q14678 1352 aa42.31■■■■■ 4.36
LMO2-202ENST00000395833 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa42.29■■■■■ 4.36
LMO2-202ENST00000395833 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa42.27■■■■■ 4.36
LMO2-202ENST00000395833 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP42.25■■■■■ 4.35
LMO2-202ENST00000395833 MROH1Q8NDA8 1641 aa42.23■■■■■ 4.35
LMO2-202ENST00000395833 YEATS2Q9ULM3 1422 aa42.22■■■■■ 4.35
LMO2-202ENST00000395833 VWDEQ8N2E2 1590 aa42.22■■■■■ 4.35
LMO2-202ENST00000395833 L3MBTL2Q969R5 705 aa42.22■■■■■ 4.35
LMO2-202ENST00000395833 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP42.2■■■■■ 4.35
LMO2-202ENST00000395833 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.18■■■■■ 4.34
LMO2-202ENST00000395833 TET3O43151 1660 aa42.16■■■■■ 4.34
LMO2-202ENST00000395833 BCORL1Q5H9F3 1711 aa42.15■■■■■ 4.34
LMO2-202ENST00000395833 E9PCH4 1651 aa42.12■■■■■ 4.33
LMO2-202ENST00000395833 CCDC144AA2RUR9 1427 aa42.12■■■■■ 4.33
LMO2-202ENST00000395833 PLA2R1Q13018 1463 aa42.11■■■■■ 4.33
LMO2-202ENST00000395833 ATP10AO60312 1499 aa42.06■■■■■ 4.32
LMO2-202ENST00000395833 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP42.06■■■■■ 4.32
LMO2-202ENST00000395833 GGT6Q6P531 493 aa42.06■■■■■ 4.32
LMO2-202ENST00000395833 CEP152O94986 1710 aa42.02■■■■■ 4.32
LMO2-202ENST00000395833 LMTK2Q8IWU2 1503 aa42.02■■■■■ 4.32
LMO2-202ENST00000395833 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42■■■■■ 4.31
LMO2-202ENST00000395833 EFCAB6Q5THR3 1501 aa41.98■■■■■ 4.31
LMO2-202ENST00000395833 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa41.97■■■■■ 4.31
LMO2-202ENST00000395833 TRPM2O94759 1503 aa41.95■■■■■ 4.31
LMO2-202ENST00000395833 PTPRTO14522 1441 aa41.93■■■■■ 4.3
LMO2-202ENST00000395833 REREQ9P2R6 1566 aa41.92■■■■■ 4.3
LMO2-202ENST00000395833 ABCC3O15438 1527 aa41.91■■■■■ 4.3
LMO2-202ENST00000395833 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa41.91■■■■■ 4.3
LMO2-202ENST00000395833 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa41.9■■■■■ 4.3
LMO2-202ENST00000395833 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP41.9■■■■■ 4.3
LMO2-202ENST00000395833 NBPF8Q3BBV2 869 aa41.89■■■■■ 4.3
LMO2-202ENST00000395833 AGLP35573 1532 aa41.82■■■■■ 4.29
LMO2-202ENST00000395833 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa41.81■■■■■ 4.28
LMO2-202ENST00000395833 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP41.81■■■■■ 4.28
LMO2-202ENST00000395833 CLTCL1P53675 1640 aa41.81■■■■■ 4.28
LMO2-202ENST00000395833 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP41.8■■■■■ 4.28
LMO2-202ENST00000395833 RGL3Q3MIN7 710 aa41.8■■■■■ 4.28
LMO2-202ENST00000395833 DCAF11Q8TEB1 546 aa41.8■■■■■ 4.28
LMO2-202ENST00000395833 NPATQ14207 1427 aa41.78■■■■■ 4.28
LMO2-202ENST00000395833 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa41.77■■■■■ 4.28
LMO2-202ENST00000395833 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa41.76■■■■■ 4.28
LMO2-202ENST00000395833 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa41.72■■■■■ 4.27
LMO2-202ENST00000395833 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP41.71■■■■■ 4.27
