RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391166.1

RNU6-754P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 754, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-754P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-754P-201ENST00000391166 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa6.88□□□□□ -1.31
RNU6-754P-201ENST00000391166 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
RNU6-754P-201ENST00000391166 TYW1BQ6NUM6 668 aa6.88□□□□□ -1.31
RNU6-754P-201ENST00000391166 PHOX2BQ99453 314 aa6.88□□□□□ -1.31
RNU6-754P-201ENST00000391166 POTEB2H3BUK9 544 aa6.87□□□□□ -1.31
RNU6-754P-201ENST00000391166 MS4A1P11836 297 aa6.87□□□□□ -1.31
RNU6-754P-201ENST00000391166 ARSIQ5FYB1 569 aa6.87□□□□□ -1.31
RNU6-754P-201ENST00000391166 NUDT7P0C024 238 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-754P-201ENST00000391166 NLRP7Q8WX94 980 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-754P-201ENST00000391166 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
RNU6-754P-201ENST00000391166 FOSBP53539 338 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-754P-201ENST00000391166 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RNU6-754P-201ENST00000391166 DDRGK1Q96HY6 314 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-754P-201ENST00000391166 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
RNU6-754P-201ENST00000391166 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
RNU6-754P-201ENST00000391166 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-754P-201ENST00000391166 ZNF454Q8N9F8 522 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-754P-201ENST00000391166 JPH4Q96JJ6 628 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-754P-201ENST00000391166 TMUB1Q9BVT8 246 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-754P-201ENST00000391166 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
RNU6-754P-201ENST00000391166 PADI6Q6TGC4 694 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-754P-201ENST00000391166 FBXW7Q969H0 707 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-754P-201ENST00000391166 ZDHHC16Q969W1 377 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-754P-201ENST00000391166 ADAM33Q9BZ11 813 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-754P-201ENST00000391166 GPR153Q6NV75 609 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-754P-201ENST00000391166 ZMYND15Q9H091 742 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU6-754P-201ENST00000391166 CLCN1P35523 988 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU6-754P-201ENST00000391166 DOK7Q18PE1 504 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU6-754P-201ENST00000391166 GPCPD1Q9NPB8 672 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU6-754P-201ENST00000391166 LHX6Q9UPM6 363 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU6-754P-201ENST00000391166 ADGRG1Q9Y653 693 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU6-754P-201ENST00000391166 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
RNU6-754P-201ENST00000391166 OATP04181 439 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-754P-201ENST00000391166 COL9A1P20849 921 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-754P-201ENST00000391166 ZNF710Q8N1W2 664 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-754P-201ENST00000391166 TTC13Q8NBP0 860 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-754P-201ENST00000391166 PXYLP1Q8TE99 480 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-754P-201ENST00000391166 BEGAINQ9BUH8 593 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-754P-201ENST00000391166 FAM198AQ9UFP1 575 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-754P-201ENST00000391166 PRSS12P56730 875 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-754P-201ENST00000391166 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
RNU6-754P-201ENST00000391166 CERKQ8TCT0 537 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-754P-201ENST00000391166 CDCA7LQ96GN5 454 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-754P-201ENST00000391166 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
RNU6-754P-201ENST00000391166 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
RNU6-754P-201ENST00000391166 POLR3EQ9NVU0 708 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-754P-201ENST00000391166 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
RNU6-754P-201ENST00000391166 RIMBP2O15034 1052 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-754P-201ENST00000391166 GOPCQ9HD26 462 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-754P-201ENST00000391166 C3orf80F5H4A9 247 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-754P-201ENST00000391166 ARXQ96QS3 562 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-754P-201ENST00000391166 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RNU6-754P-201ENST00000391166 SH3D19Q5HYK7 790 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-754P-201ENST00000391166 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-754P-201ENST00000391166 SCUBE2Q9NQ36 999 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-754P-201ENST00000391166 TSKSQ9UJT2 592 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-754P-201ENST00000391166 RCCD1A6NED2 376 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-754P-201ENST00000391166 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-754P-201ENST00000391166 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RNU6-754P-201ENST00000391166 EYA1Q99502 592 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-754P-201ENST00000391166 RSPH6AQ9H0K4 717 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-754P-201ENST00000391166 MAMSTRQ6ZN01 415 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-754P-201ENST00000391166 NUDT18Q6ZVK8 323 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-754P-201ENST00000391166 BCL2L12Q9HB09 334 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-754P-201ENST00000391166 SMAPO00193 183 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-754P-201ENST00000391166 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RNU6-754P-201ENST00000391166 MYSM1Q5VVJ2 828 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-754P-201ENST00000391166 TBC1D2Q9BYX2 928 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-754P-201ENST00000391166 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RNU6-754P-201ENST00000391166 ARID3CA6NKF2 412 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-754P-201ENST00000391166 PTPREP23469 700 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-754P-201ENST00000391166 FLIIQ13045 1269 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-754P-201ENST00000391166 PROX2Q3B8N5 592 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-754P-201ENST00000391166 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
RNU6-754P-201ENST00000391166 HOMEZQ8IX15 550 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-754P-201ENST00000391166 CLUAP1Q96AJ1 413 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-754P-201ENST00000391166 PNMA3Q9UL41 463 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-754P-201ENST00000391166 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RNU6-754P-201ENST00000391166 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
RNU6-754P-201ENST00000391166 TATDN2Q93075 761 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-754P-201ENST00000391166 DDX11L8A8MPP1 907 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-754P-201ENST00000391166 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-754P-201ENST00000391166 ARID3AQ99856 593 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-754P-201ENST00000391166 C1orf115Q9H7X2 142 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-754P-201ENST00000391166 LIMD1Q9UGP4 676 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-754P-201ENST00000391166 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RNU6-754P-201ENST00000391166 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-754P-201ENST00000391166 SNPHO15079 494 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-754P-201ENST00000391166 PACS2Q86VP3 889 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-754P-201ENST00000391166 SPIRE2Q8WWL2 714 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-754P-201ENST00000391166 KCNK17Q96T54 332 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-754P-201ENST00000391166 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
RNU6-754P-201ENST00000391166 APBB1O00213 710 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-754P-201ENST00000391166 CD46P15529 392 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-754P-201ENST00000391166 CLK2P49760 499 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RNU6-754P-201ENST00000391166 PSEN2P49810 448 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-754P-201ENST00000391166 RIC3Q7Z5B4 369 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-754P-201ENST00000391166 OTUD5Q96G74 571 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-754P-201ENST00000391166 UBTFP17480 764 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RNU6-754P-201ENST00000391166 NDUFV2P19404 249 aa6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.1 ms