LMO2-202ENST00000395833 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa41.7■■■■■ 4.27
LMO2-202ENST00000395833 UGGT1Q9NYU2 1555 aa41.67■■■■■ 4.26
LMO2-202ENST00000395833 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa41.65■■■■■ 4.26
LMO2-202ENST00000395833 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP41.64■■■■■ 4.26
LMO2-202ENST00000395833 CNTLNQ9NXG0 1405 aa41.64■■■■■ 4.26
LMO2-202ENST00000395833 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP41.63■■■■■ 4.25
LMO2-202ENST00000395833 RALGAPBQ86X10 1494 aa41.62■■■■■ 4.25
LMO2-202ENST00000395833 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP41.62■■■■■ 4.25
LMO2-202ENST00000395833 PPP6R1Q9UPN7 881 aa41.61■■■■■ 4.25
LMO2-202ENST00000395833 PRAG1Q86YV5 1406 aa41.59■■■■■ 4.25
LMO2-202ENST00000395833 MLECQ14165 292 aa41.59■■■■■ 4.25
LMO2-202ENST00000395833 KIF1BO60333 1816 aa41.58■■■■■ 4.25
LMO2-202ENST00000395833 NOS1P29475 1434 aa41.57■■■■■ 4.24
LMO2-202ENST00000395833 NEURL4Q96JN8 1562 aa41.56■■■■■ 4.24
LMO2-202ENST00000395833 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP41.52■■■■■ 4.24
LMO2-202ENST00000395833 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP41.51■■■■■ 4.24
LMO2-202ENST00000395833 SYNMO15061 1565 aa41.49■■■■■ 4.23
LMO2-202ENST00000395833 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa41.48■■■■■ 4.23
LMO2-202ENST00000395833 MROH2AA6NES4 1674 aa41.46■■■■■ 4.23
LMO2-202ENST00000395833 CHGAP10645 457 aaKnown RBP41.46■■■■■ 4.23
LMO2-202ENST00000395833 PREX1Q8TCU6 1659 aa41.46■■■■■ 4.23
LMO2-202ENST00000395833 ADGRB3O60242 1522 aa41.45■■■■■ 4.23
LMO2-202ENST00000395833 CARD11Q9BXL7 1154 aa41.45■■■■■ 4.23
LMO2-202ENST00000395833 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP41.45■■■■■ 4.23
LMO2-202ENST00000395833 STAC3Q96MF2 364 aa41.44■■■■■ 4.22
LMO2-202ENST00000395833 USP47Q96K76 1375 aa41.43■■■■■ 4.22
LMO2-202ENST00000395833 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP41.42■■■■■ 4.22
LMO2-202ENST00000395833 PIK3C2BO00750 1634 aa41.41■■■■■ 4.22
LMO2-202ENST00000395833 MADDQ8WXG6 1647 aa41.4■■■■■ 4.22
LMO2-202ENST00000395833 ERVK-7P63135 1459 aa41.37■■■■■ 4.21
LMO2-202ENST00000395833 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP41.34■■■■■ 4.21
LMO2-202ENST00000395833 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP41.33■■■■■ 4.21
LMO2-202ENST00000395833 SLC52A1Q9NWF4 448 aa41.33■■■■■ 4.21
LMO2-202ENST00000395833 MYOM2P54296 1465 aa41.32■■■■■ 4.21
LMO2-202ENST00000395833 IFT172Q9UG01 1749 aa41.32■■■■■ 4.21
LMO2-202ENST00000395833 GPRASP1Q5JY77 1395 aa41.31■■■■■ 4.2
LMO2-202ENST00000395833 NBPF1Q3BBV0 1214 aa41.3■■■■■ 4.2
LMO2-202ENST00000395833 IDI1Q13907 227 aa41.29■■■■■ 4.2
LMO2-202ENST00000395833 LAMC1P11047 1609 aa41.27■■■■■ 4.2
LMO2-202ENST00000395833 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa41.24■■■■■ 4.19
LMO2-202ENST00000395833 ZMYM3Q14202 1370 aa41.23■■■■■ 4.19
LMO2-202ENST00000395833 MIER1Q8N108 512 aa41.23■■■■■ 4.19
LMO2-202ENST00000395833 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa41.23■■■■■ 4.19
LMO2-202ENST00000395833 WASHC2AQ641Q2 1341 aa41.22■■■■■ 4.19
LMO2-202ENST00000395833 PPLO60437 1756 aa41.21■■■■■ 4.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms